Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A100I5C0

Protein Details
Accession A0A100I5C0    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-234DAYIKGKEDKAKREKQRKEKNILEVDMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-57RPAPRVGKRDAPKEAPAQPRENNNSRRGGRA
77-77K
85-92QRRGFRAR
212-227KGKEDKAKREKQRKEK
240-272PRTGGPGPRGRGGRGGPRGGRGGRGNGPRSERP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MLHTVERNDPELDPNRAPEPPTKAVDRPAPRVGKRDAPKEAPAQPRENNNSRRGGRATGNEAAFRDRNAGRNNNREKPTDEKDAQRRGFRAREDRGERVRHDRQSRTGQTDTRKQVNQGWGNQSGEKTWDDEKAGENIAQTDETEPQTPGEEKPEEAADKSKSYAEYLAEKAAQGDLSAKPVRAPNEGTKLDKKWAAAKELKRSEEEDAYIKGKEDKAKREKQRKEKNILEVDMRFVEAPRTGGPGPRGRGGRGGPRGGRGGRGNGPRSERPAAAAAAAPTVAVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.36
4 0.38
5 0.37
6 0.39
7 0.39
8 0.41
9 0.43
10 0.43
11 0.47
12 0.54
13 0.54
14 0.53
15 0.56
16 0.6
17 0.58
18 0.61
19 0.6
20 0.6
21 0.61
22 0.63
23 0.61
24 0.58
25 0.6
26 0.6
27 0.64
28 0.63
29 0.62
30 0.6
31 0.57
32 0.61
33 0.64
34 0.67
35 0.66
36 0.62
37 0.66
38 0.61
39 0.62
40 0.55
41 0.52
42 0.47
43 0.46
44 0.46
45 0.42
46 0.42
47 0.38
48 0.36
49 0.37
50 0.32
51 0.27
52 0.26
53 0.22
54 0.27
55 0.32
56 0.41
57 0.43
58 0.53
59 0.61
60 0.64
61 0.66
62 0.62
63 0.6
64 0.58
65 0.57
66 0.55
67 0.51
68 0.51
69 0.56
70 0.63
71 0.63
72 0.6
73 0.57
74 0.54
75 0.56
76 0.54
77 0.54
78 0.5
79 0.55
80 0.56
81 0.61
82 0.61
83 0.61
84 0.58
85 0.58
86 0.59
87 0.58
88 0.59
89 0.56
90 0.56
91 0.61
92 0.62
93 0.6
94 0.56
95 0.53
96 0.52
97 0.56
98 0.55
99 0.51
100 0.47
101 0.43
102 0.45
103 0.49
104 0.47
105 0.44
106 0.43
107 0.4
108 0.4
109 0.39
110 0.33
111 0.25
112 0.22
113 0.17
114 0.15
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.14
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.1
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.23
172 0.23
173 0.31
174 0.33
175 0.36
176 0.38
177 0.38
178 0.38
179 0.36
180 0.32
181 0.31
182 0.32
183 0.34
184 0.38
185 0.41
186 0.48
187 0.53
188 0.53
189 0.48
190 0.47
191 0.44
192 0.39
193 0.35
194 0.27
195 0.24
196 0.23
197 0.22
198 0.2
199 0.2
200 0.21
201 0.26
202 0.3
203 0.38
204 0.46
205 0.56
206 0.66
207 0.73
208 0.8
209 0.84
210 0.89
211 0.89
212 0.88
213 0.86
214 0.85
215 0.81
216 0.74
217 0.68
218 0.57
219 0.51
220 0.42
221 0.35
222 0.25
223 0.18
224 0.18
225 0.13
226 0.14
227 0.12
228 0.16
229 0.16
230 0.19
231 0.25
232 0.3
233 0.32
234 0.36
235 0.38
236 0.34
237 0.4
238 0.4
239 0.44
240 0.44
241 0.48
242 0.44
243 0.46
244 0.51
245 0.46
246 0.47
247 0.41
248 0.41
249 0.41
250 0.47
251 0.48
252 0.48
253 0.54
254 0.53
255 0.56
256 0.55
257 0.47
258 0.42
259 0.41
260 0.35
261 0.3
262 0.27
263 0.21
264 0.17
265 0.16
266 0.13
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.09
272 0.13
273 0.15
274 0.18
275 0.18