Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IKB6

Protein Details
Accession A0A100IKB6    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MPREKVKRGRRATEKANKEASKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-25EKVKRGRRATEKANKEASKRKR
663-701RRRGEWAAKAKGLDVGGEGGQKPKSKIELARERFAAKKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
Amino Acid Sequences MPREKVKRGRRATEKANKEASKRKRDDAPEDVVPKRVKPSEDETNDIVNGADYIALDDGQQQDEEMAQTGDMPFYGLLDPEEQEYFSRANEVLETNQFGDAEERRVFVESVYKEAEGKELKISCSQSCSRLMEKLISMSDIRQIRRLFNKFIGHFLHLVQHRFASHCCETLFIHAAPGVSQKPSKKASKTDAEDGDEPEPELSLAEMFMKVIEELEGNWGYLLTERFASHTIRVLLLVLAGEPVDLSLSDSVVASRKKERHGVLNEVQDENPVAQKRSVPESFEGTLKKVMQDMVSVLDDTYLRALATHPVGNPVLQVLVYLELSHFGKASAKDPKSIIRRLIPDDTFEEGTESTTFIRGLLYDPVGSRLLETIVRYMPGKLFKGLYKNFLRDQLRSLSRNITAGYVVLKVLERLGKDDLENAVELLVPQIPNLIERSRVIVPKTLVERCIVRGVDTTPIARSLETAYDSDPAKRLAQMLTLEDTTTPSEPQPQQNQNEDQDEDHPQPPAMPNFDPDNANANINTNPKGAKLHNSLFVQTILTAPGPLSALVYSSLLSQTPESLLTIAKDPTASHVIQKSLTLPTSTPQFRRQFTGRFTGHLEELALDSSGSRVVDALWHATKDVFFVKERMAQELARSEMALRDSFVGRAVWRNWSMDLYKRRRGEWAAKAKGLDVGGEGGQKPKSKIELARERFAAKKAESEKMKNGEDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.84
3 0.85
4 0.79
5 0.77
6 0.78
7 0.77
8 0.78
9 0.75
10 0.73
11 0.72
12 0.76
13 0.76
14 0.73
15 0.7
16 0.67
17 0.68
18 0.63
19 0.61
20 0.54
21 0.48
22 0.48
23 0.46
24 0.4
25 0.39
26 0.45
27 0.49
28 0.52
29 0.54
30 0.5
31 0.48
32 0.46
33 0.4
34 0.32
35 0.21
36 0.17
37 0.12
38 0.09
39 0.05
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.06
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.14
72 0.14
73 0.12
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.16
79 0.17
80 0.19
81 0.21
82 0.19
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.19
87 0.18
88 0.2
89 0.19
90 0.19
91 0.18
92 0.21
93 0.2
94 0.17
95 0.23
96 0.19
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.22
101 0.22
102 0.27
103 0.21
104 0.22
105 0.24
106 0.24
107 0.25
108 0.3
109 0.33
110 0.28
111 0.33
112 0.34
113 0.31
114 0.35
115 0.37
116 0.35
117 0.36
118 0.36
119 0.33
120 0.32
121 0.31
122 0.26
123 0.23
124 0.21
125 0.18
126 0.23
127 0.25
128 0.25
129 0.28
130 0.29
131 0.34
132 0.43
133 0.47
134 0.45
135 0.47
136 0.54
137 0.48
138 0.52
139 0.49
140 0.42
141 0.38
142 0.34
143 0.34
144 0.3
145 0.31
146 0.26
147 0.24
148 0.23
149 0.24
150 0.24
151 0.24
152 0.22
153 0.23
154 0.22
155 0.22
156 0.22
157 0.24
158 0.27
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.15
164 0.18
165 0.15
166 0.14
167 0.18
168 0.2
169 0.25
170 0.32
171 0.39
172 0.41
173 0.47
174 0.52
175 0.58
176 0.61
177 0.62
178 0.59
179 0.56
180 0.53
181 0.48
182 0.41
183 0.32
184 0.26
185 0.19
186 0.15
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.1
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.15
221 0.14
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.1
240 0.11
241 0.13
242 0.2
243 0.24
244 0.27
245 0.34
246 0.35
247 0.4
248 0.44
249 0.5
250 0.48
251 0.5
252 0.49
253 0.44
254 0.41
255 0.32
256 0.28
257 0.2
258 0.19
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.17
264 0.23
265 0.24
266 0.22
267 0.22
268 0.25
269 0.26
270 0.27
271 0.26
272 0.2
273 0.22
274 0.2
275 0.19
276 0.16
277 0.15
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.1
302 0.08
303 0.06
304 0.06
305 0.04
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.04
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.09
316 0.1
317 0.14
318 0.21
319 0.22
320 0.24
321 0.25
322 0.32
323 0.34
324 0.37
325 0.36
326 0.32
327 0.34
328 0.36
329 0.4
330 0.34
331 0.3
332 0.29
333 0.28
334 0.23
335 0.2
336 0.17
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.09
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.17
371 0.24
372 0.25
373 0.29
374 0.29
375 0.32
376 0.32
377 0.38
378 0.38
379 0.32
380 0.33
381 0.33
382 0.35
383 0.33
384 0.33
385 0.29
386 0.27
387 0.28
388 0.25
389 0.18
390 0.14
391 0.12
392 0.11
393 0.09
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.09
400 0.08
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.12
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.14
425 0.16
426 0.19
427 0.19
428 0.21
429 0.22
430 0.25
431 0.29
432 0.27
433 0.24
434 0.24
435 0.24
436 0.21
437 0.26
438 0.21
439 0.17
440 0.17
441 0.17
442 0.19
443 0.19
444 0.18
445 0.13
446 0.15
447 0.14
448 0.12
449 0.12
450 0.1
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.13
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.17
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.15
472 0.13
473 0.12
474 0.11
475 0.09
476 0.17
477 0.2
478 0.27
479 0.35
480 0.4
481 0.44
482 0.5
483 0.54
484 0.5
485 0.5
486 0.44
487 0.37
488 0.32
489 0.31
490 0.29
491 0.26
492 0.23
493 0.19
494 0.2
495 0.22
496 0.22
497 0.22
498 0.19
499 0.2
500 0.23
501 0.26
502 0.25
503 0.22
504 0.25
505 0.22
506 0.22
507 0.19
508 0.18
509 0.19
510 0.21
511 0.22
512 0.18
513 0.17
514 0.18
515 0.22
516 0.22
517 0.26
518 0.3
519 0.31
520 0.37
521 0.38
522 0.38
523 0.35
524 0.33
525 0.26
526 0.19
527 0.17
528 0.11
529 0.1
530 0.09
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.08
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.08
543 0.08
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.1
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.11
558 0.15
559 0.19
560 0.18
561 0.2
562 0.23
563 0.24
564 0.24
565 0.25
566 0.23
567 0.22
568 0.23
569 0.2
570 0.17
571 0.18
572 0.26
573 0.3
574 0.32
575 0.37
576 0.43
577 0.44
578 0.5
579 0.54
580 0.52
581 0.52
582 0.58
583 0.49
584 0.45
585 0.47
586 0.43
587 0.38
588 0.31
589 0.27
590 0.18
591 0.17
592 0.15
593 0.11
594 0.08
595 0.07
596 0.07
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.09
603 0.1
604 0.15
605 0.16
606 0.16
607 0.17
608 0.18
609 0.18
610 0.18
611 0.2
612 0.17
613 0.17
614 0.19
615 0.22
616 0.28
617 0.29
618 0.3
619 0.3
620 0.27
621 0.29
622 0.32
623 0.31
624 0.25
625 0.24
626 0.2
627 0.21
628 0.23
629 0.2
630 0.16
631 0.16
632 0.17
633 0.17
634 0.18
635 0.16
636 0.15
637 0.21
638 0.22
639 0.27
640 0.28
641 0.3
642 0.3
643 0.33
644 0.34
645 0.37
646 0.45
647 0.47
648 0.53
649 0.54
650 0.54
651 0.57
652 0.61
653 0.62
654 0.62
655 0.65
656 0.64
657 0.64
658 0.63
659 0.56
660 0.52
661 0.42
662 0.32
663 0.22
664 0.17
665 0.15
666 0.17
667 0.17
668 0.18
669 0.22
670 0.25
671 0.26
672 0.29
673 0.32
674 0.36
675 0.43
676 0.49
677 0.57
678 0.59
679 0.64
680 0.62
681 0.61
682 0.59
683 0.56
684 0.52
685 0.43
686 0.45
687 0.43
688 0.49
689 0.53
690 0.56
691 0.61
692 0.61