Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3J7N3

Protein Details
Accession G3J7N3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
543-562QERADRKREELKKELERKAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-394KKAGRIGAIGGKKQAPPPSPPRAPSPPPPRSK
432-447PRAKKSGLGRIGGKPK
546-572ADRKREELKKELERKAAAGPAKKKRRF
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.833, nucl 11, cyto 10.5, cyto_mito 8.666, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG cmt:CCM_00153  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAGAKAWRPLRLPEDGGLPPLLVTFETKASEYCIQVTDMAHVWTESMERKAICIRAWGENTSIDPSDTPENMGRFLQTLQSALNETNPGHDEATVTLSPGSLTEAGEDGLQLLATCPLPGFEPLKWPFHLKKSSSVAVANEFAIPLVETLYSKSRQVDLLVQALKHKDAVIAKLSDKLEATGTGLEHVFTALSGRKKVTREAADDKIRGLAPFNKHKMNDDLQNNADQPSDVMDLVQRVFGGTAAVPDTSRNFTTGSLDGWWRGFSSTSSLPHRTGPPTQDQMAAPDTAIPSSPPDVNDVTMGDDTDDDGDNGDDEFQIQSTPPRLKPTKKDPPADEVVASSRQQSSTKAIKEEQHTSSQEPKKAGRIGAIGGKKQAPPPSPPRAPSPPPPRSKPAPVDDQETASETASDADETASLPDGAASSPPAATSPPRAKKSGLGRIGGKPKPAVHDADEEEDAAAAAAAAAHASAALKGGEAAAAGCSSSTAPKKRLGVIGKRIGGGGGAGEAATTGAAGDARRGRTATTTSRSASAGAAGQRETSQERADRKREELKKELERKAAAGPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.37
4 0.31
5 0.26
6 0.2
7 0.17
8 0.16
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.2
17 0.23
18 0.22
19 0.23
20 0.22
21 0.21
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.18
26 0.18
27 0.16
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.18
35 0.18
36 0.2
37 0.26
38 0.28
39 0.26
40 0.29
41 0.3
42 0.35
43 0.38
44 0.37
45 0.34
46 0.33
47 0.33
48 0.3
49 0.28
50 0.2
51 0.17
52 0.19
53 0.22
54 0.2
55 0.22
56 0.23
57 0.23
58 0.24
59 0.24
60 0.22
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.15
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.19
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.13
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.08
106 0.11
107 0.13
108 0.12
109 0.21
110 0.24
111 0.28
112 0.29
113 0.34
114 0.37
115 0.43
116 0.5
117 0.43
118 0.49
119 0.51
120 0.52
121 0.49
122 0.46
123 0.39
124 0.34
125 0.33
126 0.25
127 0.19
128 0.16
129 0.13
130 0.11
131 0.09
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.08
137 0.12
138 0.13
139 0.15
140 0.16
141 0.17
142 0.18
143 0.2
144 0.23
145 0.21
146 0.26
147 0.27
148 0.25
149 0.27
150 0.27
151 0.25
152 0.21
153 0.18
154 0.15
155 0.16
156 0.18
157 0.19
158 0.2
159 0.21
160 0.26
161 0.26
162 0.23
163 0.22
164 0.19
165 0.16
166 0.14
167 0.15
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.06
176 0.05
177 0.07
178 0.1
179 0.12
180 0.14
181 0.15
182 0.2
183 0.22
184 0.26
185 0.32
186 0.33
187 0.37
188 0.41
189 0.48
190 0.49
191 0.48
192 0.44
193 0.39
194 0.34
195 0.28
196 0.24
197 0.22
198 0.23
199 0.32
200 0.35
201 0.37
202 0.37
203 0.4
204 0.42
205 0.41
206 0.42
207 0.36
208 0.36
209 0.33
210 0.35
211 0.32
212 0.27
213 0.24
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.11
254 0.13
255 0.16
256 0.2
257 0.22
258 0.23
259 0.25
260 0.27
261 0.26
262 0.26
263 0.26
264 0.27
265 0.27
266 0.27
267 0.27
268 0.25
269 0.24
270 0.22
271 0.19
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.08
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.1
309 0.14
310 0.15
311 0.23
312 0.28
313 0.34
314 0.42
315 0.51
316 0.58
317 0.62
318 0.67
319 0.62
320 0.63
321 0.62
322 0.55
323 0.45
324 0.34
325 0.29
326 0.25
327 0.22
328 0.17
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.15
333 0.19
334 0.24
335 0.26
336 0.28
337 0.3
338 0.34
339 0.37
340 0.41
341 0.38
342 0.37
343 0.37
344 0.36
345 0.43
346 0.43
347 0.43
348 0.4
349 0.39
350 0.38
351 0.4
352 0.37
353 0.3
354 0.26
355 0.24
356 0.28
357 0.29
358 0.24
359 0.24
360 0.25
361 0.24
362 0.27
363 0.31
364 0.27
365 0.31
366 0.38
367 0.45
368 0.47
369 0.47
370 0.51
371 0.52
372 0.55
373 0.58
374 0.61
375 0.61
376 0.64
377 0.67
378 0.67
379 0.65
380 0.68
381 0.65
382 0.6
383 0.6
384 0.55
385 0.55
386 0.5
387 0.46
388 0.38
389 0.33
390 0.29
391 0.19
392 0.17
393 0.11
394 0.11
395 0.09
396 0.09
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.1
416 0.18
417 0.27
418 0.35
419 0.39
420 0.41
421 0.42
422 0.48
423 0.56
424 0.58
425 0.53
426 0.48
427 0.49
428 0.54
429 0.62
430 0.57
431 0.5
432 0.44
433 0.41
434 0.42
435 0.41
436 0.36
437 0.3
438 0.34
439 0.34
440 0.34
441 0.32
442 0.27
443 0.24
444 0.2
445 0.17
446 0.1
447 0.08
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.02
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.05
471 0.06
472 0.12
473 0.19
474 0.25
475 0.28
476 0.34
477 0.38
478 0.42
479 0.49
480 0.52
481 0.54
482 0.58
483 0.64
484 0.6
485 0.57
486 0.53
487 0.45
488 0.36
489 0.26
490 0.16
491 0.08
492 0.05
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.05
502 0.05
503 0.1
504 0.16
505 0.18
506 0.2
507 0.21
508 0.22
509 0.25
510 0.31
511 0.35
512 0.35
513 0.38
514 0.38
515 0.4
516 0.39
517 0.36
518 0.3
519 0.24
520 0.22
521 0.2
522 0.21
523 0.19
524 0.19
525 0.19
526 0.22
527 0.23
528 0.22
529 0.25
530 0.29
531 0.38
532 0.46
533 0.53
534 0.55
535 0.59
536 0.67
537 0.7
538 0.72
539 0.72
540 0.72
541 0.75
542 0.8
543 0.8
544 0.77
545 0.71
546 0.64
547 0.6
548 0.58
549 0.53
550 0.52
551 0.55
552 0.58