Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A117E159

Protein Details
Accession A0A117E159    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-141DSYMRRIAKEQKKEDEKRREEKAKRQKTVBasic
405-429YPPMLPRKLRVSRAKKILKKRSDGGHydrophilic
480-508EGSHIRVKTKSRGSKGKPNNRSSKRAAAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-138RIAKEQKKEDEKRREEKAKRQ
410-434PRKLRVSRAKKILKKRSDGGGQKKT
485-518RVKTKSRGSKGKPNNRSSKRAAAYKAAGGWKKGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11.666, cyto 5, cyto_mito 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKSDKSLPLFGAKASIDPSLAALFETSAGPVKAPSVTIAAPAPQSSKRTAENDKDEDGEDVLSELEDESLPEDEEMQEAPEASSDEGSEKAEVAAEAPSRKRKRTTAEDVEDSYMRRIAKEQKKEDEKRREEKAKRQKTVEGEQGEDAEKSEEEDDEEESSEEEEEKKAVPKHESQTGDAESKELDKSNRTVFLGNVSSEAIKSKSAKKTLLKHLASFLSTLPESTGPHKVESIRFRSTAFSSGGGVPKRASFAKQEVLDDTTPCTNAYAVYSTVQAARKAPAALNGTVILDRHLRVDSVAHPAPIDHKRCVFVGNLDFVDNEVKPDDEQKKKKRAPADVEEGLWRTFNAHTGRSNKEKPKNGNVESVRVVRDSLTRVGKGFAYVQFYDQNCVEEALVLNGKHYPPMLPRKLRVSRAKKILKKRSDGGGQKKTLGEADKTLQGRAGRLFGRAGAAKVKADAQKSISQNSLVFEGHRATEGSHIRVKTKSRGSKGKPNNRSSKRAAAYKAAGGWKKGKTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.17
5 0.16
6 0.17
7 0.12
8 0.12
9 0.11
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.17
30 0.2
31 0.21
32 0.24
33 0.26
34 0.29
35 0.33
36 0.38
37 0.46
38 0.51
39 0.56
40 0.57
41 0.56
42 0.53
43 0.48
44 0.43
45 0.35
46 0.26
47 0.17
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.1
83 0.12
84 0.16
85 0.21
86 0.31
87 0.36
88 0.41
89 0.47
90 0.5
91 0.57
92 0.63
93 0.68
94 0.69
95 0.7
96 0.69
97 0.66
98 0.62
99 0.54
100 0.45
101 0.36
102 0.29
103 0.22
104 0.18
105 0.2
106 0.28
107 0.36
108 0.45
109 0.51
110 0.58
111 0.69
112 0.78
113 0.83
114 0.84
115 0.83
116 0.81
117 0.83
118 0.83
119 0.8
120 0.82
121 0.82
122 0.82
123 0.8
124 0.76
125 0.73
126 0.69
127 0.69
128 0.67
129 0.58
130 0.49
131 0.43
132 0.4
133 0.35
134 0.28
135 0.21
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.14
156 0.17
157 0.2
158 0.23
159 0.29
160 0.33
161 0.39
162 0.41
163 0.38
164 0.39
165 0.38
166 0.36
167 0.29
168 0.25
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.17
176 0.19
177 0.22
178 0.21
179 0.21
180 0.19
181 0.23
182 0.22
183 0.19
184 0.17
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.1
190 0.1
191 0.13
192 0.19
193 0.25
194 0.29
195 0.35
196 0.4
197 0.48
198 0.56
199 0.64
200 0.57
201 0.52
202 0.52
203 0.47
204 0.41
205 0.33
206 0.23
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.18
215 0.16
216 0.17
217 0.19
218 0.2
219 0.25
220 0.3
221 0.33
222 0.29
223 0.29
224 0.29
225 0.3
226 0.29
227 0.27
228 0.22
229 0.17
230 0.15
231 0.17
232 0.2
233 0.18
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.16
242 0.2
243 0.21
244 0.21
245 0.2
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.17
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.1
287 0.16
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.2
293 0.26
294 0.27
295 0.23
296 0.24
297 0.25
298 0.25
299 0.27
300 0.22
301 0.19
302 0.18
303 0.19
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.12
310 0.1
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.16
315 0.23
316 0.31
317 0.41
318 0.49
319 0.59
320 0.64
321 0.69
322 0.69
323 0.7
324 0.69
325 0.67
326 0.66
327 0.57
328 0.54
329 0.5
330 0.44
331 0.35
332 0.27
333 0.19
334 0.12
335 0.11
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.23
340 0.28
341 0.34
342 0.4
343 0.48
344 0.52
345 0.58
346 0.64
347 0.65
348 0.7
349 0.74
350 0.69
351 0.7
352 0.63
353 0.58
354 0.54
355 0.5
356 0.4
357 0.31
358 0.29
359 0.2
360 0.21
361 0.2
362 0.22
363 0.23
364 0.23
365 0.23
366 0.24
367 0.23
368 0.22
369 0.22
370 0.19
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.26
375 0.26
376 0.27
377 0.24
378 0.23
379 0.18
380 0.19
381 0.16
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.14
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.14
391 0.15
392 0.14
393 0.19
394 0.3
395 0.39
396 0.42
397 0.46
398 0.55
399 0.63
400 0.69
401 0.72
402 0.71
403 0.71
404 0.76
405 0.82
406 0.8
407 0.84
408 0.85
409 0.83
410 0.81
411 0.77
412 0.75
413 0.74
414 0.75
415 0.75
416 0.74
417 0.67
418 0.64
419 0.59
420 0.52
421 0.46
422 0.4
423 0.32
424 0.26
425 0.27
426 0.3
427 0.3
428 0.29
429 0.29
430 0.27
431 0.27
432 0.25
433 0.27
434 0.22
435 0.23
436 0.23
437 0.2
438 0.24
439 0.22
440 0.22
441 0.21
442 0.22
443 0.21
444 0.22
445 0.27
446 0.27
447 0.28
448 0.29
449 0.29
450 0.35
451 0.38
452 0.4
453 0.36
454 0.34
455 0.33
456 0.31
457 0.3
458 0.22
459 0.2
460 0.19
461 0.19
462 0.17
463 0.17
464 0.16
465 0.14
466 0.21
467 0.25
468 0.27
469 0.31
470 0.32
471 0.34
472 0.4
473 0.45
474 0.46
475 0.53
476 0.57
477 0.61
478 0.7
479 0.75
480 0.8
481 0.86
482 0.87
483 0.87
484 0.88
485 0.89
486 0.87
487 0.87
488 0.83
489 0.82
490 0.79
491 0.76
492 0.71
493 0.68
494 0.64
495 0.6
496 0.58
497 0.56
498 0.52
499 0.49
500 0.51