Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IFI2

Protein Details
Accession A0A100IFI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-400EKPEKSEKTEKQRPAKEQPKAEKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
362-398IAIRQKKEADEKAKAEKPEKSEKTEKQRPAKEQPKAE
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 7.833, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAPSKQKAQKMSLGNFLADENFGSWADEMEDMPLPSPAPSSFGRSAAPSSGFGSSFGGERERGGYAVREPLPLPTQPPYTAHVGNLSFDATAADISDLFADCGVTNVRIVEDKLTKAPKGFGYVEFETVDGLKKALDLSGATLQGRSIRTSIAEPPKERDVKEFDWTRRGPLPDIPQRRVPDRSSFGRNLDNMSDAGSDRGSGRRSNFESDGKFRDFSNWERKGPLSPPPAPVREGGRPRSNEAPGFRRSSPAWGEGRSQDGSRPPRREFQERTPTAAELDNAWRSKMRPDQPAKEASNPPSPAAAPAAPATRPRLNLQKRTVTEAVSSPTANTESKASPFGGARPIDTAAREKEVEERRQIAIRQKKEADEKAKAEKPEKSEKTEKQRPAKEQPKAEKTGAPADPNGRDVAEHAQGGTNFEILRRAGEDESGMTADQDQSEEAAAAKKAEASTDAPASKANGNWRAGPAEAGADDEGWSTVSSKQRNNRRGGRTFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.39
4 0.32
5 0.23
6 0.2
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.12
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.13
24 0.11
25 0.13
26 0.14
27 0.21
28 0.23
29 0.24
30 0.25
31 0.26
32 0.28
33 0.28
34 0.28
35 0.22
36 0.22
37 0.23
38 0.21
39 0.2
40 0.2
41 0.16
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.23
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.26
58 0.28
59 0.27
60 0.28
61 0.25
62 0.27
63 0.27
64 0.29
65 0.28
66 0.3
67 0.3
68 0.28
69 0.28
70 0.25
71 0.24
72 0.23
73 0.2
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.24
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.31
105 0.27
106 0.3
107 0.3
108 0.26
109 0.3
110 0.3
111 0.3
112 0.27
113 0.25
114 0.2
115 0.18
116 0.17
117 0.1
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.09
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.16
132 0.17
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.23
139 0.29
140 0.33
141 0.34
142 0.37
143 0.45
144 0.47
145 0.45
146 0.42
147 0.4
148 0.37
149 0.44
150 0.47
151 0.41
152 0.46
153 0.46
154 0.45
155 0.43
156 0.42
157 0.36
158 0.35
159 0.41
160 0.42
161 0.49
162 0.48
163 0.49
164 0.5
165 0.53
166 0.52
167 0.46
168 0.44
169 0.42
170 0.44
171 0.44
172 0.45
173 0.43
174 0.42
175 0.4
176 0.35
177 0.3
178 0.26
179 0.19
180 0.17
181 0.15
182 0.11
183 0.11
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.15
191 0.21
192 0.24
193 0.27
194 0.3
195 0.31
196 0.33
197 0.35
198 0.38
199 0.33
200 0.31
201 0.27
202 0.29
203 0.27
204 0.3
205 0.36
206 0.36
207 0.34
208 0.36
209 0.36
210 0.35
211 0.34
212 0.36
213 0.32
214 0.3
215 0.34
216 0.36
217 0.37
218 0.35
219 0.35
220 0.31
221 0.31
222 0.34
223 0.35
224 0.37
225 0.37
226 0.38
227 0.41
228 0.39
229 0.36
230 0.33
231 0.33
232 0.31
233 0.33
234 0.31
235 0.29
236 0.27
237 0.28
238 0.26
239 0.26
240 0.25
241 0.22
242 0.24
243 0.22
244 0.25
245 0.22
246 0.2
247 0.17
248 0.22
249 0.29
250 0.34
251 0.38
252 0.37
253 0.44
254 0.48
255 0.54
256 0.54
257 0.55
258 0.59
259 0.55
260 0.57
261 0.51
262 0.47
263 0.4
264 0.34
265 0.25
266 0.15
267 0.18
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.16
273 0.21
274 0.27
275 0.3
276 0.36
277 0.42
278 0.48
279 0.51
280 0.58
281 0.55
282 0.54
283 0.52
284 0.47
285 0.47
286 0.42
287 0.38
288 0.32
289 0.3
290 0.24
291 0.22
292 0.17
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.14
298 0.18
299 0.19
300 0.21
301 0.23
302 0.32
303 0.38
304 0.46
305 0.5
306 0.54
307 0.52
308 0.57
309 0.55
310 0.46
311 0.4
312 0.33
313 0.3
314 0.23
315 0.21
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.13
323 0.15
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.16
328 0.17
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.18
333 0.19
334 0.18
335 0.19
336 0.21
337 0.16
338 0.19
339 0.19
340 0.18
341 0.25
342 0.32
343 0.35
344 0.35
345 0.37
346 0.36
347 0.39
348 0.42
349 0.43
350 0.46
351 0.45
352 0.49
353 0.49
354 0.52
355 0.56
356 0.61
357 0.59
358 0.56
359 0.56
360 0.57
361 0.59
362 0.58
363 0.55
364 0.52
365 0.51
366 0.55
367 0.54
368 0.54
369 0.58
370 0.63
371 0.69
372 0.73
373 0.76
374 0.75
375 0.79
376 0.79
377 0.8
378 0.82
379 0.79
380 0.79
381 0.8
382 0.79
383 0.76
384 0.7
385 0.62
386 0.56
387 0.57
388 0.5
389 0.42
390 0.37
391 0.36
392 0.36
393 0.34
394 0.31
395 0.22
396 0.19
397 0.19
398 0.21
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.18
403 0.18
404 0.21
405 0.19
406 0.16
407 0.13
408 0.13
409 0.16
410 0.13
411 0.14
412 0.13
413 0.15
414 0.14
415 0.15
416 0.16
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.1
426 0.09
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.13
436 0.13
437 0.14
438 0.16
439 0.15
440 0.19
441 0.24
442 0.24
443 0.22
444 0.23
445 0.25
446 0.25
447 0.26
448 0.31
449 0.32
450 0.34
451 0.37
452 0.38
453 0.38
454 0.35
455 0.33
456 0.25
457 0.2
458 0.17
459 0.16
460 0.14
461 0.12
462 0.12
463 0.11
464 0.11
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.14
469 0.21
470 0.27
471 0.35
472 0.44
473 0.54
474 0.63
475 0.71
476 0.76
477 0.78