Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IQD6

Protein Details
Accession A0A100IQD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-307GSEEWQKRKRRDYRIARKAAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-306KRKRRDYRIARKAA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSNMSLSDSDLSSLSSAPPSDEETGSMAIDEPVGITKYFKKESESPPPKREPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRARFNDAFPRSTPHFGPQDVERGVAESPPGDHIERLLCAFLGLVLNRKKDVDRNHYQRPLEEAIQTHASQWPKAWQGKNPLHGGRTFATMSPEERLVLLKSLILWSLASSDAIQAKIKESYKQARHEDDLNQPLSVQPWGRDGLKRRYWLIEGLDDTHFRLYREGNPALKNVTWWSIAGNIPELKAVADRLDGEKSIHSKKLSERIRNSIPRFEGSEEWQKRKRRDYRIARKAAFARPEPGFSLYEGRTRGKKLKYTYSDDEDIFSDGLPSTRRSTRNTSGISTPPEPAGPRFTASGRQIRSRAGGLYGETLLSGQREDGDAGDEGRPTRGRTTRANGYTEYDDEEMDEGSEGGQSSGNEWQGNEGEEEEDNEFEGDDEEELSGDEAVMNGEPPSLVVQLRYNKDKVPSSPNGPTEEPLQQDPKSKEDVAKPVTATGAEDALQGQPPPAVNGQSSQPDVVAKTLPDAAPAAQDVTTTDTSAKADVSQPTATETKTQTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.14
6 0.18
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.19
13 0.18
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.09
18 0.07
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.11
23 0.18
24 0.25
25 0.3
26 0.31
27 0.35
28 0.43
29 0.52
30 0.61
31 0.65
32 0.67
33 0.71
34 0.79
35 0.77
36 0.74
37 0.75
38 0.73
39 0.7
40 0.71
41 0.65
42 0.6
43 0.57
44 0.53
45 0.47
46 0.45
47 0.41
48 0.31
49 0.28
50 0.25
51 0.22
52 0.21
53 0.17
54 0.09
55 0.05
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.14
61 0.17
62 0.18
63 0.21
64 0.26
65 0.28
66 0.31
67 0.32
68 0.36
69 0.37
70 0.41
71 0.4
72 0.37
73 0.38
74 0.35
75 0.37
76 0.33
77 0.36
78 0.33
79 0.32
80 0.25
81 0.22
82 0.21
83 0.19
84 0.17
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.23
106 0.25
107 0.26
108 0.3
109 0.39
110 0.41
111 0.47
112 0.53
113 0.62
114 0.68
115 0.67
116 0.62
117 0.58
118 0.54
119 0.45
120 0.4
121 0.31
122 0.28
123 0.3
124 0.29
125 0.24
126 0.24
127 0.23
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.26
132 0.34
133 0.36
134 0.37
135 0.46
136 0.52
137 0.57
138 0.58
139 0.54
140 0.48
141 0.46
142 0.44
143 0.35
144 0.32
145 0.26
146 0.21
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.18
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.08
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.13
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.25
179 0.33
180 0.39
181 0.46
182 0.5
183 0.49
184 0.5
185 0.51
186 0.49
187 0.47
188 0.46
189 0.39
190 0.33
191 0.29
192 0.27
193 0.24
194 0.21
195 0.15
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.16
200 0.2
201 0.25
202 0.33
203 0.38
204 0.4
205 0.39
206 0.4
207 0.39
208 0.38
209 0.33
210 0.27
211 0.22
212 0.22
213 0.22
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.16
218 0.13
219 0.14
220 0.13
221 0.17
222 0.24
223 0.27
224 0.28
225 0.29
226 0.3
227 0.3
228 0.28
229 0.23
230 0.18
231 0.17
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.14
255 0.16
256 0.19
257 0.18
258 0.2
259 0.23
260 0.32
261 0.37
262 0.42
263 0.43
264 0.46
265 0.54
266 0.59
267 0.58
268 0.53
269 0.47
270 0.41
271 0.39
272 0.34
273 0.28
274 0.24
275 0.32
276 0.31
277 0.35
278 0.4
279 0.45
280 0.48
281 0.56
282 0.61
283 0.61
284 0.68
285 0.74
286 0.78
287 0.82
288 0.86
289 0.77
290 0.73
291 0.68
292 0.62
293 0.55
294 0.44
295 0.38
296 0.3
297 0.31
298 0.27
299 0.24
300 0.2
301 0.16
302 0.2
303 0.16
304 0.19
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.24
309 0.31
310 0.31
311 0.36
312 0.37
313 0.45
314 0.49
315 0.54
316 0.55
317 0.53
318 0.51
319 0.46
320 0.42
321 0.33
322 0.28
323 0.2
324 0.15
325 0.1
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.1
330 0.12
331 0.18
332 0.22
333 0.26
334 0.33
335 0.38
336 0.45
337 0.45
338 0.44
339 0.42
340 0.43
341 0.43
342 0.36
343 0.31
344 0.24
345 0.23
346 0.21
347 0.19
348 0.2
349 0.16
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.22
354 0.26
355 0.31
356 0.29
357 0.33
358 0.33
359 0.33
360 0.35
361 0.3
362 0.26
363 0.2
364 0.19
365 0.15
366 0.15
367 0.13
368 0.11
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.1
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.2
389 0.24
390 0.27
391 0.33
392 0.39
393 0.46
394 0.49
395 0.5
396 0.45
397 0.44
398 0.42
399 0.36
400 0.32
401 0.23
402 0.19
403 0.17
404 0.16
405 0.12
406 0.09
407 0.09
408 0.06
409 0.05
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.15
421 0.14
422 0.16
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.11
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.1
457 0.16
458 0.23
459 0.29
460 0.34
461 0.35
462 0.36
463 0.42
464 0.46
465 0.45
466 0.46
467 0.47
468 0.48
469 0.54
470 0.54
471 0.54
472 0.5
473 0.46
474 0.42
475 0.4
476 0.36
477 0.33
478 0.35
479 0.32
480 0.38
481 0.4
482 0.39
483 0.4
484 0.4
485 0.41
486 0.43
487 0.5
488 0.46
489 0.47
490 0.44
491 0.39
492 0.38
493 0.32
494 0.27
495 0.19
496 0.16
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.13
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.14
507 0.15
508 0.16
509 0.16
510 0.18
511 0.21
512 0.24
513 0.26
514 0.23
515 0.22
516 0.21
517 0.21
518 0.22
519 0.2
520 0.15
521 0.16
522 0.2
523 0.19
524 0.19
525 0.19
526 0.17
527 0.17
528 0.18
529 0.17
530 0.12
531 0.13
532 0.12
533 0.16
534 0.17
535 0.15
536 0.15
537 0.15
538 0.16
539 0.17
540 0.17
541 0.13
542 0.17
543 0.2
544 0.24
545 0.23
546 0.23
547 0.27
548 0.28
549 0.27
550 0.29