Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135USD9

Protein Details
Accession A0A135USD9    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-373NNGETTKPQPPRRRHPPRRDDFEAMHydrophilic
446-475LHSWKANRRGNYHRKRRRWARTRYIVDSTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
361-362RR
453-465RRGNYHRKRRRWA
613-622ARGKFKRRKV
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 10, mito 5.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHHLVQSHQWVSLKLLSEDTKVLQIVPNTTISLGKLGSFPSNLVLERPFHITYEIQDRRDGENFNRLRVVPTSEIHADALADLNAQDAEEEGTTLENVIAAPDGAEFELVDQESGNIVAHSRREIIDDAARQTLTAEEIEQLKQGNTDAGKEIIAKLLLSHTAIDQKTAFSLAKYKLLKTKKYIRRFMIQPLDPLTLGKWLLEEKDAGKVLEMREEMMGLLNSWANVHFGGVSPVDKPETVTLDGSGMLDKSEIGGRWLVVEDTGGLVTAAMAERMGILYPKDPEDVEEMEDATDIVKEDTNGVKPAEDTTAIIDDAAIEQAQETSTEATVQDSTTKPEEITADATVANNGETTKPQPPRRRHPPRRDDFEAMFAPTNTLTLIHPNSQPNLALLKYYNFDSTNPNPPYPLHPLATNLLPISWLQLLEPEEDVTYSTPPPEVSDAELHSWKANRRGNYHRKRRRWARTRYIVDSTRAGGFSGLVIASTMDTVSILRHTLPLLAGGAPIAVYSQSIEPLTELADCFSIARRAGWSSNPPAEAAGKSVQELERWEGSDDFPINPTLLLGANVQTSRAKRWQVLPGRTHPMMMGRGGADGYVFTGWKAVPAEGKVEARGKFKRRKVEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.29
3 0.28
4 0.28
5 0.3
6 0.27
7 0.26
8 0.23
9 0.23
10 0.21
11 0.22
12 0.22
13 0.23
14 0.23
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.18
19 0.18
20 0.15
21 0.14
22 0.13
23 0.15
24 0.17
25 0.17
26 0.16
27 0.17
28 0.19
29 0.19
30 0.2
31 0.2
32 0.2
33 0.21
34 0.26
35 0.23
36 0.21
37 0.24
38 0.22
39 0.23
40 0.32
41 0.36
42 0.32
43 0.35
44 0.37
45 0.39
46 0.43
47 0.43
48 0.36
49 0.4
50 0.4
51 0.4
52 0.41
53 0.37
54 0.36
55 0.34
56 0.36
57 0.3
58 0.29
59 0.32
60 0.29
61 0.3
62 0.27
63 0.25
64 0.18
65 0.15
66 0.15
67 0.09
68 0.08
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.05
104 0.06
105 0.09
106 0.1
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.16
111 0.17
112 0.2
113 0.24
114 0.26
115 0.26
116 0.27
117 0.26
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.14
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.12
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.15
154 0.15
155 0.17
156 0.16
157 0.1
158 0.16
159 0.17
160 0.24
161 0.25
162 0.27
163 0.34
164 0.41
165 0.45
166 0.47
167 0.56
168 0.58
169 0.66
170 0.72
171 0.69
172 0.7
173 0.68
174 0.7
175 0.68
176 0.6
177 0.53
178 0.48
179 0.45
180 0.37
181 0.34
182 0.25
183 0.18
184 0.16
185 0.13
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.1
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.16
197 0.15
198 0.18
199 0.18
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.09
320 0.08
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.11
328 0.13
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.09
341 0.16
342 0.24
343 0.32
344 0.41
345 0.49
346 0.59
347 0.69
348 0.78
349 0.82
350 0.86
351 0.88
352 0.89
353 0.89
354 0.85
355 0.79
356 0.68
357 0.63
358 0.53
359 0.43
360 0.34
361 0.25
362 0.2
363 0.14
364 0.13
365 0.08
366 0.08
367 0.06
368 0.1
369 0.12
370 0.14
371 0.17
372 0.19
373 0.2
374 0.2
375 0.2
376 0.17
377 0.17
378 0.14
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.12
386 0.14
387 0.19
388 0.23
389 0.31
390 0.32
391 0.31
392 0.3
393 0.31
394 0.34
395 0.35
396 0.35
397 0.26
398 0.24
399 0.26
400 0.27
401 0.27
402 0.23
403 0.15
404 0.12
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.12
427 0.11
428 0.13
429 0.15
430 0.16
431 0.19
432 0.2
433 0.19
434 0.19
435 0.22
436 0.23
437 0.3
438 0.33
439 0.35
440 0.41
441 0.51
442 0.6
443 0.68
444 0.76
445 0.77
446 0.82
447 0.88
448 0.92
449 0.92
450 0.91
451 0.91
452 0.91
453 0.91
454 0.88
455 0.84
456 0.81
457 0.73
458 0.65
459 0.57
460 0.47
461 0.39
462 0.32
463 0.25
464 0.18
465 0.14
466 0.11
467 0.1
468 0.08
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.06
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.1
512 0.13
513 0.12
514 0.13
515 0.14
516 0.17
517 0.2
518 0.24
519 0.29
520 0.33
521 0.37
522 0.36
523 0.35
524 0.33
525 0.33
526 0.28
527 0.25
528 0.22
529 0.18
530 0.17
531 0.21
532 0.2
533 0.2
534 0.22
535 0.23
536 0.23
537 0.24
538 0.25
539 0.23
540 0.23
541 0.27
542 0.25
543 0.22
544 0.2
545 0.2
546 0.18
547 0.17
548 0.15
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.1
554 0.13
555 0.13
556 0.15
557 0.18
558 0.2
559 0.25
560 0.32
561 0.35
562 0.36
563 0.43
564 0.52
565 0.57
566 0.64
567 0.65
568 0.66
569 0.69
570 0.65
571 0.59
572 0.5
573 0.46
574 0.39
575 0.32
576 0.27
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.17
581 0.12
582 0.09
583 0.1
584 0.08
585 0.08
586 0.07
587 0.09
588 0.09
589 0.13
590 0.14
591 0.15
592 0.18
593 0.19
594 0.22
595 0.25
596 0.27
597 0.28
598 0.32
599 0.35
600 0.38
601 0.46
602 0.53
603 0.58
604 0.64