Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135TN67

Protein Details
Accession A0A135TN67    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-391ASGSTQKRKYSCRRKGKAADSGRGVTSPSTKRRKVQPKHVSELPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-381RRKGKAADSGRGVTSPSTKRRKV
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Amino Acid Sequences MAEEEFEIDVYGDAPQDHQDGNAENYDGANGHADNHQEQHDQHEHNEDQQKHEQQEEYHDQQEAPAPQQGVKRKGDDRPIDPGATTALMVSDLNWWNTDDDIRGYARAGHCEDELKDITFSEHKVNGKSKGQAYIEFITQQAATAAKHAFESTDSAQGVPKKYQVTYSNPHVNPFRTLPKDAPNRAGKDQGSRPGGNYNNNQGSSMGGGDFRGNGGYRGRGGFNGQRGGMNQGGFNRNFSGGMGGGFNNNNMGGGGFNNGMGGGNFGGGGFQRGGGFGGGMRGGPGMRGGRGGMHNPMGGMNMGPMGGMPNMGMPNMGMMGGGMPGMNPPSLDSLQQSQNPPISQLASGSTQKRKYSCRRKGKAADSGRGVTSPSTKRRKVQPKHVSELPKPVITSEVGRWTKKRGLEFTTSAPQPPAAARFGARMPPHYSADSLPGFQGMPQQFNPAFFGGNQGGGNDWGNPHGAKRPRPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.1
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.15
7 0.16
8 0.19
9 0.2
10 0.19
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.16
21 0.17
22 0.2
23 0.22
24 0.23
25 0.23
26 0.3
27 0.35
28 0.35
29 0.35
30 0.4
31 0.38
32 0.43
33 0.52
34 0.45
35 0.44
36 0.51
37 0.55
38 0.49
39 0.52
40 0.47
41 0.4
42 0.47
43 0.49
44 0.45
45 0.4
46 0.39
47 0.35
48 0.33
49 0.38
50 0.31
51 0.25
52 0.25
53 0.23
54 0.26
55 0.32
56 0.39
57 0.4
58 0.42
59 0.46
60 0.48
61 0.54
62 0.6
63 0.61
64 0.56
65 0.57
66 0.57
67 0.51
68 0.45
69 0.39
70 0.3
71 0.24
72 0.2
73 0.11
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.17
93 0.18
94 0.2
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.23
99 0.23
100 0.23
101 0.23
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.19
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.21
110 0.22
111 0.28
112 0.32
113 0.36
114 0.38
115 0.42
116 0.4
117 0.42
118 0.41
119 0.39
120 0.39
121 0.35
122 0.32
123 0.27
124 0.24
125 0.18
126 0.17
127 0.14
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.13
139 0.12
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.19
144 0.22
145 0.23
146 0.21
147 0.23
148 0.21
149 0.21
150 0.27
151 0.29
152 0.32
153 0.35
154 0.42
155 0.47
156 0.46
157 0.49
158 0.46
159 0.43
160 0.39
161 0.37
162 0.37
163 0.31
164 0.33
165 0.33
166 0.39
167 0.46
168 0.45
169 0.49
170 0.48
171 0.48
172 0.48
173 0.5
174 0.42
175 0.4
176 0.42
177 0.41
178 0.4
179 0.36
180 0.35
181 0.36
182 0.38
183 0.37
184 0.36
185 0.35
186 0.35
187 0.34
188 0.34
189 0.27
190 0.24
191 0.19
192 0.17
193 0.1
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.13
209 0.15
210 0.17
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.18
217 0.15
218 0.13
219 0.14
220 0.18
221 0.17
222 0.18
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.1
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.08
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.17
322 0.21
323 0.26
324 0.27
325 0.26
326 0.29
327 0.28
328 0.28
329 0.25
330 0.22
331 0.18
332 0.16
333 0.16
334 0.16
335 0.2
336 0.25
337 0.3
338 0.34
339 0.38
340 0.42
341 0.49
342 0.56
343 0.63
344 0.68
345 0.73
346 0.75
347 0.82
348 0.87
349 0.86
350 0.85
351 0.81
352 0.77
353 0.71
354 0.66
355 0.56
356 0.46
357 0.39
358 0.3
359 0.3
360 0.31
361 0.36
362 0.43
363 0.47
364 0.53
365 0.63
366 0.73
367 0.75
368 0.78
369 0.8
370 0.79
371 0.82
372 0.83
373 0.8
374 0.73
375 0.73
376 0.66
377 0.58
378 0.49
379 0.42
380 0.36
381 0.3
382 0.29
383 0.23
384 0.29
385 0.31
386 0.35
387 0.36
388 0.4
389 0.45
390 0.46
391 0.5
392 0.46
393 0.47
394 0.51
395 0.53
396 0.52
397 0.55
398 0.51
399 0.45
400 0.4
401 0.34
402 0.28
403 0.27
404 0.25
405 0.18
406 0.19
407 0.18
408 0.2
409 0.23
410 0.28
411 0.27
412 0.29
413 0.32
414 0.35
415 0.37
416 0.36
417 0.35
418 0.3
419 0.34
420 0.32
421 0.27
422 0.23
423 0.2
424 0.19
425 0.18
426 0.25
427 0.2
428 0.23
429 0.23
430 0.3
431 0.3
432 0.31
433 0.34
434 0.26
435 0.25
436 0.2
437 0.26
438 0.2
439 0.21
440 0.2
441 0.17
442 0.17
443 0.18
444 0.19
445 0.14
446 0.14
447 0.12
448 0.15
449 0.15
450 0.17
451 0.24
452 0.31