Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A117E499

Protein Details
Accession A0A117E499    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-66HPTGPARQSSPEKDRKRKHKDTTSPSKKKRKHESDATSSKKSSSSKKSQSKTSTNTHydrophilic
431-464EESPSKVKKSSSSKDKKEKKEKKSKSSKKEKTKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-51PEKDRKRKHKDTTSPSKKKRKHESDATSSKK
436-464KVKKSSSSKDKKEKKEKKSKSSKKEKTKE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 10.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MALDAMDLDPHPTGPARQSSPEKDRKRKHKDTTSPSKKKRKHESDATSSKKSSSSKKSQSKTSTNTSTSKPTTPDSPYTLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYYAPLKGIVLAYSNASISSTPPPSSTNIVNAEDPNLPQPLTLARTAGEYGVLYVYLTATFLVFRPQRGQILEGWVNVQSEGFLGAIVLNLFSVGIERKRLPPSWKWIPPGEELEEEQQQQQETSTTSATEKEDNNNDDEDSDSSSTSEGQKKKSAFDPAKELFRPIALAEDVNPLADTDPTSTSTNNNATGDYDDDETAAAEGYFQSVSGHRVRGTIKFRVVDVDVIPGSERESGFLSIEGTMLDEEEEKRVLEEERTGVVSSSAPSSSYGGGSGSTGMTPRKLGSVTTMSGALAIRSASASVAPELEPEVVDVHVEESPSKVKKSSSSKDKKEKKEKKSKSSKKEKTKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.26
3 0.28
4 0.35
5 0.43
6 0.51
7 0.6
8 0.68
9 0.73
10 0.76
11 0.83
12 0.86
13 0.89
14 0.91
15 0.92
16 0.92
17 0.92
18 0.92
19 0.93
20 0.94
21 0.94
22 0.94
23 0.94
24 0.91
25 0.91
26 0.92
27 0.9
28 0.89
29 0.89
30 0.88
31 0.88
32 0.91
33 0.87
34 0.82
35 0.72
36 0.64
37 0.58
38 0.54
39 0.53
40 0.52
41 0.56
42 0.61
43 0.7
44 0.74
45 0.78
46 0.82
47 0.82
48 0.78
49 0.76
50 0.74
51 0.69
52 0.67
53 0.61
54 0.6
55 0.54
56 0.52
57 0.46
58 0.41
59 0.42
60 0.43
61 0.44
62 0.41
63 0.41
64 0.38
65 0.38
66 0.36
67 0.3
68 0.25
69 0.21
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.19
125 0.22
126 0.22
127 0.22
128 0.23
129 0.25
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.22
134 0.21
135 0.18
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.16
166 0.18
167 0.21
168 0.21
169 0.23
170 0.17
171 0.23
172 0.24
173 0.21
174 0.2
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.07
180 0.05
181 0.06
182 0.05
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.02
193 0.03
194 0.05
195 0.06
196 0.08
197 0.1
198 0.14
199 0.18
200 0.22
201 0.26
202 0.29
203 0.37
204 0.44
205 0.48
206 0.47
207 0.46
208 0.46
209 0.43
210 0.41
211 0.35
212 0.27
213 0.23
214 0.22
215 0.2
216 0.18
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.1
229 0.11
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.21
237 0.2
238 0.17
239 0.17
240 0.13
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.12
248 0.19
249 0.2
250 0.22
251 0.28
252 0.28
253 0.31
254 0.34
255 0.4
256 0.37
257 0.37
258 0.42
259 0.4
260 0.44
261 0.42
262 0.39
263 0.29
264 0.25
265 0.23
266 0.15
267 0.14
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.14
285 0.18
286 0.2
287 0.2
288 0.19
289 0.17
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.06
309 0.1
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.17
314 0.19
315 0.26
316 0.31
317 0.33
318 0.35
319 0.34
320 0.34
321 0.34
322 0.33
323 0.28
324 0.23
325 0.21
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.1
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.14
356 0.14
357 0.16
358 0.17
359 0.17
360 0.16
361 0.15
362 0.14
363 0.12
364 0.13
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.19
387 0.22
388 0.22
389 0.22
390 0.22
391 0.19
392 0.2
393 0.19
394 0.13
395 0.09
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.09
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.11
420 0.18
421 0.22
422 0.24
423 0.24
424 0.26
425 0.35
426 0.45
427 0.53
428 0.57
429 0.65
430 0.74
431 0.82
432 0.9
433 0.92
434 0.93
435 0.93
436 0.93
437 0.94
438 0.94
439 0.94
440 0.95
441 0.95
442 0.94
443 0.96
444 0.95