Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A117E3C5

Protein Details
Accession A0A117E3C5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-43ASNSNSSTPRPRRGRGRGGRGRQTANSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-38RPRRGRGRGGRGR
77-102PRPPRGPRGGNKRGGRGAGASRRPRG
173-181RGKGKSKAK
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
Amino Acid Sequences MSATSAAPAPAPAAVGASNSNSSTPRPRRGRGRGGRGRQTANSAQAQTQTQTQAAPDAQPHTQRQPPTETTPNGDAPRPPRGPRGGNKRGGRGAGASRRPRGGDQATLPAGRTFGGRLTRPEQEQDGQAIPGGDGVDEAGLRADAPVFVPGVVPQQPREEVPNGAASASGTGRGKGKSKAKNNGSNSGGNQKQPRSQPPPPPAKVTTKSTASDIATRIHEDIAHNLYECPICTSELGKRSRVWSCGLCWTVFHLSCVKKWSRNEGAAAAQRQDGENGESSAPRAWRCPGCNLPQEVFPSTYTCWCEKEVDPRSFPGLPPHSCGQTCARTRKGCPHPCDATCHAGPCAPCTAMGPTQDCFCGRNSSTKRCQDTDYENGWSCGEICGDLLPCGEHTCPRPCHEGLCGSCEERIEARCYCGKVQTEMLCSSKDEELDSELMREDDIEEWTGCFSCGDECSRPFDCGVHFCQKSCHAQVAHPAHCPRSPDVVFDCPCGKTPLDQIAGYSPRTSCEDPIPNCTKPCGKPLACGHPCTKVCHTGSCGPCFQNVPIECRCGRNTFTTMCPQGEMEPPQCFRICKAGLHCGRHACTERCCPGEQKAIERQAIRRKLKSHLRPSDEDFEAEHICTRVCGRMLKCGRHTCPEICHKGPCNTCREAIFEEIPCNCGRSILHPPLPCGTQPPACSFPCERPKPCGHPQTSHNCHTDDESCPKCPYLTEKTCLCGKKVLKNQPCWLADARCGQVCGQLLKCGSHTCQKHCHRPGECEDATKPCEQACGKTKTMCGHPCTDPCHAPYPCPEKTPCKSMITVTCDCGRLRQERRCNAAKAVVSKGQLQQAQRGPAVTPLSCDDECARLERNRSLASALGVDINPTTTVSQSLTSTNLPYSAETLDIYIQLSSSHPLSTLQTIESTLHTLATTPTERSTRFQPAKSSLRAFTHSLAADWGFASESFDPEPHRHVFVLKSTLWTPPVFGTGNGMAIGIGGMSVGDCVKLRDRQRLKEQEAQRLAAAEAKAQREAARAHNNGSSEGGWAQVAASKRSNLVLGAGRTSAPSSASTSGTATPAAVAPWSSSTMYAALDRDVGDAAQPKKEKLVLRSGVKGSRSQGSSVEREKEGSTASGGDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.11
4 0.12
5 0.14
6 0.14
7 0.16
8 0.16
9 0.2
10 0.3
11 0.37
12 0.45
13 0.51
14 0.59
15 0.69
16 0.77
17 0.84
18 0.84
19 0.87
20 0.87
21 0.89
22 0.91
23 0.87
24 0.83
25 0.74
26 0.71
27 0.66
28 0.61
29 0.57
30 0.49
31 0.44
32 0.42
33 0.42
34 0.36
35 0.35
36 0.31
37 0.25
38 0.24
39 0.22
40 0.23
41 0.22
42 0.23
43 0.22
44 0.23
45 0.26
46 0.32
47 0.37
48 0.39
49 0.44
50 0.46
51 0.47
52 0.51
53 0.53
54 0.54
55 0.58
56 0.54
57 0.54
58 0.54
59 0.56
60 0.51
61 0.48
62 0.46
63 0.42
64 0.49
65 0.49
66 0.47
67 0.49
68 0.54
69 0.6
70 0.64
71 0.7
72 0.7
73 0.74
74 0.77
75 0.76
76 0.73
77 0.66
78 0.58
79 0.52
80 0.51
81 0.51
82 0.55
83 0.55
84 0.54
85 0.56
86 0.57
87 0.54
88 0.53
89 0.48
90 0.45
91 0.41
92 0.45
93 0.44
94 0.42
95 0.41
96 0.33
97 0.29
98 0.22
99 0.2
100 0.13
101 0.15
102 0.21
103 0.22
104 0.28
105 0.32
106 0.38
107 0.39
108 0.42
109 0.42
110 0.38
111 0.38
112 0.36
113 0.33
114 0.27
115 0.26
116 0.22
117 0.17
118 0.15
119 0.13
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.12
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.24
143 0.25
144 0.27
145 0.31
146 0.29
147 0.25
148 0.26
149 0.28
150 0.24
151 0.22
152 0.2
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.15
157 0.11
158 0.13
159 0.17
160 0.19
161 0.23
162 0.29
163 0.38
164 0.44
165 0.53
166 0.62
167 0.68
168 0.75
169 0.77
170 0.77
171 0.72
172 0.67
173 0.6
174 0.59
175 0.53
176 0.49
177 0.5
178 0.46
179 0.48
180 0.51
181 0.58
182 0.57
183 0.62
184 0.66
185 0.7
186 0.76
187 0.73
188 0.73
189 0.68
190 0.68
191 0.65
192 0.62
193 0.58
194 0.52
195 0.5
196 0.45
197 0.45
198 0.37
199 0.36
200 0.31
201 0.29
202 0.26
203 0.26
204 0.25
205 0.21
206 0.21
207 0.18
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.16
221 0.2
222 0.27
223 0.3
224 0.3
225 0.32
226 0.36
227 0.4
228 0.39
229 0.38
230 0.33
231 0.33
232 0.38
233 0.38
234 0.32
235 0.28
236 0.3
237 0.33
238 0.3
239 0.28
240 0.27
241 0.27
242 0.29
243 0.36
244 0.36
245 0.36
246 0.4
247 0.47
248 0.48
249 0.5
250 0.5
251 0.46
252 0.47
253 0.47
254 0.45
255 0.37
256 0.31
257 0.28
258 0.25
259 0.23
260 0.18
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.16
270 0.17
271 0.21
272 0.26
273 0.28
274 0.35
275 0.39
276 0.43
277 0.49
278 0.51
279 0.47
280 0.45
281 0.46
282 0.4
283 0.35
284 0.29
285 0.25
286 0.22
287 0.24
288 0.24
289 0.22
290 0.22
291 0.22
292 0.25
293 0.25
294 0.34
295 0.39
296 0.41
297 0.41
298 0.41
299 0.44
300 0.41
301 0.39
302 0.38
303 0.36
304 0.32
305 0.35
306 0.35
307 0.34
308 0.33
309 0.35
310 0.32
311 0.33
312 0.39
313 0.42
314 0.47
315 0.48
316 0.51
317 0.58
318 0.64
319 0.64
320 0.62
321 0.63
322 0.62
323 0.59
324 0.63
325 0.57
326 0.52
327 0.44
328 0.41
329 0.33
330 0.28
331 0.27
332 0.22
333 0.21
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.19
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.18
345 0.16
346 0.15
347 0.19
348 0.18
349 0.27
350 0.33
351 0.4
352 0.49
353 0.56
354 0.59
355 0.55
356 0.57
357 0.52
358 0.52
359 0.51
360 0.45
361 0.41
362 0.37
363 0.36
364 0.33
365 0.27
366 0.21
367 0.15
368 0.11
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.14
381 0.21
382 0.24
383 0.27
384 0.32
385 0.31
386 0.32
387 0.32
388 0.35
389 0.29
390 0.3
391 0.29
392 0.24
393 0.24
394 0.22
395 0.21
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.15
400 0.17
401 0.2
402 0.22
403 0.22
404 0.25
405 0.24
406 0.23
407 0.27
408 0.27
409 0.27
410 0.28
411 0.28
412 0.23
413 0.22
414 0.22
415 0.18
416 0.16
417 0.13
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.07
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.18
444 0.19
445 0.2
446 0.19
447 0.19
448 0.17
449 0.18
450 0.22
451 0.26
452 0.25
453 0.25
454 0.27
455 0.3
456 0.33
457 0.31
458 0.31
459 0.24
460 0.24
461 0.33
462 0.38
463 0.36
464 0.36
465 0.35
466 0.32
467 0.33
468 0.34
469 0.28
470 0.28
471 0.26
472 0.24
473 0.26
474 0.31
475 0.3
476 0.29
477 0.29
478 0.22
479 0.22
480 0.22
481 0.19
482 0.14
483 0.16
484 0.2
485 0.21
486 0.2
487 0.19
488 0.22
489 0.23
490 0.22
491 0.2
492 0.14
493 0.14
494 0.17
495 0.18
496 0.15
497 0.18
498 0.25
499 0.25
500 0.33
501 0.37
502 0.35
503 0.34
504 0.35
505 0.35
506 0.29
507 0.33
508 0.34
509 0.3
510 0.34
511 0.39
512 0.48
513 0.44
514 0.46
515 0.43
516 0.42
517 0.43
518 0.41
519 0.38
520 0.33
521 0.32
522 0.31
523 0.34
524 0.33
525 0.34
526 0.33
527 0.33
528 0.27
529 0.27
530 0.26
531 0.23
532 0.22
533 0.2
534 0.22
535 0.21
536 0.24
537 0.23
538 0.25
539 0.27
540 0.22
541 0.23
542 0.22
543 0.23
544 0.22
545 0.23
546 0.25
547 0.25
548 0.23
549 0.21
550 0.18
551 0.17
552 0.18
553 0.18
554 0.16
555 0.17
556 0.17
557 0.19
558 0.19
559 0.18
560 0.16
561 0.21
562 0.2
563 0.19
564 0.22
565 0.29
566 0.33
567 0.36
568 0.38
569 0.33
570 0.33
571 0.34
572 0.36
573 0.29
574 0.28
575 0.31
576 0.32
577 0.31
578 0.31
579 0.29
580 0.29
581 0.34
582 0.31
583 0.3
584 0.34
585 0.36
586 0.37
587 0.37
588 0.39
589 0.4
590 0.48
591 0.48
592 0.45
593 0.44
594 0.49
595 0.57
596 0.62
597 0.63
598 0.62
599 0.64
600 0.63
601 0.65
602 0.63
603 0.53
604 0.44
605 0.34
606 0.28
607 0.23
608 0.19
609 0.15
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.09
614 0.08
615 0.09
616 0.14
617 0.14
618 0.24
619 0.29
620 0.34
621 0.4
622 0.46
623 0.47
624 0.47
625 0.5
626 0.42
627 0.44
628 0.47
629 0.46
630 0.41
631 0.43
632 0.42
633 0.45
634 0.48
635 0.46
636 0.43
637 0.39
638 0.39
639 0.35
640 0.35
641 0.3
642 0.27
643 0.25
644 0.2
645 0.21
646 0.19
647 0.2
648 0.16
649 0.16
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.13
654 0.21
655 0.26
656 0.31
657 0.31
658 0.32
659 0.33
660 0.34
661 0.29
662 0.25
663 0.22
664 0.2
665 0.21
666 0.24
667 0.27
668 0.26
669 0.3
670 0.28
671 0.34
672 0.4
673 0.46
674 0.43
675 0.45
676 0.51
677 0.55
678 0.62
679 0.62
680 0.56
681 0.54
682 0.59
683 0.63
684 0.63
685 0.61
686 0.54
687 0.46
688 0.43
689 0.41
690 0.36
691 0.3
692 0.31
693 0.28
694 0.29
695 0.28
696 0.28
697 0.25
698 0.24
699 0.26
700 0.28
701 0.31
702 0.33
703 0.33
704 0.36
705 0.42
706 0.42
707 0.37
708 0.34
709 0.33
710 0.38
711 0.46
712 0.53
713 0.55
714 0.6
715 0.64
716 0.65
717 0.62
718 0.56
719 0.5
720 0.41
721 0.38
722 0.36
723 0.33
724 0.25
725 0.25
726 0.22
727 0.21
728 0.21
729 0.2
730 0.16
731 0.17
732 0.17
733 0.18
734 0.19
735 0.17
736 0.18
737 0.23
738 0.26
739 0.28
740 0.38
741 0.44
742 0.54
743 0.59
744 0.66
745 0.61
746 0.64
747 0.65
748 0.64
749 0.57
750 0.51
751 0.45
752 0.41
753 0.4
754 0.35
755 0.3
756 0.2
757 0.25
758 0.22
759 0.27
760 0.3
761 0.34
762 0.35
763 0.37
764 0.4
765 0.38
766 0.46
767 0.45
768 0.4
769 0.39
770 0.41
771 0.42
772 0.44
773 0.44
774 0.39
775 0.36
776 0.41
777 0.36
778 0.34
779 0.38
780 0.41
781 0.38
782 0.4
783 0.41
784 0.41
785 0.45
786 0.49
787 0.46
788 0.42
789 0.41
790 0.41
791 0.45
792 0.43
793 0.41
794 0.38
795 0.36
796 0.35
797 0.33
798 0.33
799 0.3
800 0.32
801 0.39
802 0.46
803 0.53
804 0.58
805 0.66
806 0.68
807 0.66
808 0.6
809 0.58
810 0.52
811 0.46
812 0.43
813 0.4
814 0.35
815 0.35
816 0.35
817 0.34
818 0.34
819 0.32
820 0.34
821 0.35
822 0.37
823 0.34
824 0.32
825 0.27
826 0.28
827 0.29
828 0.22
829 0.19
830 0.18
831 0.23
832 0.22
833 0.23
834 0.2
835 0.2
836 0.2
837 0.21
838 0.24
839 0.21
840 0.26
841 0.27
842 0.31
843 0.29
844 0.29
845 0.28
846 0.25
847 0.22
848 0.19
849 0.16
850 0.14
851 0.12
852 0.11
853 0.1
854 0.1
855 0.09
856 0.08
857 0.09
858 0.07
859 0.08
860 0.09
861 0.1
862 0.11
863 0.12
864 0.14
865 0.14
866 0.15
867 0.14
868 0.15
869 0.14
870 0.13
871 0.14
872 0.12
873 0.12
874 0.1
875 0.11
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.08
880 0.07
881 0.07
882 0.08
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.09
887 0.1
888 0.12
889 0.14
890 0.15
891 0.13
892 0.13
893 0.14
894 0.15
895 0.15
896 0.15
897 0.12
898 0.12
899 0.11
900 0.11
901 0.11
902 0.14
903 0.15
904 0.14
905 0.18
906 0.21
907 0.23
908 0.26
909 0.31
910 0.37
911 0.41
912 0.43
913 0.47
914 0.51
915 0.57
916 0.6
917 0.59
918 0.53
919 0.51
920 0.51
921 0.47
922 0.4
923 0.38
924 0.32
925 0.28
926 0.25
927 0.21
928 0.18
929 0.15
930 0.13
931 0.09
932 0.08
933 0.11
934 0.1
935 0.12
936 0.12
937 0.13
938 0.17
939 0.18
940 0.23
941 0.22
942 0.24
943 0.23
944 0.24
945 0.26
946 0.28
947 0.32
948 0.28
949 0.29
950 0.28
951 0.31
952 0.31
953 0.28
954 0.24
955 0.19
956 0.23
957 0.19
958 0.18
959 0.2
960 0.18
961 0.19
962 0.17
963 0.16
964 0.11
965 0.1
966 0.1
967 0.05
968 0.04
969 0.03
970 0.02
971 0.02
972 0.03
973 0.03
974 0.04
975 0.05
976 0.08
977 0.13
978 0.21
979 0.26
980 0.36
981 0.44
982 0.53
983 0.63
984 0.71
985 0.73
986 0.76
987 0.78
988 0.77
989 0.74
990 0.67
991 0.57
992 0.48
993 0.41
994 0.36
995 0.29
996 0.24
997 0.24
998 0.25
999 0.25
1000 0.25
1001 0.25
1002 0.25
1003 0.28
1004 0.32
1005 0.36
1006 0.36
1007 0.38
1008 0.4
1009 0.4
1010 0.37
1011 0.36
1012 0.28
1013 0.2
1014 0.19
1015 0.16
1016 0.13
1017 0.11
1018 0.1
1019 0.11
1020 0.14
1021 0.15
1022 0.18
1023 0.18
1024 0.2
1025 0.21
1026 0.22
1027 0.19
1028 0.21
1029 0.23
1030 0.22
1031 0.23
1032 0.23
1033 0.22
1034 0.22
1035 0.22
1036 0.19
1037 0.14
1038 0.14
1039 0.16
1040 0.17
1041 0.19
1042 0.19
1043 0.2
1044 0.21
1045 0.2
1046 0.19
1047 0.15
1048 0.13
1049 0.12
1050 0.11
1051 0.1
1052 0.09
1053 0.09
1054 0.11
1055 0.14
1056 0.13
1057 0.13
1058 0.14
1059 0.14
1060 0.15
1061 0.16
1062 0.15
1063 0.13
1064 0.14
1065 0.14
1066 0.14
1067 0.13
1068 0.12
1069 0.13
1070 0.19
1071 0.2
1072 0.27
1073 0.28
1074 0.28
1075 0.32
1076 0.38
1077 0.41
1078 0.4
1079 0.48
1080 0.49
1081 0.53
1082 0.59
1083 0.61
1084 0.61
1085 0.57
1086 0.56
1087 0.5
1088 0.49
1089 0.45
1090 0.4
1091 0.4
1092 0.41
1093 0.46
1094 0.48
1095 0.5
1096 0.43
1097 0.43
1098 0.42
1099 0.38
1100 0.33
1101 0.27
1102 0.22