Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100I9N9

Protein Details
Accession A0A100I9N9    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-39MAPDKKDKKRKAAAATAADSPAKKTKKVEAKPAESPKPIHydrophilic
188-210QIPDSKKAKRKILKKQKENAGHVHydrophilic
301-325KGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTBasic
399-425EKPAEDTPKKTNKKTKKAAQSPAVQETHydrophilic
441-462TASPAAQKAKKVQKKTKAKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-73KKDKKRKAAAATAADSPAKKTKKVEAKPAESPKPILKKANQKEAATKTDGTSKTKANGQPARQIKPRKR
97-130KEEKPTTKKSKKEDGSAAPATKSKPAKANTKAKK
193-204KKAKRKILKKQK
303-346ANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWTERIEREQKRRLAKAEK
406-417PKKTNKKTKKAA
444-462PAAQKAKKVQKKTKAKSKA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAAATAADSPAKKTKKVEAKPAESPKPILKKANQKEAATKTDGTSKTKANGQPARQIKPRKRAADFLSDNENSESEAEVAEPKVAKEEKPTTKKSKKEDGSAAPATKSKPAKANTKAKKAEPVVEESEEDESAASDASQSEDEEDDRTAALIRGFESSGDEDESGDEGFNPDQPVPQIPDSKKAKRKILKKQKENAGHVEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMRAYFSQFGEITRLRLSRNRITGRSKHYAFIEFAHTSVAKIVAATMDNYLMYGHILKCKYVSPEQLHPEVWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKGKTREQWTERIEREQKRRLAKAEKLKAIMGYDLDIPQLKSVDEVPVQEAKAIEASEPAAEEPAKAIEAAPVEEPKAEKPAEDTPKKTNKKTKKAAQSPAVQETPKSAEKSTPKKTTEETASPAAQKAKKVQKKTKAKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.75
3 0.67
4 0.6
5 0.54
6 0.44
7 0.39
8 0.39
9 0.35
10 0.35
11 0.37
12 0.44
13 0.52
14 0.59
15 0.66
16 0.67
17 0.71
18 0.77
19 0.82
20 0.8
21 0.72
22 0.69
23 0.66
24 0.65
25 0.64
26 0.62
27 0.61
28 0.64
29 0.7
30 0.77
31 0.75
32 0.69
33 0.72
34 0.7
35 0.68
36 0.61
37 0.54
38 0.44
39 0.46
40 0.47
41 0.43
42 0.41
43 0.39
44 0.38
45 0.44
46 0.47
47 0.48
48 0.53
49 0.52
50 0.57
51 0.61
52 0.64
53 0.65
54 0.72
55 0.71
56 0.73
57 0.78
58 0.77
59 0.74
60 0.74
61 0.71
62 0.72
63 0.66
64 0.59
65 0.58
66 0.49
67 0.47
68 0.39
69 0.34
70 0.24
71 0.21
72 0.18
73 0.1
74 0.1
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.16
82 0.17
83 0.18
84 0.24
85 0.33
86 0.41
87 0.49
88 0.57
89 0.62
90 0.69
91 0.76
92 0.76
93 0.78
94 0.73
95 0.73
96 0.73
97 0.68
98 0.68
99 0.66
100 0.59
101 0.5
102 0.47
103 0.4
104 0.39
105 0.35
106 0.31
107 0.33
108 0.37
109 0.45
110 0.52
111 0.61
112 0.63
113 0.71
114 0.72
115 0.67
116 0.71
117 0.64
118 0.61
119 0.53
120 0.49
121 0.43
122 0.39
123 0.37
124 0.29
125 0.28
126 0.2
127 0.18
128 0.12
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.13
174 0.16
175 0.22
176 0.21
177 0.31
178 0.37
179 0.45
180 0.51
181 0.54
182 0.61
183 0.61
184 0.7
185 0.73
186 0.77
187 0.79
188 0.81
189 0.83
190 0.83
191 0.84
192 0.79
193 0.73
194 0.68
195 0.58
196 0.48
197 0.41
198 0.31
199 0.23
200 0.19
201 0.13
202 0.07
203 0.06
204 0.08
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.17
214 0.17
215 0.19
216 0.19
217 0.19
218 0.19
219 0.2
220 0.2
221 0.13
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.16
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.17
230 0.15
231 0.19
232 0.25
233 0.26
234 0.34
235 0.37
236 0.4
237 0.46
238 0.51
239 0.54
240 0.56
241 0.52
242 0.46
243 0.43
244 0.4
245 0.35
246 0.3
247 0.28
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.16
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.07
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.16
275 0.2
276 0.21
277 0.28
278 0.28
279 0.35
280 0.39
281 0.4
282 0.39
283 0.35
284 0.33
285 0.29
286 0.26
287 0.23
288 0.24
289 0.28
290 0.37
291 0.4
292 0.46
293 0.49
294 0.54
295 0.6
296 0.66
297 0.7
298 0.71
299 0.79
300 0.8
301 0.84
302 0.89
303 0.87
304 0.86
305 0.85
306 0.84
307 0.8
308 0.8
309 0.78
310 0.79
311 0.77
312 0.74
313 0.73
314 0.67
315 0.69
316 0.65
317 0.66
318 0.57
319 0.58
320 0.61
321 0.61
322 0.66
323 0.66
324 0.67
325 0.66
326 0.69
327 0.68
328 0.68
329 0.68
330 0.69
331 0.7
332 0.68
333 0.62
334 0.58
335 0.52
336 0.44
337 0.37
338 0.26
339 0.18
340 0.15
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.14
351 0.13
352 0.14
353 0.16
354 0.19
355 0.19
356 0.2
357 0.19
358 0.15
359 0.16
360 0.15
361 0.12
362 0.09
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.15
382 0.16
383 0.15
384 0.2
385 0.18
386 0.17
387 0.2
388 0.29
389 0.38
390 0.43
391 0.46
392 0.5
393 0.61
394 0.68
395 0.73
396 0.75
397 0.75
398 0.8
399 0.86
400 0.87
401 0.87
402 0.89
403 0.9
404 0.88
405 0.86
406 0.82
407 0.78
408 0.73
409 0.62
410 0.52
411 0.47
412 0.45
413 0.41
414 0.37
415 0.31
416 0.35
417 0.44
418 0.54
419 0.59
420 0.62
421 0.6
422 0.61
423 0.64
424 0.64
425 0.63
426 0.59
427 0.54
428 0.5
429 0.51
430 0.48
431 0.49
432 0.48
433 0.43
434 0.42
435 0.47
436 0.52
437 0.57
438 0.66
439 0.73
440 0.75
441 0.83
442 0.89