Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100ISB4

Protein Details
Accession A0A100ISB4    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
591-632PTNTATPTPKKRGRPRKPVVPGEEKKPRPKKPKKAQTVTTTAHydrophilic
669-720GPDGNPVPQKRRRGRPRKSEQGNVPPKPRPPKKPSSKPGTGRPRGRPRKADVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
599-624PKKRGRPRKPVVPGEEKKPRPKKPKK
677-723QKRRRGRPRKSEQGNVPPKPRPPKKPSSKPGTGRPRGRPRKADVEAR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MMGYNGHSFHQQRPPQQNAAHPQHQQQHHLQSPSMTAAAAAHPHHAPGMASNGALFRGQSQVELAAQSPDLRKMTPSSTGPVVGLPTGGHYSPFSGHYPPQGSSDLLSRNADSVGQLKDPYLSLQSLQRNMNPMANFRTHPTMNAQAAMSPHAHAMGLASPQQSFDRLQQQHLQHRQTPHTHPTTQTSAAASPMLTTAQPQHAFPQSAYQQTQQASPYQHTQQQSPYQQAQASPYQAQQAQYPQAQYPQAQHQASPYQAQAQQSPYQQHAHQTYQQQQAQQAQQQAQQQAQQKAQQAQQQAQQQAQQKAQQAQQQAQQQAQQQAQQQAQQQAQQKAQQQAQQQAQQQAQQQAAQQTQQPAHTQAQQQQAQQTYQQQQSRFQQQQAQRSPYQPQPQQLQFHHAYQRQYQQPQAQTQVQAQQPQPQSQQQQHPILQQHPQQQHHHALHQSQAQQHPSLLQQHQVQQQQPSPAQAKAQLQQQYQPHASASASMSGPELLAPAQEKPESTGTKQRKKQSKPSASPATPATQATQVNGQAQAGYPAPTPVSAAGPTPAPAPVSGVGSGPTFTPAGTSSAVQGPATAGAAPTAGAAPTNTATPTPKKRGRPRKPVVPGEEKKPRPKKPKKAQTVTTTAPDGTTMVVPAPTTNADGTPAVAAPAPAPAPPPQPIIGPDGNPVPQKRRRGRPRKSEQGNVPPKPRPPKKPSSKPGTGRPRGRPRKADVEARKAAEAAAAAAAAAGGQPQADQNQAGSQSQTLQQPQHSQVQPQSSVQSQAQNQPQSKPQPAQPSQPYQSFHQFQVTPQQPQQMHGQMAGQSKTQSHTNQMHTSSQAQFQALQHQFQAQPQPHTNTQANQQQQAQPQSQSRSGQAAQQAQAQAQQPRQMQAQNQAHTPVQPQPRQIQAQAQPQPQARSVQAQPQPQAQAQPRQMHPQPHTQAQQQPQPQPRQMPIPAQPHAAMHHQLQPHQLHAQAQGHPHPHHPQAHPHPHAQFQLHPHLHPHAQPQHPEPMTLNPPQKRGAPVDDDPRKRAFMMPQQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.69
4 0.7
5 0.7
6 0.72
7 0.7
8 0.65
9 0.65
10 0.66
11 0.67
12 0.65
13 0.63
14 0.64
15 0.63
16 0.62
17 0.55
18 0.48
19 0.45
20 0.41
21 0.34
22 0.23
23 0.17
24 0.15
25 0.15
26 0.18
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.13
35 0.17
36 0.15
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.15
42 0.13
43 0.1
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.13
53 0.13
54 0.16
55 0.17
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.25
61 0.28
62 0.31
63 0.31
64 0.31
65 0.32
66 0.32
67 0.3
68 0.27
69 0.25
70 0.18
71 0.16
72 0.12
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.14
79 0.15
80 0.19
81 0.18
82 0.2
83 0.22
84 0.28
85 0.3
86 0.3
87 0.32
88 0.31
89 0.29
90 0.26
91 0.3
92 0.26
93 0.26
94 0.27
95 0.24
96 0.23
97 0.22
98 0.21
99 0.17
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.15
111 0.22
112 0.27
113 0.31
114 0.34
115 0.34
116 0.37
117 0.38
118 0.42
119 0.36
120 0.34
121 0.34
122 0.35
123 0.34
124 0.32
125 0.37
126 0.32
127 0.32
128 0.34
129 0.36
130 0.34
131 0.35
132 0.31
133 0.26
134 0.26
135 0.27
136 0.22
137 0.15
138 0.14
139 0.12
140 0.12
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.2
153 0.27
154 0.28
155 0.33
156 0.39
157 0.46
158 0.54
159 0.6
160 0.61
161 0.57
162 0.61
163 0.63
164 0.63
165 0.63
166 0.61
167 0.59
168 0.56
169 0.54
170 0.53
171 0.52
172 0.47
173 0.42
174 0.35
175 0.29
176 0.27
177 0.24
178 0.18
179 0.13
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.18
186 0.19
187 0.2
188 0.23
189 0.28
190 0.29
191 0.28
192 0.33
193 0.29
194 0.34
195 0.35
196 0.33
197 0.33
198 0.32
199 0.35
200 0.28
201 0.29
202 0.26
203 0.27
204 0.3
205 0.3
206 0.34
207 0.34
208 0.35
209 0.37
210 0.43
211 0.44
212 0.45
213 0.44
214 0.41
215 0.41
216 0.39
217 0.37
218 0.32
219 0.32
220 0.27
221 0.26
222 0.26
223 0.27
224 0.27
225 0.25
226 0.26
227 0.27
228 0.27
229 0.28
230 0.25
231 0.27
232 0.28
233 0.27
234 0.26
235 0.29
236 0.35
237 0.33
238 0.33
239 0.32
240 0.34
241 0.34
242 0.32
243 0.25
244 0.22
245 0.25
246 0.26
247 0.25
248 0.26
249 0.29
250 0.31
251 0.33
252 0.3
253 0.31
254 0.3
255 0.34
256 0.34
257 0.34
258 0.36
259 0.4
260 0.45
261 0.51
262 0.52
263 0.47
264 0.46
265 0.48
266 0.47
267 0.44
268 0.41
269 0.34
270 0.36
271 0.39
272 0.38
273 0.33
274 0.34
275 0.37
276 0.37
277 0.38
278 0.38
279 0.39
280 0.41
281 0.44
282 0.43
283 0.39
284 0.37
285 0.4
286 0.42
287 0.39
288 0.36
289 0.37
290 0.4
291 0.41
292 0.41
293 0.4
294 0.39
295 0.41
296 0.44
297 0.43
298 0.39
299 0.37
300 0.4
301 0.42
302 0.39
303 0.36
304 0.35
305 0.36
306 0.37
307 0.35
308 0.34
309 0.32
310 0.35
311 0.35
312 0.35
313 0.35
314 0.35
315 0.35
316 0.36
317 0.39
318 0.39
319 0.4
320 0.41
321 0.43
322 0.43
323 0.45
324 0.44
325 0.41
326 0.44
327 0.45
328 0.46
329 0.45
330 0.44
331 0.43
332 0.42
333 0.42
334 0.38
335 0.34
336 0.3
337 0.28
338 0.26
339 0.26
340 0.23
341 0.21
342 0.21
343 0.22
344 0.22
345 0.22
346 0.22
347 0.23
348 0.27
349 0.27
350 0.3
351 0.37
352 0.39
353 0.39
354 0.39
355 0.39
356 0.35
357 0.34
358 0.34
359 0.31
360 0.34
361 0.37
362 0.34
363 0.38
364 0.43
365 0.5
366 0.47
367 0.43
368 0.44
369 0.46
370 0.54
371 0.55
372 0.55
373 0.49
374 0.48
375 0.5
376 0.49
377 0.53
378 0.46
379 0.43
380 0.45
381 0.48
382 0.51
383 0.48
384 0.47
385 0.41
386 0.42
387 0.44
388 0.41
389 0.38
390 0.36
391 0.43
392 0.42
393 0.42
394 0.42
395 0.42
396 0.42
397 0.42
398 0.43
399 0.38
400 0.33
401 0.33
402 0.35
403 0.31
404 0.31
405 0.29
406 0.32
407 0.31
408 0.33
409 0.34
410 0.33
411 0.36
412 0.37
413 0.44
414 0.43
415 0.46
416 0.45
417 0.47
418 0.45
419 0.42
420 0.41
421 0.39
422 0.41
423 0.41
424 0.44
425 0.43
426 0.44
427 0.5
428 0.46
429 0.45
430 0.39
431 0.34
432 0.32
433 0.33
434 0.31
435 0.27
436 0.29
437 0.27
438 0.25
439 0.24
440 0.22
441 0.2
442 0.23
443 0.19
444 0.2
445 0.2
446 0.25
447 0.31
448 0.33
449 0.33
450 0.31
451 0.33
452 0.33
453 0.31
454 0.3
455 0.26
456 0.23
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.23
461 0.28
462 0.29
463 0.28
464 0.32
465 0.33
466 0.34
467 0.32
468 0.29
469 0.23
470 0.18
471 0.18
472 0.15
473 0.13
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.09
490 0.14
491 0.15
492 0.17
493 0.25
494 0.33
495 0.42
496 0.48
497 0.54
498 0.59
499 0.64
500 0.73
501 0.74
502 0.76
503 0.73
504 0.75
505 0.76
506 0.66
507 0.62
508 0.53
509 0.44
510 0.35
511 0.3
512 0.22
513 0.17
514 0.17
515 0.15
516 0.16
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.12
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.07
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.06
541 0.06
542 0.07
543 0.07
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.06
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.09
583 0.15
584 0.22
585 0.3
586 0.37
587 0.46
588 0.56
589 0.67
590 0.75
591 0.8
592 0.82
593 0.83
594 0.86
595 0.84
596 0.81
597 0.8
598 0.73
599 0.69
600 0.71
601 0.66
602 0.67
603 0.69
604 0.71
605 0.71
606 0.79
607 0.82
608 0.84
609 0.89
610 0.9
611 0.89
612 0.87
613 0.83
614 0.79
615 0.7
616 0.61
617 0.52
618 0.41
619 0.32
620 0.24
621 0.18
622 0.11
623 0.09
624 0.06
625 0.05
626 0.06
627 0.06
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.09
637 0.08
638 0.07
639 0.07
640 0.06
641 0.06
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.06
646 0.08
647 0.09
648 0.12
649 0.13
650 0.16
651 0.15
652 0.16
653 0.17
654 0.21
655 0.21
656 0.19
657 0.19
658 0.18
659 0.2
660 0.22
661 0.23
662 0.25
663 0.3
664 0.4
665 0.47
666 0.56
667 0.65
668 0.73
669 0.81
670 0.85
671 0.89
672 0.89
673 0.88
674 0.85
675 0.82
676 0.82
677 0.82
678 0.76
679 0.72
680 0.65
681 0.65
682 0.68
683 0.68
684 0.67
685 0.66
686 0.71
687 0.76
688 0.83
689 0.85
690 0.84
691 0.85
692 0.81
693 0.83
694 0.83
695 0.81
696 0.78
697 0.79
698 0.81
699 0.82
700 0.84
701 0.81
702 0.76
703 0.77
704 0.74
705 0.74
706 0.71
707 0.7
708 0.67
709 0.61
710 0.55
711 0.44
712 0.39
713 0.29
714 0.21
715 0.12
716 0.07
717 0.05
718 0.05
719 0.04
720 0.04
721 0.03
722 0.03
723 0.02
724 0.02
725 0.02
726 0.03
727 0.04
728 0.05
729 0.06
730 0.07
731 0.07
732 0.1
733 0.11
734 0.12
735 0.11
736 0.11
737 0.12
738 0.15
739 0.18
740 0.19
741 0.2
742 0.23
743 0.27
744 0.3
745 0.37
746 0.35
747 0.35
748 0.37
749 0.4
750 0.39
751 0.35
752 0.34
753 0.26
754 0.29
755 0.27
756 0.29
757 0.26
758 0.31
759 0.36
760 0.41
761 0.42
762 0.41
763 0.46
764 0.47
765 0.5
766 0.46
767 0.45
768 0.49
769 0.5
770 0.56
771 0.56
772 0.58
773 0.57
774 0.58
775 0.55
776 0.49
777 0.54
778 0.48
779 0.43
780 0.4
781 0.37
782 0.33
783 0.41
784 0.4
785 0.37
786 0.36
787 0.42
788 0.36
789 0.38
790 0.44
791 0.38
792 0.34
793 0.3
794 0.3
795 0.27
796 0.31
797 0.3
798 0.25
799 0.21
800 0.21
801 0.23
802 0.26
803 0.23
804 0.26
805 0.32
806 0.37
807 0.42
808 0.43
809 0.43
810 0.41
811 0.44
812 0.39
813 0.36
814 0.31
815 0.27
816 0.26
817 0.25
818 0.32
819 0.3
820 0.28
821 0.25
822 0.27
823 0.27
824 0.28
825 0.36
826 0.29
827 0.34
828 0.38
829 0.44
830 0.42
831 0.48
832 0.47
833 0.41
834 0.45
835 0.47
836 0.45
837 0.43
838 0.45
839 0.44
840 0.48
841 0.51
842 0.46
843 0.43
844 0.45
845 0.46
846 0.47
847 0.43
848 0.39
849 0.39
850 0.37
851 0.36
852 0.37
853 0.37
854 0.34
855 0.36
856 0.35
857 0.29
858 0.33
859 0.33
860 0.32
861 0.3
862 0.35
863 0.32
864 0.34
865 0.38
866 0.37
867 0.36
868 0.42
869 0.47
870 0.43
871 0.43
872 0.43
873 0.4
874 0.38
875 0.37
876 0.34
877 0.35
878 0.37
879 0.39
880 0.41
881 0.48
882 0.51
883 0.5
884 0.51
885 0.49
886 0.56
887 0.59
888 0.58
889 0.56
890 0.56
891 0.58
892 0.51
893 0.47
894 0.39
895 0.38
896 0.37
897 0.4
898 0.42
899 0.45
900 0.45
901 0.47
902 0.49
903 0.44
904 0.49
905 0.46
906 0.49
907 0.5
908 0.56
909 0.53
910 0.58
911 0.62
912 0.63
913 0.6
914 0.62
915 0.6
916 0.6
917 0.61
918 0.59
919 0.62
920 0.6
921 0.65
922 0.62
923 0.66
924 0.67
925 0.7
926 0.69
927 0.67
928 0.64
929 0.63
930 0.6
931 0.59
932 0.58
933 0.58
934 0.54
935 0.52
936 0.49
937 0.42
938 0.41
939 0.38
940 0.33
941 0.28
942 0.32
943 0.31
944 0.32
945 0.38
946 0.37
947 0.36
948 0.35
949 0.35
950 0.31
951 0.36
952 0.38
953 0.34
954 0.38
955 0.4
956 0.44
957 0.44
958 0.47
959 0.46
960 0.48
961 0.53
962 0.52
963 0.56
964 0.6
965 0.69
966 0.68
967 0.69
968 0.66
969 0.63
970 0.65
971 0.58
972 0.52
973 0.48
974 0.54
975 0.5
976 0.47
977 0.46
978 0.46
979 0.47
980 0.45
981 0.48
982 0.47
983 0.5
984 0.54
985 0.54
986 0.59
987 0.55
988 0.54
989 0.46
990 0.45
991 0.44
992 0.47
993 0.52
994 0.47
995 0.5
996 0.51
997 0.54
998 0.51
999 0.51
1000 0.5
1001 0.48
1002 0.5
1003 0.57
1004 0.63
1005 0.65
1006 0.63
1007 0.61
1008 0.57
1009 0.51
1010 0.49
1011 0.47