Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P1BF08

Protein Details
Accession A0A0P1BF08    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-205KQQRMEKEARRAKKKELKTRMQKGDKGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-200EKEARRAKKKELKTRMQK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MSGIASGTAAGGSGVGPSRRRWDKEEFENRAKARDEEDRERAKENEQRIQQGKKPTFKRKEDLPKPTELLQARKEALELDKDVGKSQMVDVLGDGRRGGPGYYCDVCKRTCKDSIGYLDHINGRMHLRRIGQTTQVARSSVAQVRARIMLIRAEREAAGGAAKGTTYDFEARIEAIAKQQRMEKEARRAKKKELKTRMQKGDKGLNGGGDEEMMKQMGFAGFGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.12
3 0.14
4 0.17
5 0.27
6 0.35
7 0.39
8 0.43
9 0.49
10 0.55
11 0.64
12 0.72
13 0.71
14 0.7
15 0.74
16 0.7
17 0.66
18 0.59
19 0.5
20 0.44
21 0.44
22 0.45
23 0.45
24 0.53
25 0.55
26 0.54
27 0.57
28 0.53
29 0.51
30 0.49
31 0.48
32 0.47
33 0.44
34 0.5
35 0.52
36 0.56
37 0.54
38 0.59
39 0.6
40 0.61
41 0.66
42 0.69
43 0.73
44 0.74
45 0.74
46 0.74
47 0.78
48 0.78
49 0.79
50 0.72
51 0.67
52 0.63
53 0.6
54 0.56
55 0.48
56 0.44
57 0.37
58 0.37
59 0.33
60 0.3
61 0.28
62 0.23
63 0.21
64 0.18
65 0.16
66 0.14
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.06
87 0.07
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.16
92 0.17
93 0.19
94 0.23
95 0.25
96 0.24
97 0.28
98 0.29
99 0.29
100 0.32
101 0.36
102 0.33
103 0.32
104 0.28
105 0.25
106 0.24
107 0.24
108 0.19
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.18
114 0.19
115 0.2
116 0.24
117 0.25
118 0.25
119 0.27
120 0.28
121 0.29
122 0.28
123 0.25
124 0.22
125 0.21
126 0.22
127 0.21
128 0.25
129 0.24
130 0.23
131 0.24
132 0.25
133 0.24
134 0.2
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.16
143 0.15
144 0.1
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.16
163 0.21
164 0.21
165 0.22
166 0.26
167 0.28
168 0.31
169 0.37
170 0.38
171 0.43
172 0.52
173 0.6
174 0.66
175 0.68
176 0.74
177 0.77
178 0.8
179 0.81
180 0.82
181 0.83
182 0.84
183 0.9
184 0.9
185 0.89
186 0.84
187 0.8
188 0.79
189 0.71
190 0.65
191 0.56
192 0.47
193 0.39
194 0.35
195 0.28
196 0.19
197 0.17
198 0.12
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.1
204 0.09
205 0.1