Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A135UD24

Protein Details
Accession A0A135UD24    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-48TVNDRMRVTKTRPRPSPNKPTDGLHydrophilic
82-105FEESPRTSRKSPRKTPTKASDGRGHydrophilic
116-143TTTARDSAPKRGRGRPRKVEASPRKAKHBasic
162-183KTAPKTTPAKPRGRPPKTKADSHydrophilic
644-669SSPLVFSKRKSKKPAAEPSRRSKRVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-142SRKSPRKTPTKASDGRGARRAGTKRKSTTTARDSAPKRGRGRPRKVEASPRKAK
170-178AKPRGRPPK
651-667KRKSKKPAAEPSRRSKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MASKRQATTSRPRRDSASAAGSHSTVNDRMRVTKTRPRPSPNKPTDGLRSKTRSSTRSHIQSYVGMESSDEEDSVADEFEDFEESPRTSRKSPRKTPTKASDGRGARRAGTKRKSTTTARDSAPKRGRGRPRKVEASPRKAKHDSSDESDNIGSEDELSDAKTAPKTTPAKPRGRPPKTKADSEMNNTTSVIIPNWLDPQIAHSIWVQIFQFAATSGDEQDTLDVNWILHTARACRQFADPALTVLYKCPPIRDETKAYGLADLLEKPPSQTAFNYRAKIEALHIDVRLVSLRGLTSPLKLMQNLPRLKEVLLVHGYDQAPFRKLKESIKWTYPDELFQAFEVSPTADAEAGEKTAITRLQSWQWSSRLMDKNWEASLARLQEVHQMPSFVSLRKLKFVNYQMPSIRLDKDPETNPELLAEDQKSVSLLANSILALPNLEDLVFESSTIITTPLFPMLPTKLKRLELVNCAEVIADDFSLFLVTKGHQLQSLVLNHNRSLNLSFLTVLGSACPHLKELRMNLQYFSLLESSNDRLPSYDTLLLPNEVPSWPASLQVVHLENLRHWSSGAADTAAAEAFLQSLIDSAKDLPDLRHISIKAMLSISWRSRVELRKSWQEKFEKIFLRQSPNPRPHFTLQKPLPVESSPLVFSKRKSKKPAAEPSRRSKRVVSHASGTSSRASSTSRGLRGQLQKPKSYAEPDSDEFDSDSDVEMEEPSEDSNQGETDEAAEGAAADTFVQGMCNVVDIHIDNQKPREYQYSMDDFLNDERDFEVDDEWDSDMDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.63
3 0.59
4 0.57
5 0.48
6 0.46
7 0.45
8 0.4
9 0.35
10 0.31
11 0.27
12 0.23
13 0.23
14 0.25
15 0.26
16 0.31
17 0.36
18 0.43
19 0.47
20 0.52
21 0.6
22 0.66
23 0.72
24 0.77
25 0.81
26 0.84
27 0.88
28 0.87
29 0.84
30 0.77
31 0.75
32 0.76
33 0.75
34 0.7
35 0.68
36 0.65
37 0.61
38 0.67
39 0.67
40 0.62
41 0.59
42 0.63
43 0.63
44 0.66
45 0.66
46 0.6
47 0.55
48 0.55
49 0.51
50 0.46
51 0.37
52 0.27
53 0.23
54 0.21
55 0.21
56 0.17
57 0.14
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.13
71 0.14
72 0.17
73 0.22
74 0.26
75 0.29
76 0.4
77 0.49
78 0.57
79 0.66
80 0.74
81 0.8
82 0.83
83 0.88
84 0.87
85 0.87
86 0.83
87 0.77
88 0.76
89 0.73
90 0.72
91 0.68
92 0.6
93 0.52
94 0.54
95 0.57
96 0.58
97 0.59
98 0.62
99 0.62
100 0.67
101 0.71
102 0.69
103 0.71
104 0.69
105 0.67
106 0.61
107 0.64
108 0.6
109 0.64
110 0.65
111 0.64
112 0.62
113 0.65
114 0.72
115 0.74
116 0.82
117 0.82
118 0.82
119 0.82
120 0.83
121 0.85
122 0.84
123 0.84
124 0.83
125 0.77
126 0.77
127 0.72
128 0.68
129 0.65
130 0.63
131 0.57
132 0.53
133 0.56
134 0.48
135 0.46
136 0.44
137 0.36
138 0.27
139 0.22
140 0.16
141 0.09
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.11
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.23
153 0.27
154 0.33
155 0.43
156 0.5
157 0.58
158 0.62
159 0.72
160 0.74
161 0.79
162 0.82
163 0.78
164 0.8
165 0.76
166 0.76
167 0.71
168 0.69
169 0.66
170 0.62
171 0.63
172 0.53
173 0.49
174 0.43
175 0.38
176 0.3
177 0.24
178 0.18
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.11
186 0.14
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.18
192 0.17
193 0.2
194 0.17
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.07
200 0.08
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.11
219 0.17
220 0.23
221 0.23
222 0.24
223 0.26
224 0.27
225 0.28
226 0.3
227 0.25
228 0.2
229 0.21
230 0.2
231 0.18
232 0.16
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.21
239 0.26
240 0.3
241 0.34
242 0.33
243 0.37
244 0.37
245 0.36
246 0.31
247 0.26
248 0.22
249 0.17
250 0.14
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.19
260 0.26
261 0.32
262 0.33
263 0.31
264 0.31
265 0.3
266 0.29
267 0.25
268 0.2
269 0.18
270 0.18
271 0.18
272 0.16
273 0.16
274 0.15
275 0.14
276 0.11
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.14
286 0.15
287 0.15
288 0.19
289 0.23
290 0.31
291 0.33
292 0.33
293 0.32
294 0.32
295 0.31
296 0.33
297 0.27
298 0.23
299 0.22
300 0.2
301 0.19
302 0.23
303 0.23
304 0.18
305 0.2
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.21
312 0.26
313 0.32
314 0.38
315 0.41
316 0.45
317 0.47
318 0.44
319 0.46
320 0.4
321 0.33
322 0.27
323 0.23
324 0.19
325 0.16
326 0.15
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.14
348 0.17
349 0.19
350 0.21
351 0.22
352 0.23
353 0.22
354 0.29
355 0.31
356 0.29
357 0.32
358 0.3
359 0.32
360 0.29
361 0.3
362 0.21
363 0.16
364 0.19
365 0.15
366 0.14
367 0.11
368 0.12
369 0.18
370 0.19
371 0.2
372 0.16
373 0.16
374 0.15
375 0.19
376 0.19
377 0.13
378 0.16
379 0.19
380 0.19
381 0.22
382 0.23
383 0.21
384 0.26
385 0.3
386 0.35
387 0.32
388 0.35
389 0.33
390 0.34
391 0.35
392 0.3
393 0.27
394 0.2
395 0.21
396 0.18
397 0.22
398 0.22
399 0.24
400 0.25
401 0.23
402 0.22
403 0.2
404 0.19
405 0.15
406 0.15
407 0.12
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.08
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.11
445 0.18
446 0.19
447 0.23
448 0.26
449 0.27
450 0.3
451 0.32
452 0.33
453 0.32
454 0.34
455 0.3
456 0.26
457 0.25
458 0.22
459 0.18
460 0.14
461 0.09
462 0.06
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.09
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.13
476 0.14
477 0.18
478 0.22
479 0.23
480 0.24
481 0.25
482 0.25
483 0.27
484 0.25
485 0.21
486 0.18
487 0.15
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.09
492 0.1
493 0.09
494 0.08
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.11
503 0.14
504 0.18
505 0.27
506 0.3
507 0.31
508 0.3
509 0.3
510 0.29
511 0.26
512 0.23
513 0.15
514 0.1
515 0.1
516 0.12
517 0.14
518 0.16
519 0.16
520 0.15
521 0.14
522 0.16
523 0.18
524 0.19
525 0.2
526 0.18
527 0.19
528 0.21
529 0.21
530 0.18
531 0.17
532 0.14
533 0.11
534 0.11
535 0.09
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.11
542 0.15
543 0.16
544 0.13
545 0.15
546 0.15
547 0.15
548 0.2
549 0.2
550 0.16
551 0.15
552 0.15
553 0.15
554 0.16
555 0.16
556 0.11
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.1
561 0.07
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.03
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.05
572 0.06
573 0.07
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.17
578 0.2
579 0.21
580 0.26
581 0.26
582 0.26
583 0.3
584 0.3
585 0.23
586 0.21
587 0.2
588 0.17
589 0.23
590 0.23
591 0.25
592 0.24
593 0.25
594 0.31
595 0.39
596 0.44
597 0.47
598 0.51
599 0.56
600 0.62
601 0.64
602 0.66
603 0.63
604 0.61
605 0.58
606 0.6
607 0.55
608 0.53
609 0.57
610 0.54
611 0.57
612 0.57
613 0.62
614 0.64
615 0.67
616 0.69
617 0.65
618 0.66
619 0.63
620 0.68
621 0.62
622 0.63
623 0.57
624 0.6
625 0.57
626 0.52
627 0.49
628 0.4
629 0.39
630 0.29
631 0.28
632 0.21
633 0.21
634 0.24
635 0.24
636 0.26
637 0.34
638 0.42
639 0.49
640 0.57
641 0.65
642 0.7
643 0.78
644 0.86
645 0.86
646 0.87
647 0.87
648 0.89
649 0.9
650 0.83
651 0.76
652 0.71
653 0.69
654 0.68
655 0.69
656 0.63
657 0.58
658 0.58
659 0.6
660 0.55
661 0.48
662 0.4
663 0.32
664 0.27
665 0.22
666 0.21
667 0.18
668 0.25
669 0.3
670 0.32
671 0.33
672 0.35
673 0.43
674 0.5
675 0.56
676 0.58
677 0.57
678 0.58
679 0.58
680 0.6
681 0.56
682 0.52
683 0.47
684 0.44
685 0.44
686 0.41
687 0.44
688 0.41
689 0.37
690 0.31
691 0.27
692 0.22
693 0.16
694 0.15
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.09
699 0.09
700 0.08
701 0.08
702 0.08
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.1
711 0.1
712 0.11
713 0.1
714 0.08
715 0.08
716 0.07
717 0.07
718 0.07
719 0.05
720 0.04
721 0.04
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.08
730 0.08
731 0.1
732 0.11
733 0.15
734 0.2
735 0.22
736 0.24
737 0.29
738 0.34
739 0.34
740 0.35
741 0.4
742 0.36
743 0.37
744 0.42
745 0.45
746 0.42
747 0.41
748 0.38
749 0.33
750 0.33
751 0.35
752 0.27
753 0.21
754 0.19
755 0.18
756 0.2
757 0.18
758 0.17
759 0.12
760 0.13
761 0.14
762 0.14
763 0.13