Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IBJ5

Protein Details
Accession A0A100IBJ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-234LESVVVNKRRPKKRKLGRKMTSAAHydrophilic
508-532YSCSSSTRSPLRPHRPPPLRRRLVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-229KRRPKKRKLGRK
320-324RIRRL
Subcellular Location(s) cyto 7, nucl 6, plas 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040453  Mnd1_HTH  
IPR022793  Rrn10  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF03962  Mnd1  
Amino Acid Sequences MSYGKSLALSQNSFVRPPTPDVVEAQEQDEFGARRQKRQATVYDAVAGRVNHHGFLPSVPFSSKYRDTASSSTRPVRPEEVLFRRQNAPQRYEENDFYFAHEALPPGCPLPSSELLEAIHAYSADYYDHATIDGGRDDYQSMDETALIAMGILMEEMAKESLGETGDMVLVEGEEIPTDELPLVPQLSRTMRRKRANTGQSSTMASSGDELESVVVNKRRPKKRKLGRKMTSAAELDMEDDERWSAKQALIVSHLRATGTCHTLKDLEKMIPSVASINGMQVKEYIQELTDEGRIRVEKIGSGNWYWCFGGEEKKEREERIRRLRREVDRVRGSWEDAEARLSARKQARVQEEAEEAHGDGDGDGNGNGNGEEERRRLMEQKAVLERETHQLQGEWMALATSPEGKSLPQIKEETEEYRRLAHQWTDNIYILEGAVCAAAGVGTGPGPVERLTLLLLLLLLLSLLPLRPTDTSGRFIGRLIDGVWTENFPAVSIAFSSPSTLEIWTVYSCSSSTRSPLRPHRPPPLRRRLVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.29
4 0.33
5 0.35
6 0.31
7 0.31
8 0.32
9 0.37
10 0.38
11 0.36
12 0.32
13 0.29
14 0.25
15 0.23
16 0.26
17 0.21
18 0.19
19 0.28
20 0.28
21 0.34
22 0.43
23 0.5
24 0.53
25 0.58
26 0.61
27 0.61
28 0.63
29 0.58
30 0.55
31 0.48
32 0.42
33 0.39
34 0.32
35 0.25
36 0.28
37 0.27
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.18
42 0.2
43 0.23
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.21
48 0.22
49 0.29
50 0.31
51 0.3
52 0.33
53 0.35
54 0.4
55 0.43
56 0.48
57 0.48
58 0.5
59 0.54
60 0.53
61 0.51
62 0.5
63 0.48
64 0.44
65 0.43
66 0.47
67 0.48
68 0.53
69 0.53
70 0.53
71 0.53
72 0.54
73 0.57
74 0.55
75 0.52
76 0.49
77 0.52
78 0.53
79 0.55
80 0.54
81 0.48
82 0.45
83 0.4
84 0.37
85 0.34
86 0.28
87 0.24
88 0.21
89 0.18
90 0.15
91 0.16
92 0.13
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.16
98 0.19
99 0.21
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.22
105 0.16
106 0.12
107 0.08
108 0.08
109 0.06
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.1
174 0.15
175 0.23
176 0.31
177 0.39
178 0.48
179 0.56
180 0.6
181 0.65
182 0.71
183 0.72
184 0.71
185 0.66
186 0.6
187 0.54
188 0.51
189 0.43
190 0.34
191 0.25
192 0.17
193 0.13
194 0.1
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.09
202 0.12
203 0.15
204 0.22
205 0.32
206 0.42
207 0.49
208 0.58
209 0.65
210 0.72
211 0.81
212 0.85
213 0.87
214 0.84
215 0.84
216 0.8
217 0.71
218 0.65
219 0.54
220 0.44
221 0.33
222 0.26
223 0.18
224 0.13
225 0.12
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.16
238 0.17
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.14
245 0.13
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.15
250 0.18
251 0.19
252 0.19
253 0.18
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.12
259 0.11
260 0.09
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.07
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.15
292 0.16
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.19
298 0.21
299 0.28
300 0.28
301 0.33
302 0.36
303 0.36
304 0.44
305 0.45
306 0.51
307 0.55
308 0.63
309 0.61
310 0.67
311 0.74
312 0.72
313 0.74
314 0.71
315 0.69
316 0.65
317 0.62
318 0.59
319 0.51
320 0.45
321 0.35
322 0.3
323 0.22
324 0.16
325 0.17
326 0.13
327 0.12
328 0.14
329 0.13
330 0.18
331 0.21
332 0.26
333 0.28
334 0.35
335 0.39
336 0.4
337 0.41
338 0.38
339 0.36
340 0.31
341 0.29
342 0.22
343 0.17
344 0.13
345 0.12
346 0.08
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.1
360 0.1
361 0.12
362 0.14
363 0.16
364 0.19
365 0.22
366 0.26
367 0.27
368 0.33
369 0.37
370 0.37
371 0.36
372 0.34
373 0.33
374 0.33
375 0.31
376 0.25
377 0.19
378 0.18
379 0.18
380 0.18
381 0.17
382 0.11
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.16
394 0.23
395 0.25
396 0.26
397 0.28
398 0.28
399 0.32
400 0.34
401 0.34
402 0.31
403 0.33
404 0.29
405 0.31
406 0.31
407 0.29
408 0.3
409 0.3
410 0.31
411 0.32
412 0.36
413 0.37
414 0.37
415 0.35
416 0.31
417 0.26
418 0.2
419 0.15
420 0.1
421 0.06
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.04
452 0.04
453 0.05
454 0.08
455 0.09
456 0.12
457 0.19
458 0.22
459 0.26
460 0.28
461 0.31
462 0.3
463 0.3
464 0.3
465 0.24
466 0.22
467 0.18
468 0.19
469 0.16
470 0.18
471 0.18
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.12
477 0.12
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.13
492 0.12
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.14
498 0.17
499 0.17
500 0.23
501 0.3
502 0.37
503 0.46
504 0.57
505 0.65
506 0.72
507 0.78
508 0.83
509 0.84
510 0.88
511 0.89
512 0.89