Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A117DX56

Protein Details
Accession A0A117DX56    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-225LLPCWRRISRLHKGFRRNRDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019474  Ub_conjug_fac_E4_core  
IPR045132  UBE4  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000151  C:ubiquitin ligase complex  
GO:0034450  F:ubiquitin-ubiquitin ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF04564  U-box  
PF10408  Ufd2P_core  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16657  RING-Ubox_UBE4A  
Amino Acid Sequences MSESQSEADKAFAVLTCPHNQIRSKRLAKLGNPTPSAQNEGAADSASSRPASPAPSTPTSRYPDRIQTQSSSRPGSAPGSSAPSPQLQPQQSEWKRIKITPAASASSVPDRSQTVTPVSGTPPPPKAEESIEAFQDRTLSAVFKLSLNEARQKDIHGQRLTYLPGLKSELEDQGREVRVDVTVLDQALLEAASNAPRQKPLDYLLPCWRRISRLHKGFRRNRDDDPKFSAICEARRICLSYCIFAITMPEMFGLEPAEKSPLKPYLLLDPEDDKGVDFEFIGEAVKRFDEDESLKPAFITAVEEMSQELAAMTINDDYKPYMTALRNLVRHAVIAAAITESDMFNASRDPALFEKSTLLGPWFRLSPLQSSVTMTYFSSPKTRDQSYILNAQRSIRMMQHMISSDLLDVMNHMIRASKDARDRVLDWFAASLNINHKRRAMQVDPNTVSSDGFMFNLTTCLDQLCEPFMDASFTKIDRVDANYLHRNPRVDMRDETKINADQHASDAFYSKKAEGTSNFITEIFFLTVAAHHYGSESLTSKLEQLEKDLRHMESTINKFELERHRWVNNPMQLRVFEEALKKYKDKLDLGLALKYSLQGVLFDDQWQARSMLFMRYVIVWLLRVVSGTNFPKEEIKLPLPVQQPEVFKCLPEYFLDDIVSNFKFIMWCMPQIITATQGDELVMLCITFLESSGYIKNPYLKAGLVSILFRGTWPRPGGARGVLVDLLNSMPFANEYLLHSMMKFYIEAEHTGTHTQFFDKFNIRFEIFQIIKCIWPNTLYRNKLYNQSKQNLDFFVRFVNLLLNDVTFVLDESFGAFITIHKTQTELRLNGASMDPTVRQQKEEHLASAQRNAKSYMQLTNETVAMLKLFTDALADSFTMPEIVQRLADMLDYNLDAMVGPKSASLRVDNLQEYGFNPRALLSEIVDVYLNLMGKENFIIAVARDGRSYKPANFEKAADILRKWSLKSPEEFKRWEQLQKKVKAAKEADDQAEEDLGEVPDDFLDPLMYTLMEDPVILPGSRVSIDRATIRSHLLSDPHDPFNRAPLKMEDVIPDTELKAKIESFKSERLAERRRVLEPMDTTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.25
4 0.29
5 0.32
6 0.37
7 0.43
8 0.48
9 0.52
10 0.58
11 0.59
12 0.62
13 0.68
14 0.7
15 0.68
16 0.71
17 0.72
18 0.7
19 0.66
20 0.62
21 0.59
22 0.53
23 0.54
24 0.43
25 0.37
26 0.29
27 0.27
28 0.25
29 0.2
30 0.17
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.14
37 0.16
38 0.2
39 0.21
40 0.26
41 0.31
42 0.37
43 0.42
44 0.44
45 0.49
46 0.51
47 0.54
48 0.53
49 0.52
50 0.56
51 0.58
52 0.6
53 0.57
54 0.56
55 0.58
56 0.61
57 0.61
58 0.56
59 0.5
60 0.45
61 0.43
62 0.41
63 0.35
64 0.29
65 0.25
66 0.27
67 0.27
68 0.28
69 0.27
70 0.27
71 0.27
72 0.31
73 0.37
74 0.33
75 0.37
76 0.4
77 0.49
78 0.49
79 0.57
80 0.56
81 0.56
82 0.57
83 0.56
84 0.58
85 0.54
86 0.54
87 0.52
88 0.52
89 0.46
90 0.42
91 0.41
92 0.37
93 0.35
94 0.33
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.26
99 0.26
100 0.26
101 0.24
102 0.24
103 0.25
104 0.25
105 0.26
106 0.29
107 0.31
108 0.34
109 0.35
110 0.35
111 0.36
112 0.36
113 0.37
114 0.35
115 0.36
116 0.37
117 0.35
118 0.36
119 0.34
120 0.32
121 0.29
122 0.25
123 0.2
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.18
133 0.23
134 0.25
135 0.33
136 0.32
137 0.35
138 0.35
139 0.36
140 0.42
141 0.44
142 0.49
143 0.44
144 0.43
145 0.41
146 0.44
147 0.43
148 0.37
149 0.33
150 0.24
151 0.24
152 0.26
153 0.24
154 0.22
155 0.23
156 0.26
157 0.25
158 0.25
159 0.24
160 0.28
161 0.29
162 0.27
163 0.25
164 0.19
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.06
177 0.04
178 0.05
179 0.08
180 0.1
181 0.13
182 0.14
183 0.18
184 0.2
185 0.21
186 0.24
187 0.25
188 0.31
189 0.32
190 0.37
191 0.43
192 0.46
193 0.46
194 0.47
195 0.45
196 0.4
197 0.45
198 0.49
199 0.49
200 0.54
201 0.63
202 0.68
203 0.77
204 0.82
205 0.85
206 0.85
207 0.79
208 0.79
209 0.8
210 0.77
211 0.72
212 0.71
213 0.65
214 0.55
215 0.51
216 0.48
217 0.4
218 0.37
219 0.4
220 0.33
221 0.3
222 0.32
223 0.34
224 0.28
225 0.33
226 0.31
227 0.25
228 0.24
229 0.23
230 0.21
231 0.19
232 0.19
233 0.13
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.18
248 0.21
249 0.22
250 0.23
251 0.24
252 0.29
253 0.32
254 0.32
255 0.3
256 0.28
257 0.27
258 0.26
259 0.25
260 0.16
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.12
277 0.15
278 0.18
279 0.23
280 0.24
281 0.23
282 0.22
283 0.22
284 0.18
285 0.15
286 0.14
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.07
295 0.06
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.14
309 0.15
310 0.19
311 0.25
312 0.3
313 0.31
314 0.31
315 0.33
316 0.27
317 0.25
318 0.21
319 0.15
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.05
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.11
337 0.11
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.15
344 0.13
345 0.13
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.16
354 0.18
355 0.19
356 0.18
357 0.19
358 0.2
359 0.19
360 0.19
361 0.15
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.16
366 0.17
367 0.22
368 0.26
369 0.28
370 0.28
371 0.31
372 0.35
373 0.34
374 0.41
375 0.39
376 0.36
377 0.35
378 0.33
379 0.32
380 0.28
381 0.26
382 0.18
383 0.18
384 0.17
385 0.17
386 0.18
387 0.17
388 0.17
389 0.15
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.12
403 0.13
404 0.17
405 0.21
406 0.24
407 0.26
408 0.27
409 0.28
410 0.28
411 0.29
412 0.24
413 0.19
414 0.17
415 0.15
416 0.13
417 0.12
418 0.1
419 0.15
420 0.24
421 0.25
422 0.26
423 0.28
424 0.29
425 0.32
426 0.37
427 0.34
428 0.35
429 0.4
430 0.47
431 0.47
432 0.46
433 0.43
434 0.37
435 0.32
436 0.23
437 0.18
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.08
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.11
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.2
469 0.26
470 0.28
471 0.31
472 0.32
473 0.3
474 0.29
475 0.34
476 0.33
477 0.3
478 0.3
479 0.3
480 0.35
481 0.35
482 0.35
483 0.3
484 0.3
485 0.27
486 0.25
487 0.21
488 0.15
489 0.15
490 0.15
491 0.13
492 0.09
493 0.1
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.14
501 0.13
502 0.19
503 0.2
504 0.19
505 0.2
506 0.18
507 0.17
508 0.15
509 0.15
510 0.08
511 0.06
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.07
516 0.08
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.1
529 0.13
530 0.11
531 0.14
532 0.2
533 0.2
534 0.22
535 0.24
536 0.22
537 0.2
538 0.21
539 0.19
540 0.19
541 0.22
542 0.22
543 0.2
544 0.2
545 0.19
546 0.24
547 0.3
548 0.28
549 0.3
550 0.31
551 0.32
552 0.35
553 0.38
554 0.4
555 0.37
556 0.36
557 0.32
558 0.3
559 0.29
560 0.29
561 0.27
562 0.2
563 0.17
564 0.17
565 0.18
566 0.21
567 0.23
568 0.21
569 0.22
570 0.25
571 0.28
572 0.26
573 0.25
574 0.25
575 0.29
576 0.29
577 0.28
578 0.24
579 0.2
580 0.19
581 0.17
582 0.13
583 0.07
584 0.06
585 0.05
586 0.06
587 0.07
588 0.07
589 0.08
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.1
595 0.08
596 0.09
597 0.1
598 0.1
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.09
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.11
614 0.12
615 0.13
616 0.13
617 0.14
618 0.16
619 0.17
620 0.19
621 0.19
622 0.19
623 0.21
624 0.22
625 0.28
626 0.29
627 0.29
628 0.29
629 0.28
630 0.29
631 0.27
632 0.31
633 0.24
634 0.21
635 0.22
636 0.2
637 0.17
638 0.15
639 0.18
640 0.15
641 0.16
642 0.16
643 0.14
644 0.14
645 0.16
646 0.15
647 0.11
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.13
653 0.11
654 0.12
655 0.13
656 0.13
657 0.14
658 0.15
659 0.15
660 0.11
661 0.1
662 0.1
663 0.09
664 0.09
665 0.08
666 0.07
667 0.07
668 0.05
669 0.05
670 0.04
671 0.03
672 0.03
673 0.04
674 0.03
675 0.03
676 0.04
677 0.04
678 0.06
679 0.08
680 0.09
681 0.1
682 0.11
683 0.15
684 0.15
685 0.16
686 0.16
687 0.15
688 0.15
689 0.14
690 0.15
691 0.11
692 0.11
693 0.1
694 0.09
695 0.09
696 0.08
697 0.12
698 0.11
699 0.16
700 0.17
701 0.18
702 0.19
703 0.2
704 0.23
705 0.2
706 0.21
707 0.16
708 0.16
709 0.15
710 0.13
711 0.12
712 0.1
713 0.08
714 0.07
715 0.06
716 0.05
717 0.04
718 0.04
719 0.05
720 0.05
721 0.06
722 0.08
723 0.1
724 0.12
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.1
731 0.07
732 0.09
733 0.1
734 0.11
735 0.13
736 0.13
737 0.14
738 0.15
739 0.15
740 0.13
741 0.13
742 0.13
743 0.14
744 0.16
745 0.19
746 0.24
747 0.25
748 0.27
749 0.31
750 0.31
751 0.28
752 0.27
753 0.31
754 0.26
755 0.26
756 0.25
757 0.21
758 0.22
759 0.23
760 0.23
761 0.15
762 0.17
763 0.18
764 0.24
765 0.32
766 0.34
767 0.36
768 0.4
769 0.41
770 0.48
771 0.52
772 0.53
773 0.52
774 0.55
775 0.57
776 0.56
777 0.56
778 0.5
779 0.46
780 0.38
781 0.3
782 0.26
783 0.21
784 0.18
785 0.15
786 0.16
787 0.13
788 0.13
789 0.13
790 0.1
791 0.1
792 0.1
793 0.1
794 0.06
795 0.07
796 0.06
797 0.05
798 0.05
799 0.06
800 0.06
801 0.05
802 0.06
803 0.05
804 0.05
805 0.1
806 0.12
807 0.12
808 0.12
809 0.14
810 0.15
811 0.24
812 0.31
813 0.27
814 0.28
815 0.29
816 0.3
817 0.29
818 0.28
819 0.2
820 0.13
821 0.14
822 0.12
823 0.14
824 0.23
825 0.22
826 0.23
827 0.24
828 0.3
829 0.37
830 0.38
831 0.35
832 0.31
833 0.35
834 0.35
835 0.42
836 0.41
837 0.35
838 0.35
839 0.36
840 0.34
841 0.34
842 0.34
843 0.33
844 0.3
845 0.32
846 0.31
847 0.3
848 0.28
849 0.23
850 0.21
851 0.15
852 0.11
853 0.08
854 0.07
855 0.06
856 0.05
857 0.05
858 0.06
859 0.06
860 0.06
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.08
873 0.09
874 0.09
875 0.09
876 0.08
877 0.07
878 0.08
879 0.08
880 0.08
881 0.07
882 0.07
883 0.06
884 0.07
885 0.07
886 0.06
887 0.06
888 0.07
889 0.09
890 0.1
891 0.12
892 0.13
893 0.16
894 0.19
895 0.24
896 0.24
897 0.24
898 0.23
899 0.22
900 0.2
901 0.24
902 0.24
903 0.19
904 0.18
905 0.17
906 0.18
907 0.2
908 0.2
909 0.14
910 0.15
911 0.15
912 0.16
913 0.15
914 0.14
915 0.12
916 0.13
917 0.12
918 0.08
919 0.1
920 0.1
921 0.1
922 0.11
923 0.1
924 0.08
925 0.08
926 0.09
927 0.07
928 0.14
929 0.16
930 0.16
931 0.17
932 0.19
933 0.2
934 0.26
935 0.3
936 0.27
937 0.34
938 0.39
939 0.44
940 0.45
941 0.45
942 0.42
943 0.43
944 0.43
945 0.37
946 0.32
947 0.3
948 0.33
949 0.34
950 0.33
951 0.35
952 0.39
953 0.41
954 0.47
955 0.51
956 0.55
957 0.6
958 0.63
959 0.59
960 0.61
961 0.6
962 0.63
963 0.62
964 0.62
965 0.65
966 0.68
967 0.73
968 0.71
969 0.7
970 0.7
971 0.66
972 0.63
973 0.62
974 0.61
975 0.55
976 0.5
977 0.47
978 0.38
979 0.35
980 0.28
981 0.19
982 0.15
983 0.11
984 0.1
985 0.09
986 0.08
987 0.08
988 0.08
989 0.08
990 0.06
991 0.07
992 0.06
993 0.07
994 0.07
995 0.07
996 0.07
997 0.08
998 0.09
999 0.08
1000 0.08
1001 0.08
1002 0.1
1003 0.12
1004 0.11
1005 0.11
1006 0.1
1007 0.12
1008 0.14
1009 0.14
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.2
1013 0.24
1014 0.26
1015 0.27
1016 0.28
1017 0.31
1018 0.28
1019 0.28
1020 0.28
1021 0.28
1022 0.29
1023 0.33
1024 0.36
1025 0.4
1026 0.41
1027 0.42
1028 0.4
1029 0.45
1030 0.48
1031 0.42
1032 0.41
1033 0.38
1034 0.41
1035 0.42
1036 0.43
1037 0.37
1038 0.34
1039 0.34
1040 0.32
1041 0.29
1042 0.23
1043 0.25
1044 0.25
1045 0.22
1046 0.21
1047 0.22
1048 0.28
1049 0.31
1050 0.38
1051 0.37
1052 0.43
1053 0.46
1054 0.49
1055 0.55
1056 0.57
1057 0.62
1058 0.63
1059 0.66
1060 0.64
1061 0.62
1062 0.6
1063 0.55
1064 0.53