Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P1BER3

Protein Details
Accession A0A0P1BER3    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-72AEGESKTGSKRKRRRTKSGQNESTAAHydrophilic
388-410RLQEHRKKVSRAPQEKEKKSAKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-63GSKRKRRRTK
101-104RAKK
131-135RAGKK
177-178KK
182-200DRRADASAKSDARRDKRAA
393-407RKKVSRAPQEKEKKS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042246  ZCCHC9  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0032259  P:methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTRYTSGVSDASHGSKKRKMLPTATPAEERFAASSSTNNITMGDSAAEGESKTGSKRKRRRTKSGQNESTAARVPRPSVPVDLSKLSSNDLQKRLKLVRLRAKKANTDEKRAAHESAIHEVVRAIRAANGRAGKKDARLEEVTWKDKRADSKGGEFAARKGAATSHAPDDEKGNPWKKMEADRRADASAKSDARRDKRAAERASKQRCYACRGMGHSAKDCPSGLNAESSALDGDLPVEGDTDGKAKVTGKETVGICFRCGSTEHTLARCRKAAKRNDEGEEQLPYATCFICSQKGHLSSKCPKGRGVYPSGGSCRLCSSTEHLVKDCPLSIRKSGKGAAELGLAAIGGADSGGLSATGGVQDTGSLGADEDDFHHFSRQRSDVERERLQEHRKKVSRAPQEKEKKSAKVIAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.46
4 0.53
5 0.59
6 0.62
7 0.63
8 0.68
9 0.72
10 0.74
11 0.72
12 0.67
13 0.58
14 0.55
15 0.48
16 0.4
17 0.31
18 0.25
19 0.22
20 0.17
21 0.19
22 0.19
23 0.21
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.12
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.09
39 0.13
40 0.2
41 0.28
42 0.39
43 0.49
44 0.6
45 0.7
46 0.78
47 0.86
48 0.9
49 0.93
50 0.93
51 0.94
52 0.91
53 0.85
54 0.79
55 0.69
56 0.61
57 0.55
58 0.45
59 0.37
60 0.3
61 0.28
62 0.29
63 0.31
64 0.3
65 0.28
66 0.3
67 0.32
68 0.34
69 0.34
70 0.31
71 0.3
72 0.28
73 0.27
74 0.28
75 0.31
76 0.34
77 0.39
78 0.42
79 0.41
80 0.47
81 0.49
82 0.51
83 0.5
84 0.52
85 0.55
86 0.61
87 0.66
88 0.67
89 0.69
90 0.7
91 0.72
92 0.74
93 0.68
94 0.67
95 0.67
96 0.61
97 0.62
98 0.58
99 0.51
100 0.4
101 0.39
102 0.33
103 0.31
104 0.3
105 0.23
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.16
110 0.14
111 0.1
112 0.11
113 0.13
114 0.14
115 0.18
116 0.23
117 0.23
118 0.25
119 0.29
120 0.27
121 0.3
122 0.34
123 0.31
124 0.31
125 0.32
126 0.32
127 0.37
128 0.41
129 0.43
130 0.38
131 0.38
132 0.35
133 0.35
134 0.39
135 0.35
136 0.37
137 0.34
138 0.38
139 0.4
140 0.39
141 0.39
142 0.34
143 0.3
144 0.28
145 0.25
146 0.19
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.18
152 0.15
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.19
158 0.21
159 0.26
160 0.28
161 0.28
162 0.28
163 0.31
164 0.31
165 0.38
166 0.43
167 0.45
168 0.46
169 0.46
170 0.48
171 0.46
172 0.45
173 0.36
174 0.29
175 0.26
176 0.24
177 0.22
178 0.25
179 0.3
180 0.33
181 0.38
182 0.37
183 0.38
184 0.43
185 0.51
186 0.52
187 0.52
188 0.57
189 0.61
190 0.67
191 0.63
192 0.57
193 0.53
194 0.51
195 0.5
196 0.45
197 0.39
198 0.34
199 0.34
200 0.38
201 0.37
202 0.37
203 0.32
204 0.31
205 0.28
206 0.26
207 0.23
208 0.17
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.04
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.08
234 0.11
235 0.13
236 0.16
237 0.16
238 0.21
239 0.21
240 0.23
241 0.26
242 0.24
243 0.22
244 0.2
245 0.19
246 0.15
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.25
251 0.27
252 0.3
253 0.37
254 0.39
255 0.42
256 0.41
257 0.4
258 0.42
259 0.48
260 0.54
261 0.55
262 0.61
263 0.63
264 0.64
265 0.62
266 0.58
267 0.5
268 0.43
269 0.35
270 0.26
271 0.2
272 0.16
273 0.14
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.1
278 0.16
279 0.16
280 0.2
281 0.25
282 0.32
283 0.36
284 0.37
285 0.44
286 0.46
287 0.56
288 0.59
289 0.54
290 0.5
291 0.5
292 0.54
293 0.53
294 0.51
295 0.46
296 0.42
297 0.45
298 0.46
299 0.45
300 0.38
301 0.32
302 0.29
303 0.26
304 0.24
305 0.22
306 0.24
307 0.3
308 0.36
309 0.38
310 0.35
311 0.35
312 0.36
313 0.35
314 0.32
315 0.26
316 0.25
317 0.26
318 0.32
319 0.37
320 0.38
321 0.41
322 0.42
323 0.4
324 0.39
325 0.37
326 0.31
327 0.25
328 0.22
329 0.18
330 0.14
331 0.11
332 0.07
333 0.05
334 0.04
335 0.02
336 0.02
337 0.02
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.09
359 0.12
360 0.14
361 0.15
362 0.21
363 0.24
364 0.26
365 0.34
366 0.36
367 0.37
368 0.42
369 0.49
370 0.52
371 0.58
372 0.62
373 0.58
374 0.58
375 0.62
376 0.66
377 0.65
378 0.64
379 0.66
380 0.68
381 0.7
382 0.75
383 0.76
384 0.78
385 0.79
386 0.79
387 0.79
388 0.83
389 0.83
390 0.84
391 0.82
392 0.77
393 0.74