Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IRS1

Protein Details
Accession A0A100IRS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-425LSAFVKRKPASKKPPQKSETVPKRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
406-424KRKPASKKPPQKSETVPKR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 11, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MEPTTSPKDDSTKTQTALDDLIKQAAAKDAIKDYNAAAELYSEATELQAELNGELALENADLLFAYGKALYNVAVSKSDVLGSKVAGESQPSSASVERPSAAATATTAGIVEKAVAQGPPEKSAGAQKSNTGDVPAKPYFQFTGDENFDDSGSEDEADGEEAAADDEDDFANAFEVLDLARVLYHKKMTTIEEGIGKGKSADLPPDLRHVKERLADTYDLQAEISLEAERFLDAVTDLRTSLDLRQSLFPIEDPSVAECHYKLSLALEFGSVKNENDSSQEDSTLKGPVDEEMREEAAAQMEKAIESCRLRMDQEQKKLVDDNSLDEDKVTAMKRRIANVKDIIADMEQRLVDLRRPPVSATENSDADNTVLKGILGQIMGHSPSEQKAHLDAVTKEANDLSAFVKRKPASKKPPQKSETVPKRSAPEEGAGGDTKRARAGDNLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.45
3 0.41
4 0.42
5 0.37
6 0.32
7 0.27
8 0.27
9 0.23
10 0.22
11 0.2
12 0.21
13 0.21
14 0.18
15 0.2
16 0.24
17 0.26
18 0.27
19 0.27
20 0.23
21 0.24
22 0.24
23 0.2
24 0.15
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.08
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.05
51 0.04
52 0.05
53 0.06
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.15
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.14
88 0.13
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.14
105 0.15
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.24
111 0.28
112 0.27
113 0.26
114 0.27
115 0.29
116 0.31
117 0.3
118 0.25
119 0.23
120 0.2
121 0.26
122 0.24
123 0.24
124 0.22
125 0.24
126 0.22
127 0.21
128 0.21
129 0.15
130 0.21
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.08
171 0.11
172 0.11
173 0.13
174 0.15
175 0.17
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.15
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.21
193 0.22
194 0.21
195 0.24
196 0.23
197 0.24
198 0.26
199 0.26
200 0.21
201 0.23
202 0.23
203 0.21
204 0.22
205 0.2
206 0.16
207 0.14
208 0.11
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.09
229 0.12
230 0.12
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.11
263 0.13
264 0.15
265 0.17
266 0.16
267 0.18
268 0.17
269 0.17
270 0.18
271 0.17
272 0.15
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.13
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.26
299 0.35
300 0.38
301 0.45
302 0.51
303 0.48
304 0.49
305 0.5
306 0.43
307 0.39
308 0.31
309 0.27
310 0.26
311 0.26
312 0.24
313 0.21
314 0.21
315 0.15
316 0.18
317 0.17
318 0.17
319 0.19
320 0.26
321 0.29
322 0.35
323 0.43
324 0.41
325 0.47
326 0.45
327 0.45
328 0.4
329 0.37
330 0.32
331 0.25
332 0.24
333 0.17
334 0.15
335 0.12
336 0.11
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.2
341 0.25
342 0.25
343 0.27
344 0.28
345 0.32
346 0.36
347 0.35
348 0.37
349 0.37
350 0.34
351 0.34
352 0.34
353 0.28
354 0.24
355 0.23
356 0.16
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.14
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.18
376 0.2
377 0.21
378 0.25
379 0.23
380 0.26
381 0.28
382 0.26
383 0.25
384 0.22
385 0.21
386 0.17
387 0.17
388 0.14
389 0.18
390 0.2
391 0.21
392 0.29
393 0.31
394 0.38
395 0.47
396 0.55
397 0.59
398 0.68
399 0.78
400 0.79
401 0.88
402 0.84
403 0.82
404 0.81
405 0.81
406 0.81
407 0.8
408 0.74
409 0.68
410 0.71
411 0.65
412 0.59
413 0.51
414 0.44
415 0.38
416 0.34
417 0.32
418 0.29
419 0.28
420 0.29
421 0.28
422 0.25
423 0.26
424 0.25
425 0.23