FuNGI

A0A0P1BJJ6

Protein Details

Accession

A0A0P1BJJ6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-47	ASTSQLPKEQTRKRKHSEGSAKEERKKERRSDKSSSNTSHR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-37	RKRKHSEGSAKEERKKERRS
523-531	KPRRGPAKR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 9, mito_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MALPDMASTSQLPKEQTRKRKHSEGSAKEERKKERRSDKSSSNTSHRSQAVPDEDIRKAGYLNNGECVPTDHAVVNVGKDASRKLGPVLAMFSDYEPPPSTSFAMYAAAAPDDKSPSGTTLSNRLMLTGETDTMSYVGTNWISSAAAPENSDEDRLSARGYSGEFLVGIYDPATSTVTLRVAPAFVVRRRIKALAEQSLAISSVLDGDGAQDYAARMLARRDLGEAFGNRKTKLKARNDDRMKVNTENMTDIMTTMREGIETSSKHMDSADAVEAAAKAAQAIPPHNEHAENPREAYAIGDLVPSSILKAIDITNLLLASSPEAVKQGLPVGGPAKSKWLVGKAWEAIQQVNHGSSVAAPVGILKTSTGGSVKDDGKLRLTLCLYAAMLWKLHDEKMNVGRPNDRQKLLEKLKVDENKHGRMIFAHLMDTFAEKMRSTHRYNVTPFTETKCLAYFAAITLHINNFSVDVKELAKDMGIESRRLGDVYKSLGCTPSSASVRSSNGEKAIKESRLVLKCPFTIPKPRRGPAKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.5
3	0.6
4	0.67
5	0.73
6	0.78
7	0.85
8	0.83
9	0.84
10	0.85
11	0.84
12	0.83
13	0.84
14	0.84
15	0.82
16	0.83
17	0.82
18	0.81
19	0.81
20	0.81
21	0.81
22	0.83
23	0.84
24	0.85
25	0.85
26	0.85
27	0.85
28	0.82
29	0.8
30	0.76
31	0.7
32	0.69
33	0.62
34	0.54
35	0.47
36	0.47
37	0.43
38	0.4
39	0.42
40	0.39
41	0.37
42	0.36
43	0.35
44	0.27
45	0.23
46	0.22
47	0.25
48	0.26
49	0.27
50	0.29
51	0.28
52	0.28
53	0.28
54	0.28
55	0.25
56	0.19
57	0.2
58	0.17
59	0.16
60	0.2
61	0.2
62	0.17
63	0.15
64	0.15
65	0.14
66	0.15
67	0.16
68	0.17
69	0.18
70	0.18
71	0.17
72	0.2
73	0.2
74	0.2
75	0.21
76	0.17
77	0.17
78	0.17
79	0.17
80	0.17
81	0.16
82	0.18
83	0.17
84	0.18
85	0.18
86	0.2
87	0.2
88	0.17
89	0.18
90	0.16
91	0.15
92	0.13
93	0.13
94	0.11
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.11
99	0.12
100	0.12
101	0.13
102	0.13
103	0.14
104	0.16
105	0.18
106	0.18
107	0.24
108	0.26
109	0.28
110	0.27
111	0.26
112	0.24
113	0.22
114	0.23
115	0.16
116	0.15
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.1
121	0.1
122	0.07
123	0.06
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.09
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.11
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.12
140	0.11
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.09
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.08
164	0.09
165	0.09
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.12
171	0.16
172	0.17
173	0.26
174	0.27
175	0.3
176	0.33
177	0.34
178	0.31
179	0.33
180	0.37
181	0.34
182	0.33
183	0.31
184	0.28
185	0.27
186	0.26
187	0.19
188	0.12
189	0.06
190	0.05
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.05
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.06
205	0.09
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.11
210	0.12
211	0.15
212	0.16
213	0.16
214	0.2
215	0.22
216	0.21
217	0.24
218	0.26
219	0.29
220	0.37
221	0.43
222	0.48
223	0.53
224	0.63
225	0.66
226	0.7
227	0.68
228	0.63
229	0.57
230	0.49
231	0.45
232	0.37
233	0.31
234	0.25
235	0.21
236	0.18
237	0.13
238	0.12
239	0.09
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.04
245	0.05
246	0.06
247	0.09
248	0.1
249	0.12
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.14
255	0.1
256	0.12
257	0.1
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.06
264	0.04
265	0.03
266	0.04
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.09
271	0.11
272	0.13
273	0.14
274	0.14
275	0.14
276	0.19
277	0.22
278	0.21
279	0.2
280	0.19
281	0.18
282	0.18
283	0.17
284	0.11
285	0.07
286	0.07
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.12
320	0.13
321	0.12
322	0.15
323	0.15
324	0.16
325	0.17
326	0.19
327	0.17
328	0.19
329	0.24
330	0.2
331	0.22
332	0.25
333	0.24
334	0.21
335	0.21
336	0.2
337	0.16
338	0.15
339	0.13
340	0.1
341	0.09
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.08
357	0.1
358	0.15
359	0.16
360	0.19
361	0.22
362	0.22
363	0.24
364	0.26
365	0.24
366	0.23
367	0.23
368	0.2
369	0.18
370	0.18
371	0.16
372	0.14
373	0.16
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.14
378	0.14
379	0.16
380	0.18
381	0.17
382	0.22
383	0.3
384	0.37
385	0.37
386	0.38
387	0.42
388	0.45
389	0.54
390	0.55
391	0.49
392	0.44
393	0.45
394	0.54
395	0.55
396	0.53
397	0.45
398	0.42
399	0.49
400	0.53
401	0.53
402	0.52
403	0.51
404	0.51
405	0.53
406	0.49
407	0.41
408	0.35
409	0.37
410	0.32
411	0.26
412	0.22
413	0.18
414	0.19
415	0.19
416	0.19
417	0.15
418	0.13
419	0.13
420	0.12
421	0.14
422	0.2
423	0.26
424	0.29
425	0.37
426	0.42
427	0.48
428	0.52
429	0.58
430	0.55
431	0.52
432	0.5
433	0.47
434	0.44
435	0.38
436	0.36
437	0.3
438	0.27
439	0.24
440	0.23
441	0.18
442	0.14
443	0.16
444	0.14
445	0.13
446	0.14
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.12
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.12
456	0.13
457	0.13
458	0.14
459	0.12
460	0.12
461	0.11
462	0.11
463	0.17
464	0.18
465	0.19
466	0.19
467	0.22
468	0.22
469	0.22
470	0.22
471	0.17
472	0.19
473	0.23
474	0.26
475	0.25
476	0.26
477	0.28
478	0.27
479	0.26
480	0.25
481	0.28
482	0.27
483	0.27
484	0.28
485	0.31
486	0.33
487	0.35
488	0.36
489	0.31
490	0.35
491	0.38
492	0.35
493	0.37
494	0.42
495	0.41
496	0.39
497	0.41
498	0.44
499	0.45
500	0.48
501	0.47
502	0.45
503	0.45
504	0.49
505	0.5
506	0.46
507	0.52
508	0.55
509	0.6
510	0.64
511	0.68

A0A0P1BJJ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer