Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G3J4T9

Protein Details
Accession G3J4T9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-368VNEVKKRRGRAAPPGRCHSCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
354-358KRRGR
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cmt:CCM_00560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MAAASVLTPSSHYQPPSFAASTYPPHSSSSSSSGPSPTPNMISSAEPPRRTGDDSNSSNVPEPPARQSLPSISEVISGTRPGQYPPPHSSMPPQPSTGGLPSPFAPPSRQYSDSDKHSRSPQPLHPVSFPSRQDAIPAFADSPRPPFNGRPGLPPVTDRRPTPPNKQDGHGPMHHDHRSVSGGYPQPPAPTSHPYQPAHLPPGQMPLPGYPISPRHEHYDAPRPQTHGEPAPYARSRYEAAPRHYENWTYHESFSRIGSNSRTLFNFAEAYGRAAQEQQGGQPSVERLPSEREVNEMLANVDYIRRSLEQVRDIVQHTERAREGAKAKSAYEEMHDVNMYNDGKPHYPVNEVKKRRGRAAPPGRCHSCNRIDTPEWRRGPDGARTLCNACGLHYAKLERKRQTEARSLGPKTEERN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.34
4 0.33
5 0.28
6 0.26
7 0.29
8 0.33
9 0.34
10 0.34
11 0.28
12 0.3
13 0.32
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.32
18 0.31
19 0.31
20 0.31
21 0.31
22 0.32
23 0.31
24 0.28
25 0.27
26 0.25
27 0.26
28 0.25
29 0.26
30 0.28
31 0.35
32 0.39
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.42
37 0.44
38 0.44
39 0.42
40 0.44
41 0.47
42 0.49
43 0.46
44 0.44
45 0.41
46 0.37
47 0.33
48 0.27
49 0.26
50 0.27
51 0.32
52 0.31
53 0.31
54 0.32
55 0.33
56 0.33
57 0.33
58 0.29
59 0.23
60 0.25
61 0.24
62 0.22
63 0.19
64 0.16
65 0.15
66 0.17
67 0.17
68 0.16
69 0.24
70 0.27
71 0.33
72 0.37
73 0.42
74 0.4
75 0.4
76 0.45
77 0.46
78 0.48
79 0.44
80 0.4
81 0.35
82 0.35
83 0.37
84 0.33
85 0.27
86 0.2
87 0.19
88 0.18
89 0.21
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.19
94 0.25
95 0.3
96 0.32
97 0.32
98 0.39
99 0.44
100 0.5
101 0.56
102 0.51
103 0.49
104 0.54
105 0.56
106 0.54
107 0.54
108 0.52
109 0.54
110 0.56
111 0.55
112 0.5
113 0.5
114 0.49
115 0.49
116 0.43
117 0.38
118 0.36
119 0.32
120 0.33
121 0.29
122 0.27
123 0.21
124 0.21
125 0.17
126 0.16
127 0.19
128 0.16
129 0.2
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.23
134 0.3
135 0.36
136 0.36
137 0.37
138 0.4
139 0.41
140 0.39
141 0.39
142 0.38
143 0.36
144 0.38
145 0.34
146 0.34
147 0.39
148 0.44
149 0.52
150 0.53
151 0.55
152 0.54
153 0.54
154 0.55
155 0.52
156 0.52
157 0.45
158 0.42
159 0.36
160 0.4
161 0.4
162 0.34
163 0.29
164 0.25
165 0.24
166 0.2
167 0.18
168 0.17
169 0.19
170 0.2
171 0.22
172 0.21
173 0.2
174 0.2
175 0.22
176 0.2
177 0.22
178 0.22
179 0.26
180 0.33
181 0.33
182 0.35
183 0.36
184 0.35
185 0.34
186 0.33
187 0.28
188 0.21
189 0.24
190 0.22
191 0.19
192 0.17
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.14
199 0.16
200 0.18
201 0.19
202 0.22
203 0.23
204 0.24
205 0.27
206 0.34
207 0.36
208 0.39
209 0.39
210 0.36
211 0.36
212 0.36
213 0.35
214 0.29
215 0.26
216 0.23
217 0.22
218 0.26
219 0.26
220 0.25
221 0.22
222 0.21
223 0.2
224 0.21
225 0.29
226 0.29
227 0.32
228 0.38
229 0.4
230 0.41
231 0.41
232 0.41
233 0.34
234 0.32
235 0.33
236 0.28
237 0.27
238 0.27
239 0.26
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.18
244 0.18
245 0.2
246 0.22
247 0.23
248 0.24
249 0.23
250 0.22
251 0.22
252 0.21
253 0.2
254 0.14
255 0.15
256 0.13
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.12
275 0.17
276 0.2
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.22
281 0.23
282 0.22
283 0.17
284 0.14
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.12
294 0.17
295 0.22
296 0.24
297 0.26
298 0.29
299 0.3
300 0.31
301 0.33
302 0.29
303 0.3
304 0.27
305 0.3
306 0.27
307 0.27
308 0.26
309 0.27
310 0.29
311 0.28
312 0.33
313 0.31
314 0.31
315 0.32
316 0.32
317 0.28
318 0.27
319 0.26
320 0.21
321 0.21
322 0.21
323 0.18
324 0.17
325 0.22
326 0.2
327 0.16
328 0.18
329 0.18
330 0.2
331 0.22
332 0.24
333 0.2
334 0.26
335 0.32
336 0.4
337 0.48
338 0.52
339 0.61
340 0.66
341 0.69
342 0.71
343 0.73
344 0.7
345 0.71
346 0.76
347 0.76
348 0.76
349 0.81
350 0.79
351 0.74
352 0.72
353 0.69
354 0.67
355 0.63
356 0.6
357 0.59
358 0.58
359 0.63
360 0.65
361 0.66
362 0.6
363 0.56
364 0.53
365 0.49
366 0.49
367 0.48
368 0.51
369 0.46
370 0.45
371 0.46
372 0.46
373 0.43
374 0.43
375 0.34
376 0.26
377 0.3
378 0.3
379 0.3
380 0.32
381 0.37
382 0.41
383 0.5
384 0.57
385 0.57
386 0.59
387 0.65
388 0.68
389 0.7
390 0.72
391 0.68
392 0.69
393 0.7
394 0.67
395 0.63
396 0.61