Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P1BGH8

Protein Details
Accession A0A0P1BGH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-49ATPPRRERSPARNDDREFRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-58RRSASPRGATPPRRERSPARNDDREFRRERSPPRGDS
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003010  C-N_Hydrolase  
IPR036526  C-N_Hydrolase_sf  
IPR045254  Nit1/2_C-N_Hydrolase  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR001110  UPF0012_CS  
Gene Ontology GO:0016811  F:hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006807  P:nitrogen compound metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00795  CN_hydrolase  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50263  CN_HYDROLASE  
PS50102  RRM  
PS01227  UPF0012  
CDD cd07572  nit  
Amino Acid Sequences MADNDDWNDAARDAARDDYAPRRSASPRGATPPRRERSPARNDDREFRRERSPPRGDSFRGRPAPGSDNPNPGNNLHISGLSLKTTEQDLEDVFAKYGKLNKVQVMYDPHTREPRGFAFVTFDNNTDAEAAVEGANGVEILGRSITVAKARRGRARTPTPGRYCGPPKKDDLPPRGYGGYGPPGGYAVCQVEWEEKHLVRDSASAEHITFRMVLAAVAQLTSTGVIADNLAIASGLVKRAAASGAKALFLPEATDFIAPSPSVGALTRSAQARSFVPDLCKEAKQSNIWVSVGVHEAPAEESGDKERCYNTQVLIDNEGKVRESYRKLHLFDVDIKGGLTILESNTTIPGKAIPRVHPSPIGALGLQTCYDIRFPEPSLSLRRQGAQILTFPSAFTVRTGAAHWEVLLRARALDTQSYVLAAAQVGAHEGTKRVSYGHAMIVDPWGSIVAQCSDMQPYKPTLCFANIDLDALTSMRTEMPLWNQRRTDVYPEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.21
5 0.28
6 0.32
7 0.33
8 0.33
9 0.36
10 0.39
11 0.45
12 0.49
13 0.48
14 0.49
15 0.55
16 0.64
17 0.67
18 0.74
19 0.77
20 0.75
21 0.73
22 0.73
23 0.73
24 0.73
25 0.76
26 0.76
27 0.75
28 0.78
29 0.76
30 0.8
31 0.78
32 0.77
33 0.71
34 0.65
35 0.65
36 0.63
37 0.67
38 0.68
39 0.69
40 0.68
41 0.7
42 0.73
43 0.69
44 0.7
45 0.69
46 0.69
47 0.65
48 0.59
49 0.54
50 0.52
51 0.54
52 0.5
53 0.51
54 0.46
55 0.49
56 0.49
57 0.5
58 0.47
59 0.41
60 0.39
61 0.31
62 0.29
63 0.21
64 0.19
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.15
69 0.14
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.19
85 0.21
86 0.25
87 0.28
88 0.32
89 0.34
90 0.35
91 0.38
92 0.39
93 0.39
94 0.41
95 0.41
96 0.42
97 0.45
98 0.45
99 0.41
100 0.39
101 0.37
102 0.34
103 0.31
104 0.27
105 0.25
106 0.25
107 0.29
108 0.25
109 0.23
110 0.2
111 0.19
112 0.19
113 0.15
114 0.14
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.06
132 0.07
133 0.12
134 0.15
135 0.21
136 0.28
137 0.34
138 0.41
139 0.45
140 0.5
141 0.54
142 0.59
143 0.64
144 0.65
145 0.7
146 0.67
147 0.68
148 0.64
149 0.62
150 0.62
151 0.61
152 0.58
153 0.51
154 0.52
155 0.53
156 0.59
157 0.61
158 0.59
159 0.56
160 0.53
161 0.52
162 0.47
163 0.41
164 0.33
165 0.27
166 0.24
167 0.19
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.07
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.17
182 0.16
183 0.18
184 0.2
185 0.19
186 0.16
187 0.18
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.02
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.16
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.17
265 0.2
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.21
270 0.23
271 0.22
272 0.24
273 0.24
274 0.24
275 0.23
276 0.21
277 0.19
278 0.17
279 0.17
280 0.14
281 0.1
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.05
288 0.06
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.14
295 0.17
296 0.18
297 0.16
298 0.2
299 0.22
300 0.22
301 0.26
302 0.26
303 0.23
304 0.23
305 0.22
306 0.17
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.21
311 0.24
312 0.32
313 0.38
314 0.39
315 0.42
316 0.42
317 0.39
318 0.4
319 0.4
320 0.32
321 0.25
322 0.23
323 0.2
324 0.18
325 0.14
326 0.09
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.12
337 0.13
338 0.18
339 0.22
340 0.25
341 0.32
342 0.35
343 0.37
344 0.36
345 0.35
346 0.32
347 0.29
348 0.26
349 0.18
350 0.16
351 0.14
352 0.12
353 0.12
354 0.1
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.13
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.22
365 0.29
366 0.31
367 0.35
368 0.34
369 0.34
370 0.32
371 0.33
372 0.32
373 0.27
374 0.26
375 0.25
376 0.25
377 0.23
378 0.21
379 0.19
380 0.17
381 0.15
382 0.13
383 0.11
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.15
391 0.14
392 0.14
393 0.16
394 0.17
395 0.13
396 0.12
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.17
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.16
405 0.15
406 0.12
407 0.11
408 0.09
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.09
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.13
422 0.16
423 0.18
424 0.21
425 0.22
426 0.21
427 0.21
428 0.23
429 0.21
430 0.17
431 0.15
432 0.11
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.09
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.18
441 0.21
442 0.23
443 0.24
444 0.28
445 0.31
446 0.32
447 0.32
448 0.29
449 0.3
450 0.31
451 0.29
452 0.31
453 0.26
454 0.26
455 0.24
456 0.22
457 0.19
458 0.16
459 0.15
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.1
465 0.13
466 0.23
467 0.32
468 0.37
469 0.44
470 0.45
471 0.47
472 0.52
473 0.52