FuNGI

A0A135SE95

Protein Details

Accession

A0A135SE95

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-37	SPATNGHKSDKKIKKDKKEKKRLREEGDDAAE	Basic
77-131	NTNGEPSSEKKKSKKDKHRKSVGEAEQDGSDAERKEKKDKKKKRKLEQKAIEEAL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-44	KSDKKIKKDKKEKKRLREEGDDAAEERKHKRT
85-101	EKKKSKKDKHRKSVGEA
106-122	SDAERKEKKDKKKKRKL
419-428	RRRTGKSGGI
430-433	SKER

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MASTDSPATNGHKSDKKIKKDKKEKKRLREEGDDAAEERKHKRTKSLGVTKSDANDDDEQSPQASQDLSMDALATSNTNGEPSSEKKKSKKDKHRKSVGEAEQDGSDAERKEKKDKKKKRKLEQKAIEEALEDTAEPPASEEKEKKSNKAASPELIADADAMDVDSPAKTKSTGRVHQPPDAPSKPQFPFYTQTVSLYLPIYPIGWDTPCTAAATQHLEPLVNRYVPHLKGVLLAFRNVAVSEQPGRRYAATSDSEHCDLASVDEYAVGFGYVTVDVDLFVPRRGAWMEGSINLENEGHVGVVCWGKFNASIESSRLPPEWRWIHAGSAEAASYVADPFDVDNTDAAAEDEHGAVRQIYTTGFWVDGAGNKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEKAAGQADAEQERRRRTGKSGGILSKERRRMPEFSVTKFGEVEDEEDKALRNDVWKMTEPVTDNEAGEGAEKEAFTGISAEEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.59
3	0.65
4	0.72
5	0.79
6	0.82
7	0.87
8	0.92
9	0.93
10	0.95
11	0.95
12	0.95
13	0.96
14	0.95
15	0.92
16	0.91
17	0.85
18	0.82
19	0.76
20	0.67
21	0.57
22	0.5
23	0.44
24	0.38
25	0.37
26	0.37
27	0.39
28	0.4
29	0.48
30	0.53
31	0.6
32	0.68
33	0.74
34	0.72
35	0.72
36	0.73
37	0.67
38	0.61
39	0.54
40	0.44
41	0.39
42	0.35
43	0.31
44	0.3
45	0.28
46	0.26
47	0.23
48	0.22
49	0.17
50	0.15
51	0.12
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.07
62	0.06
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.08
67	0.09
68	0.12
69	0.17
70	0.27
71	0.33
72	0.4
73	0.48
74	0.59
75	0.69
76	0.76
77	0.83
78	0.84
79	0.88
80	0.92
81	0.95
82	0.91
83	0.87
84	0.87
85	0.83
86	0.81
87	0.71
88	0.61
89	0.5
90	0.44
91	0.36
92	0.26
93	0.21
94	0.13
95	0.17
96	0.21
97	0.24
98	0.34
99	0.43
100	0.53
101	0.61
102	0.72
103	0.78
104	0.84
105	0.91
106	0.92
107	0.95
108	0.95
109	0.95
110	0.94
111	0.91
112	0.87
113	0.78
114	0.67
115	0.56
116	0.46
117	0.35
118	0.25
119	0.16
120	0.09
121	0.08
122	0.08
123	0.07
124	0.07
125	0.09
126	0.11
127	0.15
128	0.18
129	0.22
130	0.32
131	0.35
132	0.38
133	0.44
134	0.5
135	0.5
136	0.54
137	0.53
138	0.45
139	0.45
140	0.42
141	0.34
142	0.26
143	0.22
144	0.14
145	0.11
146	0.08
147	0.05
148	0.05
149	0.03
150	0.03
151	0.04
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.09
158	0.18
159	0.26
160	0.31
161	0.39
162	0.48
163	0.51
164	0.56
165	0.58
166	0.53
167	0.53
168	0.5
169	0.45
170	0.39
171	0.42
172	0.37
173	0.39
174	0.36
175	0.31
176	0.33
177	0.32
178	0.35
179	0.27
180	0.28
181	0.24
182	0.23
183	0.21
184	0.17
185	0.15
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.14
205	0.13
206	0.13
207	0.16
208	0.17
209	0.13
210	0.12
211	0.14
212	0.19
213	0.19
214	0.21
215	0.17
216	0.15
217	0.17
218	0.18
219	0.18
220	0.14
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.09
226	0.09
227	0.05
228	0.07
229	0.11
230	0.13
231	0.14
232	0.15
233	0.16
234	0.16
235	0.17
236	0.16
237	0.17
238	0.18
239	0.19
240	0.2
241	0.22
242	0.23
243	0.21
244	0.2
245	0.15
246	0.12
247	0.11
248	0.09
249	0.06
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.04
256	0.03
257	0.03
258	0.04
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.04
264	0.05
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.09
273	0.08
274	0.11
275	0.12
276	0.13
277	0.17
278	0.15
279	0.15
280	0.14
281	0.14
282	0.1
283	0.09
284	0.08
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.05
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.07
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.13
299	0.14
300	0.16
301	0.17
302	0.18
303	0.17
304	0.17
305	0.16
306	0.24
307	0.25
308	0.25
309	0.29
310	0.28
311	0.28
312	0.27
313	0.27
314	0.19
315	0.17
316	0.14
317	0.09
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.12
354	0.14
355	0.15
356	0.17
357	0.17
358	0.22
359	0.25
360	0.31
361	0.35
362	0.41
363	0.48
364	0.53
365	0.58
366	0.63
367	0.62
368	0.62
369	0.57
370	0.49
371	0.41
372	0.34
373	0.3
374	0.21
375	0.19
376	0.12
377	0.1
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.05
398	0.07
399	0.11
400	0.16
401	0.19
402	0.24
403	0.29
404	0.34
405	0.39
406	0.41
407	0.4
408	0.42
409	0.48
410	0.51
411	0.54
412	0.58
413	0.59
414	0.62
415	0.65
416	0.67
417	0.66
418	0.66
419	0.63
420	0.61
421	0.6
422	0.59
423	0.58
424	0.61
425	0.57
426	0.55
427	0.58
428	0.52
429	0.49
430	0.45
431	0.39
432	0.31
433	0.26
434	0.24
435	0.17
436	0.17
437	0.16
438	0.17
439	0.17
440	0.15
441	0.16
442	0.14
443	0.16
444	0.2
445	0.23
446	0.28
447	0.31
448	0.34
449	0.34
450	0.38
451	0.37
452	0.35
453	0.36
454	0.32
455	0.28
456	0.25
457	0.23
458	0.18
459	0.17
460	0.15
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.1

A0A135SE95

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer