FuNGI

A0A0P1BGN7

Protein Details

Accession

A0A0P1BGN7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MSETRFREMRKQSLRPRVLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 10, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MSETRFREMRKQSLRPRVLDYTEFDEAEAEAEAEGAEEIEWPAAANVITSTPPVIARKADSKAQSVASRAQSAMSAAHSVGQEQQQQQRGQADTDPDVDVDGDERSEDALAADIQPGPPLIADVRERRPLRASNTAHQAAPKQGMSRFAARRQLDRELHAGAGAGADARSHAAKQHSNVELEQSAAQHVQPMASASAAAAAPSSAPQDTSLHDWLEEDGRPMTALISTWLLRDRQMGVRRMALFALRCALRTTKRGEEAMLCVQPPIVPAPSSKKTETYEETIKRDMTRGLLNLAAPTLLVEMYGQDAEAGMEIVEDVLDCLCALAEASLDAARAVLQSAGIMDLINSSHALKASPPPLKVLQLLQLLSSVDRQAAAALANATSAHLLRLVALPCWTSARRAQDLRTHRAFVSTLGLFSIYAQFGAGLEHVVHSWAVFEQLTAHVQYRLESGTSMDTEELRAVGKMLRLMKAWITCARHPHRTQPQHALGWPHFGEWAELALSIVCSVPAELAVPDEAEKAFVLQGCAAGLLDVWIDLACNNARTADAAKTLVARLKDDADAIARLAQSAELAMLAAASRIARHDTLKRQMVEEFVEMLEACKHVVALLERCEAVSALQRMHKASRDLMRDDRLWTRFDEQDAWIAGYRVARHVASEFQGHTLKGLHGADGEKVDLAEIVEPVHSLDKGQEELAKQLVHVIQWKTRTTSLAPFMNESLRVKSSAAIVQGNGTLTGAATLWSTLQARGDEQNVEPGAEEQAEADPEDLDPLTGALLYKSSQSGLPLRSDWTLQALDDLLHSGTCAALNRKDVLPASWDYTEAQLVRDALHLTRMALQATLDMRRHDCLMTASELLLGMCKVFLLERDDAPTPQSTGDITGRNLFRDKEISGVLVQLFEMLPQLVASHAATDVQMSGKVAPFDGTRTRSKTMEEAACKETIAVPFYQIYTDLLGLYDGLSLGDEAFQRIILAGQSMLYASDYRRLLWIDHAHLLSTFTLQLQDAPLETMRGLQSYLYPAEQDPDVLRAFTAALMRGDVTRTRRNVDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.78
3	0.77
4	0.73
5	0.68
6	0.62
7	0.56
8	0.52
9	0.48
10	0.44
11	0.37
12	0.3
13	0.25
14	0.21
15	0.17
16	0.1
17	0.06
18	0.06
19	0.06
20	0.06
21	0.06
22	0.05
23	0.04
24	0.05
25	0.06
26	0.06
27	0.06
28	0.06
29	0.06
30	0.07
31	0.07
32	0.06
33	0.06
34	0.08
35	0.09
36	0.09
37	0.1
38	0.1
39	0.13
40	0.16
41	0.18
42	0.19
43	0.23
44	0.29
45	0.33
46	0.39
47	0.39
48	0.41
49	0.42
50	0.44
51	0.43
52	0.4
53	0.43
54	0.4
55	0.39
56	0.35
57	0.32
58	0.27
59	0.25
60	0.23
61	0.17
62	0.14
63	0.12
64	0.15
65	0.14
66	0.15
67	0.18
68	0.21
69	0.25
70	0.29
71	0.36
72	0.4
73	0.41
74	0.44
75	0.46
76	0.43
77	0.39
78	0.37
79	0.35
80	0.3
81	0.32
82	0.28
83	0.22
84	0.21
85	0.19
86	0.16
87	0.12
88	0.1
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.09
100	0.1
101	0.09
102	0.1
103	0.1
104	0.09
105	0.08
106	0.09
107	0.08
108	0.11
109	0.17
110	0.23
111	0.29
112	0.38
113	0.39
114	0.41
115	0.47
116	0.49
117	0.5
118	0.54
119	0.54
120	0.52
121	0.6
122	0.59
123	0.54
124	0.5
125	0.47
126	0.41
127	0.4
128	0.34
129	0.29
130	0.28
131	0.32
132	0.33
133	0.39
134	0.4
135	0.42
136	0.49
137	0.48
138	0.53
139	0.52
140	0.58
141	0.53
142	0.5
143	0.47
144	0.4
145	0.38
146	0.31
147	0.26
148	0.17
149	0.13
150	0.1
151	0.07
152	0.05
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.07
157	0.07
158	0.11
159	0.17
160	0.21
161	0.24
162	0.32
163	0.34
164	0.36
165	0.36
166	0.36
167	0.3
168	0.28
169	0.26
170	0.18
171	0.17
172	0.15
173	0.15
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.11
178	0.12
179	0.1
180	0.1
181	0.1
182	0.06
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.06
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.08
191	0.06
192	0.07
193	0.09
194	0.1
195	0.12
196	0.17
197	0.19
198	0.18
199	0.18
200	0.18
201	0.17
202	0.19
203	0.18
204	0.14
205	0.12
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.16
220	0.19
221	0.24
222	0.31
223	0.35
224	0.34
225	0.4
226	0.4
227	0.39
228	0.36
229	0.31
230	0.24
231	0.2
232	0.23
233	0.17
234	0.17
235	0.19
236	0.23
237	0.24
238	0.27
239	0.32
240	0.34
241	0.38
242	0.38
243	0.37
244	0.35
245	0.35
246	0.37
247	0.32
248	0.26
249	0.22
250	0.21
251	0.19
252	0.18
253	0.15
254	0.11
255	0.1
256	0.13
257	0.2
258	0.26
259	0.3
260	0.3
261	0.33
262	0.34
263	0.39
264	0.41
265	0.39
266	0.43
267	0.44
268	0.46
269	0.45
270	0.44
271	0.39
272	0.36
273	0.31
274	0.25
275	0.23
276	0.2
277	0.19
278	0.18
279	0.18
280	0.16
281	0.15
282	0.12
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.03
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.13
341	0.19
342	0.23
343	0.23
344	0.26
345	0.27
346	0.29
347	0.29
348	0.26
349	0.24
350	0.23
351	0.23
352	0.19
353	0.18
354	0.17
355	0.16
356	0.15
357	0.1
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.06
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.14
383	0.13
384	0.13
385	0.16
386	0.22
387	0.27
388	0.29
389	0.32
390	0.36
391	0.43
392	0.48
393	0.47
394	0.43
395	0.38
396	0.37
397	0.34
398	0.27
399	0.24
400	0.17
401	0.14
402	0.12
403	0.12
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.05
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.04
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.08
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.07
452	0.1
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.16
458	0.15
459	0.17
460	0.18
461	0.21
462	0.21
463	0.3
464	0.34
465	0.4
466	0.4
467	0.47
468	0.53
469	0.56
470	0.59
471	0.58
472	0.58
473	0.52
474	0.52
475	0.48
476	0.37
477	0.35
478	0.3
479	0.22
480	0.18
481	0.16
482	0.14
483	0.1
484	0.1
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.02
521	0.02
522	0.02
523	0.02
524	0.02
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.06
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.1
538	0.11
539	0.12
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.11
545	0.11
546	0.1
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.06
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.03
559	0.03
560	0.02
561	0.02
562	0.02
563	0.02
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.04
568	0.06
569	0.07
570	0.1
571	0.15
572	0.21
573	0.29
574	0.34
575	0.34
576	0.34
577	0.34
578	0.33
579	0.29
580	0.23
581	0.17
582	0.11
583	0.11
584	0.09
585	0.09
586	0.08
587	0.06
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.06
593	0.08
594	0.1
595	0.12
596	0.13
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.11
601	0.1
602	0.12
603	0.11
604	0.12
605	0.15
606	0.16
607	0.18
608	0.2
609	0.22
610	0.2
611	0.23
612	0.28
613	0.29
614	0.32
615	0.34
616	0.36
617	0.34
618	0.35
619	0.36
620	0.32
621	0.29
622	0.27
623	0.27
624	0.25
625	0.25
626	0.24
627	0.19
628	0.2
629	0.2
630	0.19
631	0.15
632	0.14
633	0.14
634	0.13
635	0.12
636	0.11
637	0.12
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.13
642	0.13
643	0.14
644	0.13
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.15
649	0.14
650	0.13
651	0.15
652	0.14
653	0.11
654	0.11
655	0.12
656	0.12
657	0.12
658	0.12
659	0.08
660	0.07
661	0.07
662	0.06
663	0.06
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.07
674	0.08
675	0.09
676	0.1
677	0.12
678	0.12
679	0.13
680	0.15
681	0.14
682	0.12
683	0.14
684	0.14
685	0.13
686	0.18
687	0.19
688	0.2
689	0.24
690	0.26
691	0.26
692	0.26
693	0.28
694	0.24
695	0.28
696	0.3
697	0.3
698	0.3
699	0.28
700	0.28
701	0.27
702	0.27
703	0.23
704	0.2
705	0.17
706	0.17
707	0.16
708	0.16
709	0.17
710	0.17
711	0.18
712	0.15
713	0.14
714	0.14
715	0.15
716	0.14
717	0.11
718	0.09
719	0.07
720	0.05
721	0.06
722	0.05
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.04
727	0.06
728	0.07
729	0.08
730	0.1
731	0.1
732	0.12
733	0.14
734	0.15
735	0.15
736	0.15
737	0.2
738	0.18
739	0.17
740	0.16
741	0.14
742	0.14
743	0.12
744	0.11
745	0.07
746	0.07
747	0.08
748	0.07
749	0.07
750	0.06
751	0.06
752	0.07
753	0.06
754	0.06
755	0.05
756	0.05
757	0.04
758	0.05
759	0.05
760	0.04
761	0.05
762	0.05
763	0.06
764	0.07
765	0.08
766	0.08
767	0.11
768	0.16
769	0.17
770	0.19
771	0.19
772	0.21
773	0.21
774	0.22
775	0.19
776	0.18
777	0.16
778	0.14
779	0.13
780	0.12
781	0.11
782	0.1
783	0.11
784	0.07
785	0.06
786	0.06
787	0.05
788	0.05
789	0.06
790	0.09
791	0.11
792	0.14
793	0.17
794	0.2
795	0.2
796	0.23
797	0.22
798	0.21
799	0.21
800	0.2
801	0.22
802	0.19
803	0.2
804	0.18
805	0.18
806	0.2
807	0.17
808	0.15
809	0.13
810	0.13
811	0.13
812	0.14
813	0.14
814	0.11
815	0.14
816	0.14
817	0.12
818	0.17
819	0.17
820	0.16
821	0.15
822	0.15
823	0.15
824	0.17
825	0.21
826	0.18
827	0.2
828	0.21
829	0.23
830	0.24
831	0.21
832	0.2
833	0.18
834	0.19
835	0.19
836	0.18
837	0.16
838	0.15
839	0.15
840	0.13
841	0.12
842	0.09
843	0.06
844	0.05
845	0.05
846	0.05
847	0.05
848	0.08
849	0.12
850	0.14
851	0.15
852	0.2
853	0.22
854	0.22
855	0.24
856	0.23
857	0.19
858	0.17
859	0.16
860	0.13
861	0.15
862	0.18
863	0.19
864	0.19
865	0.25
866	0.26
867	0.28
868	0.3
869	0.27
870	0.26
871	0.27
872	0.26
873	0.22
874	0.22
875	0.21
876	0.19
877	0.2
878	0.17
879	0.14
880	0.13
881	0.11
882	0.1
883	0.08
884	0.08
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.05
890	0.07
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.07
895	0.07
896	0.08
897	0.08
898	0.08
899	0.09
900	0.09
901	0.1
902	0.12
903	0.13
904	0.13
905	0.14
906	0.13
907	0.17
908	0.23
909	0.26
910	0.31
911	0.36
912	0.39
913	0.39
914	0.41
915	0.42
916	0.43
917	0.47
918	0.45
919	0.45
920	0.45
921	0.43
922	0.4
923	0.36
924	0.31
925	0.25
926	0.22
927	0.17
928	0.16
929	0.17
930	0.18
931	0.18
932	0.15
933	0.14
934	0.13
935	0.13
936	0.11
937	0.1
938	0.09
939	0.09
940	0.08
941	0.07
942	0.05
943	0.05
944	0.05
945	0.05
946	0.05
947	0.07
948	0.08
949	0.09
950	0.09
951	0.09
952	0.09
953	0.09
954	0.09
955	0.08
956	0.08
957	0.07
958	0.07
959	0.07
960	0.07
961	0.07
962	0.08
963	0.09
964	0.09
965	0.16
966	0.16
967	0.17
968	0.2
969	0.21
970	0.21
971	0.28
972	0.34
973	0.31
974	0.37
975	0.36
976	0.34
977	0.33
978	0.33
979	0.25
980	0.2
981	0.16
982	0.11
983	0.12
984	0.12
985	0.13
986	0.13
987	0.13
988	0.12
989	0.14
990	0.14
991	0.14
992	0.13
993	0.16
994	0.15
995	0.15
996	0.15
997	0.13
998	0.15
999	0.18
1000	0.2
1001	0.17
1002	0.18
1003	0.17
1004	0.2
1005	0.19
1006	0.19
1007	0.16
1008	0.18
1009	0.18
1010	0.16
1011	0.16
1012	0.13
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.15
1016	0.13
1017	0.13
1018	0.14
1019	0.15
1020	0.15
1021	0.18
1022	0.22
1023	0.26
1024	0.33
1025	0.36

A0A0P1BGN7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer