Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100I3E6

Protein Details
Accession A0A100I3E6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MGKSRPHNKKASKSRAKSVLGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-16RPHNKKASKSRA
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 10, cyto_mito 8, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MGKSRPHNKKASKSRAKSVLGAGGSVSKQKMNEDPSKLLEQATIQLQTGQPDAALQLAQQALNNAPDNSPSQLVALNTVGEIYVELGEIDVAKQHFMRAIELDPNGTIPEAEGGGAEKFLWLAQLSEQGGKDSVQWFEKGVSSLRHIIQQLEQKPGPEEALELAEKKRKMANALCAVAEIYMTDLSWEEDAENRCESLITEALLVAPNAPEVLQTLASIRISQLRTEEAQAALRRSLDLWKDLPPEDLSIPDFATRISLSRLLMEVSMELEALEVLERLILEDDQSVEAWYLGGWCLQLLAGKQQAPKDADEEDGNTPEARRHASLVASREWLKQSLTLYDLVQYEDERLKEHALELVQEMNKEIGEDMDDDEAGEGEEDWEDEEIEVESDGDDEMADS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.87
3 0.81
4 0.74
5 0.67
6 0.63
7 0.52
8 0.45
9 0.36
10 0.3
11 0.27
12 0.27
13 0.23
14 0.19
15 0.19
16 0.23
17 0.29
18 0.33
19 0.4
20 0.43
21 0.45
22 0.48
23 0.5
24 0.48
25 0.41
26 0.35
27 0.28
28 0.25
29 0.25
30 0.22
31 0.18
32 0.2
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.16
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.17
50 0.19
51 0.16
52 0.15
53 0.17
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.15
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.16
62 0.14
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.15
85 0.13
86 0.15
87 0.18
88 0.19
89 0.19
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.12
94 0.1
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.1
112 0.11
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.15
119 0.13
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.2
131 0.2
132 0.22
133 0.22
134 0.22
135 0.24
136 0.3
137 0.29
138 0.32
139 0.31
140 0.28
141 0.29
142 0.28
143 0.24
144 0.17
145 0.14
146 0.09
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.18
156 0.23
157 0.26
158 0.32
159 0.33
160 0.35
161 0.33
162 0.31
163 0.29
164 0.24
165 0.19
166 0.11
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.08
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.12
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.13
223 0.17
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.23
231 0.19
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.14
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.07
286 0.07
287 0.11
288 0.14
289 0.17
290 0.2
291 0.22
292 0.28
293 0.28
294 0.29
295 0.27
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.23
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.18
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.23
312 0.28
313 0.29
314 0.3
315 0.3
316 0.31
317 0.33
318 0.33
319 0.3
320 0.26
321 0.25
322 0.24
323 0.23
324 0.23
325 0.21
326 0.19
327 0.21
328 0.2
329 0.18
330 0.17
331 0.15
332 0.17
333 0.19
334 0.19
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.19
339 0.19
340 0.2
341 0.17
342 0.18
343 0.17
344 0.22
345 0.21
346 0.2
347 0.21
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.15
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06