Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IRF0

Protein Details
Accession A0A100IRF0    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-68TKSSQSPKAKSKQIAREVASKEKKDKKKKKEPTPSESSESHydrophilic
86-108SEDEKPAKKTEKKGKKVESESESBasic
134-154EEKPAKKTKEEPKKAAKKAESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-59KSSQSPKAKSKQIAREVASKEKKDKKKKKE
92-101AKKTEKKGKK
136-151KPAKKTKEEPKKAAKK
263-264KR
482-527GGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGFGDRGGRGRGGFGGRGGGAPNKARG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVTKKGSEKPVDKTLSKVKSAGVTKSSQSPKAKSKQIAREVASKEKKDKKKKKEPTPSESSESESDSDEEMASDSSSSSESEDEKPAKKTEKKGKKVESESESSESESESSDSDSDEEMNDASSSESEEEKPAKKTKEEPKKAAKKAESSDSESESSDSDSESEDEKLAKKETKKAESESESSDSDSDSESEEEAPKKAAKKESSESDSDSDSDSESEEETKEKKAEKESSDSSDSDSDSSDSDSDSESEESEKPSKKRKAEEETSATPKKSKTEDPAPGASANLFVGNLSWNVDEAWLQSEFESFGELSGVRIMTERDTGRSRGFGYVEYTNAVDAAKAFEAKKGAEIDGRVINLDYATGRPANKDQQGGFKDRANARARSFGDQASPESDTLFVGNLPFDANEDSVGELFGEKGSILGIRLPTDPDSGRPKGFGYVQYSSVDEARAAFNELQGADLLGRPVRLDFSTPRANNGGGGGGRGGGRGGFGGRGGGRGGFGDRGGRGRGGFGGRGGGAPNKARGGIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.78
3 0.75
4 0.66
5 0.64
6 0.63
7 0.59
8 0.56
9 0.51
10 0.44
11 0.45
12 0.48
13 0.47
14 0.42
15 0.39
16 0.39
17 0.47
18 0.5
19 0.5
20 0.53
21 0.54
22 0.6
23 0.65
24 0.72
25 0.71
26 0.75
27 0.76
28 0.79
29 0.8
30 0.74
31 0.74
32 0.7
33 0.72
34 0.71
35 0.66
36 0.66
37 0.68
38 0.75
39 0.78
40 0.83
41 0.84
42 0.87
43 0.92
44 0.93
45 0.94
46 0.94
47 0.92
48 0.91
49 0.86
50 0.8
51 0.7
52 0.64
53 0.54
54 0.46
55 0.38
56 0.3
57 0.25
58 0.2
59 0.2
60 0.15
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.12
73 0.15
74 0.22
75 0.26
76 0.29
77 0.33
78 0.37
79 0.45
80 0.49
81 0.56
82 0.6
83 0.67
84 0.72
85 0.79
86 0.83
87 0.84
88 0.84
89 0.83
90 0.78
91 0.72
92 0.66
93 0.59
94 0.51
95 0.41
96 0.34
97 0.26
98 0.2
99 0.16
100 0.12
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.1
119 0.1
120 0.14
121 0.18
122 0.21
123 0.26
124 0.32
125 0.34
126 0.36
127 0.44
128 0.51
129 0.58
130 0.64
131 0.68
132 0.72
133 0.79
134 0.82
135 0.82
136 0.76
137 0.72
138 0.67
139 0.67
140 0.61
141 0.56
142 0.53
143 0.47
144 0.43
145 0.36
146 0.32
147 0.24
148 0.2
149 0.14
150 0.11
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.15
160 0.18
161 0.22
162 0.24
163 0.32
164 0.39
165 0.45
166 0.46
167 0.48
168 0.52
169 0.51
170 0.5
171 0.46
172 0.41
173 0.34
174 0.31
175 0.27
176 0.2
177 0.16
178 0.14
179 0.1
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.14
188 0.15
189 0.19
190 0.23
191 0.29
192 0.3
193 0.35
194 0.39
195 0.44
196 0.46
197 0.44
198 0.41
199 0.36
200 0.33
201 0.28
202 0.24
203 0.17
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.12
214 0.14
215 0.16
216 0.19
217 0.24
218 0.3
219 0.31
220 0.36
221 0.37
222 0.39
223 0.39
224 0.36
225 0.32
226 0.27
227 0.24
228 0.18
229 0.16
230 0.12
231 0.09
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.12
244 0.16
245 0.2
246 0.22
247 0.32
248 0.39
249 0.41
250 0.48
251 0.54
252 0.58
253 0.59
254 0.63
255 0.59
256 0.57
257 0.59
258 0.55
259 0.46
260 0.4
261 0.35
262 0.32
263 0.29
264 0.28
265 0.28
266 0.34
267 0.4
268 0.42
269 0.42
270 0.4
271 0.36
272 0.32
273 0.26
274 0.18
275 0.12
276 0.07
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.11
309 0.11
310 0.14
311 0.16
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.2
316 0.19
317 0.19
318 0.17
319 0.18
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.14
324 0.12
325 0.11
326 0.1
327 0.06
328 0.05
329 0.07
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.14
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.17
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.07
350 0.06
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.12
355 0.16
356 0.22
357 0.25
358 0.28
359 0.28
360 0.35
361 0.38
362 0.41
363 0.39
364 0.36
365 0.4
366 0.38
367 0.45
368 0.42
369 0.42
370 0.39
371 0.45
372 0.44
373 0.42
374 0.42
375 0.34
376 0.32
377 0.29
378 0.29
379 0.24
380 0.23
381 0.18
382 0.16
383 0.16
384 0.12
385 0.11
386 0.1
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.08
412 0.09
413 0.11
414 0.12
415 0.14
416 0.15
417 0.18
418 0.18
419 0.21
420 0.28
421 0.29
422 0.3
423 0.29
424 0.28
425 0.28
426 0.31
427 0.31
428 0.3
429 0.29
430 0.31
431 0.31
432 0.31
433 0.28
434 0.26
435 0.21
436 0.15
437 0.13
438 0.12
439 0.12
440 0.15
441 0.13
442 0.13
443 0.15
444 0.15
445 0.14
446 0.12
447 0.12
448 0.09
449 0.1
450 0.11
451 0.09
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.12
456 0.12
457 0.16
458 0.18
459 0.24
460 0.34
461 0.34
462 0.37
463 0.37
464 0.37
465 0.33
466 0.31
467 0.28
468 0.18
469 0.19
470 0.15
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.13
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.14
489 0.12
490 0.13
491 0.15
492 0.16
493 0.19
494 0.21
495 0.22
496 0.2
497 0.2
498 0.24
499 0.24
500 0.23
501 0.21
502 0.22
503 0.2
504 0.21
505 0.21
506 0.21
507 0.22
508 0.24
509 0.27
510 0.26
511 0.27
512 0.26
513 0.28
514 0.31
515 0.35
516 0.35
517 0.4
518 0.41
519 0.43