Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100I4U7

Protein Details
Accession A0A100I4U7    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
521-548RSIMQKKPNKLRFLDKKEKPPKDARVGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-330KRRKR
439-440AR
444-470EQLKRDKRKQLDELRKSQAKLAKKKEA
527-542KPNKLRFLDKKEKPPK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR042326  Ctk3  
IPR024637  Ctk3_C  
IPR024638  Ctk3_N  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0070692  C:CTDK-1 complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0032786  P:positive regulation of DNA-templated transcription, elongation  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12243  CTK3  
PF12350  CTK3_C  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
Amino Acid Sequences MMVDPFEVRMRFTAQLQHLNASVTSSQKAAHYALKYRDMDEDLHSCILEQLERNNMNNRANIMYFIEQFCDMATKEDHAPYVRMIQRDILRIVDCVAPADGSGAANVKHVRRVLNGLQSKEILSAETIAEIDAGLKDRETHPAHLDLEAEEGGAGGDGGGDARSKHGTPRGSKSSGMRVDKRQIEQRIEEDRERNKRLRESMWTVSGDDGDEHGKFWDEASDIGEDDFLAANEEVMERRQMIAKGLFSRQDSDESSPKNLRPTTTTTTSSGAPSENTSKMVTATRQRKFPAEKQQPSTEPEVNGSNGKRKSEPVGAEPTETQSKNKRRKRSSLEATTQESQSKPSSNKKSKKMTESTEEPEQQQQEEEKKPSAAPAPKKHFRFDSEEPEIPEVAAIEETTEAQQDEDDDSSDDDEAPETVDNSAQLSKMRMEAKKQERARQIEEQLKRDKRKQLDELRKSQAKLAKKKEAKAEDLLSESTETLQGTTTQDARRSALPALLPDDILNAAPDVRPPTPPAEERSIMQKKPNKLRFLDKKEKPPKDARVGDVTIRVLDDGVSKNPSKTVLPPKASKTGRNAKQNWLNKSRNTGALNGLRRTTGGSSGFVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.41
3 0.42
4 0.42
5 0.39
6 0.38
7 0.36
8 0.3
9 0.26
10 0.2
11 0.2
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.21
16 0.2
17 0.25
18 0.27
19 0.33
20 0.38
21 0.46
22 0.46
23 0.44
24 0.46
25 0.42
26 0.39
27 0.36
28 0.34
29 0.28
30 0.27
31 0.25
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.17
38 0.25
39 0.28
40 0.31
41 0.37
42 0.42
43 0.43
44 0.43
45 0.43
46 0.37
47 0.35
48 0.33
49 0.3
50 0.27
51 0.26
52 0.24
53 0.23
54 0.2
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.18
63 0.2
64 0.23
65 0.22
66 0.23
67 0.21
68 0.29
69 0.3
70 0.29
71 0.28
72 0.32
73 0.34
74 0.37
75 0.37
76 0.31
77 0.28
78 0.26
79 0.27
80 0.23
81 0.19
82 0.16
83 0.15
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.09
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.12
93 0.16
94 0.16
95 0.2
96 0.22
97 0.24
98 0.25
99 0.32
100 0.34
101 0.4
102 0.45
103 0.42
104 0.42
105 0.41
106 0.39
107 0.33
108 0.28
109 0.18
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.1
125 0.19
126 0.21
127 0.24
128 0.25
129 0.29
130 0.3
131 0.29
132 0.28
133 0.2
134 0.19
135 0.16
136 0.13
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.13
153 0.19
154 0.25
155 0.3
156 0.39
157 0.44
158 0.45
159 0.47
160 0.47
161 0.51
162 0.52
163 0.54
164 0.51
165 0.5
166 0.55
167 0.58
168 0.59
169 0.58
170 0.56
171 0.54
172 0.51
173 0.51
174 0.51
175 0.49
176 0.49
177 0.47
178 0.49
179 0.53
180 0.56
181 0.55
182 0.53
183 0.55
184 0.56
185 0.53
186 0.53
187 0.51
188 0.5
189 0.49
190 0.45
191 0.39
192 0.34
193 0.3
194 0.23
195 0.16
196 0.12
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.07
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.04
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.16
231 0.19
232 0.2
233 0.23
234 0.21
235 0.23
236 0.21
237 0.22
238 0.21
239 0.22
240 0.25
241 0.24
242 0.27
243 0.28
244 0.28
245 0.31
246 0.3
247 0.28
248 0.26
249 0.31
250 0.33
251 0.34
252 0.35
253 0.31
254 0.32
255 0.31
256 0.28
257 0.22
258 0.17
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.21
270 0.29
271 0.31
272 0.34
273 0.35
274 0.4
275 0.44
276 0.49
277 0.52
278 0.53
279 0.56
280 0.57
281 0.61
282 0.57
283 0.54
284 0.52
285 0.43
286 0.32
287 0.28
288 0.24
289 0.21
290 0.21
291 0.19
292 0.21
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.21
297 0.24
298 0.27
299 0.28
300 0.24
301 0.29
302 0.28
303 0.28
304 0.27
305 0.26
306 0.25
307 0.24
308 0.23
309 0.25
310 0.34
311 0.44
312 0.51
313 0.59
314 0.61
315 0.7
316 0.77
317 0.78
318 0.79
319 0.77
320 0.76
321 0.71
322 0.68
323 0.6
324 0.52
325 0.44
326 0.34
327 0.27
328 0.23
329 0.22
330 0.22
331 0.3
332 0.39
333 0.48
334 0.56
335 0.62
336 0.7
337 0.72
338 0.77
339 0.74
340 0.68
341 0.64
342 0.62
343 0.58
344 0.54
345 0.49
346 0.42
347 0.39
348 0.35
349 0.28
350 0.24
351 0.23
352 0.23
353 0.26
354 0.27
355 0.24
356 0.25
357 0.24
358 0.25
359 0.29
360 0.3
361 0.34
362 0.41
363 0.49
364 0.56
365 0.58
366 0.59
367 0.56
368 0.53
369 0.53
370 0.49
371 0.49
372 0.48
373 0.48
374 0.46
375 0.43
376 0.39
377 0.3
378 0.25
379 0.16
380 0.09
381 0.07
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.11
415 0.15
416 0.22
417 0.22
418 0.27
419 0.37
420 0.44
421 0.52
422 0.56
423 0.6
424 0.62
425 0.66
426 0.67
427 0.65
428 0.64
429 0.63
430 0.64
431 0.62
432 0.63
433 0.66
434 0.67
435 0.66
436 0.67
437 0.66
438 0.69
439 0.72
440 0.73
441 0.76
442 0.78
443 0.79
444 0.8
445 0.77
446 0.69
447 0.65
448 0.6
449 0.58
450 0.59
451 0.6
452 0.62
453 0.63
454 0.68
455 0.71
456 0.71
457 0.66
458 0.62
459 0.57
460 0.48
461 0.44
462 0.39
463 0.3
464 0.25
465 0.2
466 0.15
467 0.13
468 0.11
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.13
474 0.18
475 0.19
476 0.23
477 0.25
478 0.26
479 0.27
480 0.27
481 0.26
482 0.24
483 0.22
484 0.2
485 0.22
486 0.2
487 0.19
488 0.16
489 0.16
490 0.13
491 0.12
492 0.1
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.1
497 0.13
498 0.14
499 0.16
500 0.18
501 0.23
502 0.28
503 0.31
504 0.34
505 0.37
506 0.37
507 0.37
508 0.45
509 0.48
510 0.44
511 0.5
512 0.51
513 0.54
514 0.64
515 0.71
516 0.67
517 0.64
518 0.73
519 0.75
520 0.79
521 0.8
522 0.77
523 0.81
524 0.84
525 0.87
526 0.84
527 0.82
528 0.81
529 0.81
530 0.79
531 0.72
532 0.69
533 0.65
534 0.6
535 0.54
536 0.46
537 0.36
538 0.3
539 0.25
540 0.17
541 0.15
542 0.16
543 0.14
544 0.17
545 0.21
546 0.22
547 0.23
548 0.24
549 0.26
550 0.25
551 0.31
552 0.39
553 0.44
554 0.49
555 0.55
556 0.59
557 0.67
558 0.69
559 0.66
560 0.65
561 0.66
562 0.68
563 0.72
564 0.71
565 0.71
566 0.77
567 0.79
568 0.78
569 0.77
570 0.76
571 0.7
572 0.74
573 0.69
574 0.67
575 0.61
576 0.54
577 0.53
578 0.54
579 0.57
580 0.52
581 0.48
582 0.4
583 0.38
584 0.39
585 0.32
586 0.3
587 0.25
588 0.25