Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G3JV16

Protein Details
Accession G3JV16    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-36SPEPVTPKADKKAKKSHKSDKKRSREEDAAVBasic
56-114EHEDVAGKKEKKKKKSKQDSTVDGDKAEQKKSKKKHVDSEKKSERKKKKSKTDSDDVVVBasic
384-410EGHALKMRRNTKTNRRLERRRAPEFSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-47KADKKAKKSHKSDKKRSREEDAAVDPEERKHKKSK
62-106GKKEKKKKKSKQDSTVDGDKAEQKKSKKKHVDSEKKSERKKKKSK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG cmt:CCM_09653  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPAAASPEPVTPKADKKAKKSHKSDKKRSREEDAAVDPEERKHKKSKSVSADASNEHEDVAGKKEKKKKKSKQDSTVDGDKAEQKKSKKKHVDSEKKSERKKKKSKTDSDDVVVIVTDAEDGMAQSQLEIVSAQAADDFMDLDEPATNYISNIYQPPDIPAEPQFPFFSQTVSLYEPIYPIGWAQPVTNCEYHYLRHLQNKYVPSLRGVLMNYKNVTLGDEPGRVGAATNDEEETTLKSQREFGVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPSWKWVSNEDPEAEGMEETASIVAPDEHGVVHQIHSTGFWVDAHGDKVKGKIRFRIRNFDVGVSGETTYLSLEGTMLDKASEKTLVQQEGHALKMRRNTKTNRRLERRRAPEFSMTRFFSEEEKQAHEKREAAKAAAQAERAAAAAEEETAAATSEGTKIVFDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.54
3 0.6
4 0.7
5 0.76
6 0.82
7 0.85
8 0.87
9 0.89
10 0.93
11 0.94
12 0.94
13 0.94
14 0.94
15 0.91
16 0.89
17 0.85
18 0.79
19 0.76
20 0.7
21 0.63
22 0.54
23 0.49
24 0.41
25 0.39
26 0.44
27 0.4
28 0.39
29 0.45
30 0.5
31 0.58
32 0.66
33 0.71
34 0.71
35 0.77
36 0.78
37 0.76
38 0.74
39 0.66
40 0.61
41 0.53
42 0.43
43 0.33
44 0.27
45 0.21
46 0.18
47 0.21
48 0.25
49 0.27
50 0.35
51 0.45
52 0.54
53 0.64
54 0.73
55 0.78
56 0.81
57 0.88
58 0.91
59 0.92
60 0.93
61 0.9
62 0.87
63 0.84
64 0.74
65 0.63
66 0.54
67 0.51
68 0.45
69 0.43
70 0.41
71 0.41
72 0.5
73 0.58
74 0.66
75 0.7
76 0.74
77 0.78
78 0.84
79 0.87
80 0.86
81 0.89
82 0.89
83 0.87
84 0.88
85 0.88
86 0.87
87 0.87
88 0.9
89 0.89
90 0.9
91 0.92
92 0.93
93 0.91
94 0.9
95 0.85
96 0.77
97 0.67
98 0.56
99 0.45
100 0.34
101 0.25
102 0.15
103 0.09
104 0.06
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.19
149 0.19
150 0.21
151 0.2
152 0.17
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.1
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.19
181 0.23
182 0.23
183 0.3
184 0.32
185 0.32
186 0.37
187 0.38
188 0.38
189 0.36
190 0.33
191 0.26
192 0.27
193 0.24
194 0.21
195 0.19
196 0.22
197 0.21
198 0.24
199 0.23
200 0.2
201 0.2
202 0.17
203 0.18
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.1
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.16
229 0.15
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.12
274 0.13
275 0.14
276 0.17
277 0.22
278 0.22
279 0.25
280 0.25
281 0.23
282 0.24
283 0.31
284 0.34
285 0.34
286 0.36
287 0.38
288 0.42
289 0.43
290 0.44
291 0.36
292 0.31
293 0.27
294 0.25
295 0.2
296 0.14
297 0.1
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.2
330 0.25
331 0.31
332 0.33
333 0.39
334 0.48
335 0.56
336 0.61
337 0.66
338 0.64
339 0.66
340 0.64
341 0.57
342 0.48
343 0.4
344 0.35
345 0.26
346 0.22
347 0.14
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.07
352 0.06
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.08
361 0.09
362 0.11
363 0.12
364 0.11
365 0.17
366 0.23
367 0.27
368 0.26
369 0.26
370 0.31
371 0.31
372 0.34
373 0.33
374 0.28
375 0.28
376 0.36
377 0.43
378 0.44
379 0.5
380 0.58
381 0.63
382 0.73
383 0.8
384 0.82
385 0.85
386 0.89
387 0.91
388 0.92
389 0.91
390 0.89
391 0.84
392 0.79
393 0.78
394 0.73
395 0.69
396 0.66
397 0.59
398 0.51
399 0.47
400 0.43
401 0.37
402 0.36
403 0.36
404 0.31
405 0.35
406 0.4
407 0.43
408 0.47
409 0.47
410 0.47
411 0.46
412 0.51
413 0.48
414 0.44
415 0.43
416 0.42
417 0.44
418 0.42
419 0.38
420 0.29
421 0.27
422 0.25
423 0.2
424 0.16
425 0.11
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09