Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100I300

Protein Details
Accession A0A100I300    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-325IGKGAPKKPKWQANRNKNRKKQETANEDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-262IRRAKEAAEKREEERK
297-317IGKGAPKKPKWQANRNKNRKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSASQPRPKRAGEDFTRTHHHEDDDVNGASKKPRFDLRNPSALAPDALEDDAVLDADEIGRRGQQVRRKAVNLDGYDSDSENEGFSARIEAKSKASKEKHDAEDDDMFAELQEDFGAEEVDADEAMRKNKKTVRFLRDDEIEGQVASSKGGGTVHADFSKGADEVDNEEDESESEVGDEERAKLDEELDEELGAGAKKKHAPVLDAFNMRTEQEEGRFDDQGNYIRKAADPDAVYDSWLEGVSKKDIRRAKEAAEKREEERKEKDRQDDSVLTSDALKTIISHLDRGETILEALARIGKGAPKKPKWQANRNKNRKKQETANEDTEMAEEDPKETARKQAIDAITGAADILMTRGQADIYDTEREMLTRQYRRETGEDWVDPSLGDSRPSEGAPTMWEFRWADARDGGVTHGPYDSATMESWKNAGYFGEGVEFRRTDTGQWQKEATFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.66
4 0.62
5 0.59
6 0.53
7 0.47
8 0.41
9 0.39
10 0.37
11 0.35
12 0.32
13 0.3
14 0.27
15 0.27
16 0.29
17 0.31
18 0.3
19 0.29
20 0.37
21 0.42
22 0.49
23 0.58
24 0.59
25 0.65
26 0.64
27 0.61
28 0.54
29 0.49
30 0.41
31 0.3
32 0.24
33 0.16
34 0.14
35 0.12
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.06
41 0.04
42 0.04
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.09
48 0.11
49 0.16
50 0.22
51 0.28
52 0.37
53 0.46
54 0.53
55 0.55
56 0.56
57 0.58
58 0.6
59 0.55
60 0.49
61 0.41
62 0.37
63 0.35
64 0.33
65 0.26
66 0.19
67 0.17
68 0.13
69 0.12
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.23
79 0.3
80 0.34
81 0.4
82 0.44
83 0.48
84 0.54
85 0.6
86 0.6
87 0.59
88 0.57
89 0.52
90 0.51
91 0.43
92 0.36
93 0.27
94 0.22
95 0.15
96 0.14
97 0.09
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.07
111 0.09
112 0.14
113 0.18
114 0.19
115 0.25
116 0.3
117 0.39
118 0.46
119 0.54
120 0.59
121 0.62
122 0.65
123 0.65
124 0.63
125 0.57
126 0.49
127 0.41
128 0.32
129 0.24
130 0.2
131 0.16
132 0.12
133 0.1
134 0.08
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.08
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.19
190 0.26
191 0.28
192 0.28
193 0.28
194 0.26
195 0.25
196 0.23
197 0.21
198 0.16
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.17
208 0.21
209 0.22
210 0.21
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.19
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.14
223 0.13
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.05
228 0.07
229 0.1
230 0.14
231 0.15
232 0.22
233 0.26
234 0.29
235 0.34
236 0.35
237 0.37
238 0.42
239 0.48
240 0.48
241 0.51
242 0.49
243 0.46
244 0.52
245 0.49
246 0.44
247 0.46
248 0.45
249 0.48
250 0.52
251 0.57
252 0.52
253 0.52
254 0.54
255 0.49
256 0.45
257 0.39
258 0.33
259 0.25
260 0.22
261 0.2
262 0.14
263 0.11
264 0.08
265 0.05
266 0.07
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.15
287 0.22
288 0.32
289 0.36
290 0.45
291 0.53
292 0.62
293 0.68
294 0.74
295 0.77
296 0.79
297 0.85
298 0.88
299 0.9
300 0.91
301 0.92
302 0.89
303 0.86
304 0.85
305 0.83
306 0.81
307 0.78
308 0.73
309 0.64
310 0.56
311 0.49
312 0.39
313 0.31
314 0.22
315 0.16
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.12
322 0.18
323 0.21
324 0.23
325 0.23
326 0.3
327 0.3
328 0.29
329 0.29
330 0.23
331 0.18
332 0.17
333 0.15
334 0.07
335 0.06
336 0.04
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.07
345 0.09
346 0.11
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.19
354 0.25
355 0.29
356 0.33
357 0.39
358 0.42
359 0.46
360 0.49
361 0.44
362 0.42
363 0.44
364 0.42
365 0.37
366 0.35
367 0.3
368 0.26
369 0.25
370 0.23
371 0.15
372 0.16
373 0.14
374 0.16
375 0.18
376 0.18
377 0.19
378 0.15
379 0.15
380 0.16
381 0.2
382 0.21
383 0.2
384 0.25
385 0.24
386 0.25
387 0.33
388 0.32
389 0.3
390 0.28
391 0.3
392 0.25
393 0.25
394 0.25
395 0.21
396 0.19
397 0.17
398 0.15
399 0.14
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.14
406 0.15
407 0.16
408 0.17
409 0.16
410 0.16
411 0.15
412 0.14
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.18
417 0.17
418 0.2
419 0.25
420 0.24
421 0.22
422 0.26
423 0.26
424 0.23
425 0.32
426 0.4
427 0.41
428 0.44
429 0.45