Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100IHH9

Protein Details
Accession A0A100IHH9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
689-711ELSQRPYKTLRYHRKAIRAVKFHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-269KRRFVPSKHEAKRVMK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.833, cyto_mito 5.833, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028598  BOP1/Erb1  
IPR012953  BOP1_N_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08145  BOP1NT  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSAAKVSKKRKAVTKDVEEEAGVFSGDELNVGDIDGALSDDANDLSSDEEDSEVELVDDFSSDEDDDEEELDSDEIPSDGEATLKKKSGTSTADLEVPTNDDESSSEEEQPNFRIEKDANGNDRYVYDEINPDDNSDYSDVEENANTIGNIPLSFYDQYPHIGYDINGKKIMRPATGEALDALLDSIEIPKGFTGLTDPSTGKPLELSQDELELLRKVQMNEIPEEGYNPYEPLMEWFSNKQEIMPLSAAPEPKRRFVPSKHEAKRVMKIVKAIREGRILPYKPPSEEKEEDLELINYDLWADEAERPDHPMHVPAPKLPPPGYEESYHPPPEYLPDNKERKAWQEADPEDRDREFLPTDFGSLRKVPGYGEFVKEKFERCLDLYLAPRVRRSKLNIDPESLLPKLPSPEELKPFPSVCATVFRGHKGRVRSLAVDPTGVWLATGGDDGTVRVWELLTGRQLYSVKVGEEDPVNVVRWRPSKDAVVLAAAAGDDIYLIVPPILDPELEQASLDLLDAGWGYAASKPAPKASEEGKKTTPPQWVRPSAALADNGVCAVIPLRYVAKSISWHRRGDYFVTVCPGSSTPASMAIAIHTLSKHLTQYPFSRRIKGGGPPQTAHFHPSKPILFVANQRTVRAYDLSRQLLVKIIQPGARWISSFDIHPTSSTASGGDNLIVGSYDRRLLWHDLELSQRPYKTLRYHRKAIRAVKFHPSGRYPLFADASDDGSLQIFHGSVTGDMLSNASIVPLKVLKGHKITGELGVMDLDWHPREAWCVSAGADGTCRLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.73
4 0.67
5 0.57
6 0.49
7 0.4
8 0.29
9 0.19
10 0.12
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.07
20 0.05
21 0.06
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.08
68 0.11
69 0.13
70 0.17
71 0.2
72 0.21
73 0.22
74 0.25
75 0.31
76 0.33
77 0.35
78 0.36
79 0.35
80 0.37
81 0.36
82 0.34
83 0.26
84 0.24
85 0.2
86 0.16
87 0.14
88 0.1
89 0.11
90 0.14
91 0.19
92 0.19
93 0.22
94 0.24
95 0.26
96 0.27
97 0.29
98 0.29
99 0.24
100 0.22
101 0.23
102 0.21
103 0.27
104 0.34
105 0.4
106 0.41
107 0.42
108 0.42
109 0.38
110 0.38
111 0.34
112 0.27
113 0.21
114 0.17
115 0.19
116 0.21
117 0.24
118 0.24
119 0.21
120 0.22
121 0.2
122 0.21
123 0.17
124 0.16
125 0.13
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.22
152 0.26
153 0.27
154 0.28
155 0.28
156 0.3
157 0.35
158 0.38
159 0.3
160 0.29
161 0.29
162 0.33
163 0.34
164 0.31
165 0.26
166 0.22
167 0.2
168 0.16
169 0.12
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.19
188 0.19
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.16
193 0.16
194 0.19
195 0.16
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.15
204 0.14
205 0.18
206 0.2
207 0.21
208 0.22
209 0.23
210 0.21
211 0.18
212 0.19
213 0.16
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.14
222 0.14
223 0.15
224 0.17
225 0.19
226 0.21
227 0.21
228 0.18
229 0.17
230 0.17
231 0.18
232 0.17
233 0.15
234 0.15
235 0.18
236 0.2
237 0.19
238 0.28
239 0.27
240 0.29
241 0.33
242 0.36
243 0.4
244 0.44
245 0.51
246 0.51
247 0.6
248 0.63
249 0.67
250 0.69
251 0.67
252 0.68
253 0.65
254 0.6
255 0.51
256 0.51
257 0.49
258 0.48
259 0.5
260 0.45
261 0.4
262 0.4
263 0.39
264 0.37
265 0.41
266 0.35
267 0.32
268 0.36
269 0.36
270 0.34
271 0.38
272 0.37
273 0.36
274 0.37
275 0.37
276 0.34
277 0.32
278 0.31
279 0.27
280 0.23
281 0.15
282 0.14
283 0.11
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.18
301 0.19
302 0.19
303 0.24
304 0.26
305 0.29
306 0.27
307 0.26
308 0.27
309 0.31
310 0.3
311 0.27
312 0.27
313 0.29
314 0.34
315 0.34
316 0.29
317 0.24
318 0.21
319 0.23
320 0.24
321 0.22
322 0.21
323 0.29
324 0.34
325 0.35
326 0.38
327 0.37
328 0.36
329 0.39
330 0.39
331 0.35
332 0.38
333 0.39
334 0.42
335 0.43
336 0.41
337 0.36
338 0.32
339 0.28
340 0.2
341 0.2
342 0.15
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.12
356 0.17
357 0.16
358 0.18
359 0.2
360 0.19
361 0.23
362 0.24
363 0.23
364 0.19
365 0.18
366 0.17
367 0.16
368 0.18
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.22
373 0.25
374 0.23
375 0.26
376 0.27
377 0.28
378 0.29
379 0.32
380 0.36
381 0.4
382 0.49
383 0.47
384 0.46
385 0.46
386 0.43
387 0.41
388 0.32
389 0.24
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.11
394 0.13
395 0.14
396 0.18
397 0.22
398 0.24
399 0.25
400 0.26
401 0.26
402 0.24
403 0.2
404 0.17
405 0.13
406 0.16
407 0.17
408 0.19
409 0.2
410 0.22
411 0.25
412 0.27
413 0.3
414 0.29
415 0.3
416 0.3
417 0.3
418 0.3
419 0.29
420 0.31
421 0.27
422 0.24
423 0.21
424 0.17
425 0.15
426 0.12
427 0.1
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.04
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.07
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.13
448 0.14
449 0.13
450 0.15
451 0.15
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.15
464 0.19
465 0.22
466 0.24
467 0.25
468 0.27
469 0.28
470 0.29
471 0.25
472 0.21
473 0.17
474 0.14
475 0.12
476 0.09
477 0.06
478 0.04
479 0.03
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.03
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.07
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.04
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.1
512 0.11
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.17
517 0.23
518 0.31
519 0.32
520 0.36
521 0.37
522 0.4
523 0.42
524 0.44
525 0.47
526 0.43
527 0.49
528 0.53
529 0.54
530 0.53
531 0.52
532 0.49
533 0.41
534 0.39
535 0.3
536 0.22
537 0.18
538 0.14
539 0.13
540 0.1
541 0.08
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.04
546 0.05
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.11
552 0.16
553 0.25
554 0.34
555 0.38
556 0.4
557 0.41
558 0.43
559 0.44
560 0.42
561 0.41
562 0.33
563 0.28
564 0.3
565 0.28
566 0.25
567 0.24
568 0.21
569 0.15
570 0.13
571 0.13
572 0.1
573 0.13
574 0.13
575 0.12
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.11
585 0.12
586 0.15
587 0.18
588 0.2
589 0.29
590 0.36
591 0.45
592 0.46
593 0.5
594 0.47
595 0.48
596 0.48
597 0.47
598 0.48
599 0.48
600 0.5
601 0.45
602 0.48
603 0.49
604 0.45
605 0.42
606 0.36
607 0.28
608 0.27
609 0.32
610 0.3
611 0.28
612 0.29
613 0.27
614 0.27
615 0.33
616 0.36
617 0.39
618 0.38
619 0.37
620 0.38
621 0.36
622 0.35
623 0.32
624 0.26
625 0.25
626 0.31
627 0.33
628 0.33
629 0.32
630 0.3
631 0.31
632 0.3
633 0.27
634 0.24
635 0.25
636 0.25
637 0.25
638 0.29
639 0.28
640 0.28
641 0.24
642 0.21
643 0.22
644 0.21
645 0.22
646 0.22
647 0.21
648 0.21
649 0.21
650 0.21
651 0.2
652 0.19
653 0.18
654 0.15
655 0.12
656 0.13
657 0.13
658 0.11
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.1
667 0.1
668 0.11
669 0.15
670 0.2
671 0.22
672 0.25
673 0.26
674 0.27
675 0.33
676 0.37
677 0.38
678 0.39
679 0.36
680 0.34
681 0.34
682 0.39
683 0.43
684 0.49
685 0.55
686 0.58
687 0.68
688 0.73
689 0.8
690 0.82
691 0.82
692 0.81
693 0.78
694 0.74
695 0.74
696 0.73
697 0.67
698 0.65
699 0.58
700 0.56
701 0.51
702 0.51
703 0.44
704 0.41
705 0.4
706 0.33
707 0.33
708 0.27
709 0.27
710 0.23
711 0.21
712 0.16
713 0.15
714 0.14
715 0.1
716 0.1
717 0.07
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.09
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.08
728 0.08
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.07
733 0.1
734 0.11
735 0.12
736 0.19
737 0.23
738 0.29
739 0.32
740 0.35
741 0.35
742 0.38
743 0.39
744 0.35
745 0.33
746 0.27
747 0.22
748 0.19
749 0.17
750 0.13
751 0.13
752 0.14
753 0.13
754 0.14
755 0.14
756 0.14
757 0.18
758 0.18
759 0.19
760 0.16
761 0.16
762 0.16
763 0.18
764 0.18
765 0.16
766 0.16
767 0.15