FuNGI

A0A0P1B981

Protein Details

Accession

A0A0P1B981

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-73	ASGSSKGKAKQDKEDRRRRKLEKRQRERERGSNGVA	Basic
458-493	ATRGETKEERRARREERKRKKQRLLDESRRKKEAKR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
43-68	KGKAKQDKEDRRRRKLEKRQRERERG
461-528	GETKEERRARREERKRKKQRLLDESRRKKEAKRAASSSSSSEKRKLKEKEEEEGESVRGSGKEKRRKV

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSESESIGSTSYASSYASASGMESDSNYSTSSVDPHSASGSSKGKAKQDKEDRRRRKLEKRQRERERGSNGVAGAHLRGLTVDHERSGGGSGSGRGGGGGGGEEGEELDVHVHTDMSKEEATSAFRVVYASFNLAIPPSLLHDPMTALLEIWDSLLIRYIPQLSGVLIAHDEHMFLRSSAAIDGDGAFATIPAAIKALVWAPQVGQRLEGKLTLSTSSHVSLLVHGTFNASISSMHLPTSESLALAESNSTSFERPNRGAQVWSFVEGYDLDGVGEHARAGAESEHHQQQQQQEEEEEEGDGRKSTGCWAKEDGGRLGGENGRIVFTVIGLTITSHTLSLHGSLLPSPFSLPLPHHSLPTHKSFLPFASRYGAASGRSGRRGKRSTNGGHGMEEEEEKEFQGAAAGAGARRVRWTGVDFDEIANADVGRGKEEGEGSEKEGSALAYESGEEDEKRSSATRGETKEERRARREERKRKKQRLLDESRRKKEAKRAASSSSSSEKRKLKEKEEEEGESVRGSGKEKRRKVDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.1
4	0.1
5	0.1
6	0.1
7	0.11
8	0.11
9	0.11
10	0.1
11	0.12
12	0.13
13	0.14
14	0.14
15	0.13
16	0.13
17	0.14
18	0.16
19	0.16
20	0.18
21	0.18
22	0.18
23	0.2
24	0.2
25	0.2
26	0.25
27	0.26
28	0.25
29	0.31
30	0.35
31	0.41
32	0.49
33	0.53
34	0.57
35	0.64
36	0.73
37	0.77
38	0.84
39	0.86
40	0.88
41	0.93
42	0.92
43	0.92
44	0.92
45	0.93
46	0.93
47	0.94
48	0.94
49	0.95
50	0.95
51	0.92
52	0.9
53	0.87
54	0.81
55	0.74
56	0.66
57	0.55
58	0.45
59	0.38
60	0.3
61	0.22
62	0.17
63	0.13
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.11
68	0.15
69	0.16
70	0.15
71	0.16
72	0.16
73	0.17
74	0.17
75	0.15
76	0.1
77	0.1
78	0.11
79	0.11
80	0.11
81	0.1
82	0.09
83	0.08
84	0.07
85	0.06
86	0.05
87	0.04
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.04
95	0.04
96	0.04
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.07
102	0.07
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.11
107	0.12
108	0.14
109	0.15
110	0.15
111	0.12
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.12
116	0.11
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.11
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.09
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.1
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.08
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.09
157	0.08
158	0.08
159	0.06
160	0.08
161	0.08
162	0.07
163	0.08
164	0.07
165	0.08
166	0.07
167	0.08
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.12
190	0.15
191	0.15
192	0.16
193	0.15
194	0.16
195	0.17
196	0.17
197	0.14
198	0.12
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.11
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.06
218	0.05
219	0.07
220	0.09
221	0.08
222	0.09
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.12
227	0.1
228	0.08
229	0.07
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.08
240	0.1
241	0.15
242	0.17
243	0.2
244	0.22
245	0.22
246	0.23
247	0.21
248	0.24
249	0.2
250	0.2
251	0.17
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.12
256	0.07
257	0.06
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.08
271	0.12
272	0.15
273	0.16
274	0.17
275	0.19
276	0.23
277	0.28
278	0.26
279	0.24
280	0.21
281	0.21
282	0.21
283	0.19
284	0.15
285	0.08
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.05
291	0.05
292	0.1
293	0.16
294	0.17
295	0.19
296	0.22
297	0.26
298	0.28
299	0.3
300	0.26
301	0.22
302	0.21
303	0.19
304	0.18
305	0.15
306	0.13
307	0.11
308	0.11
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.05
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.1
338	0.11
339	0.14
340	0.22
341	0.22
342	0.24
343	0.24
344	0.28
345	0.3
346	0.34
347	0.34
348	0.27
349	0.28
350	0.27
351	0.29
352	0.32
353	0.29
354	0.25
355	0.25
356	0.24
357	0.23
358	0.24
359	0.23
360	0.16
361	0.18
362	0.23
363	0.23
364	0.3
365	0.34
366	0.36
367	0.44
368	0.48
369	0.5
370	0.52
371	0.57
372	0.56
373	0.6
374	0.63
375	0.54
376	0.5
377	0.46
378	0.39
379	0.31
380	0.27
381	0.18
382	0.13
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.09
387	0.07
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.1
395	0.11
396	0.1
397	0.11
398	0.12
399	0.12
400	0.14
401	0.16
402	0.18
403	0.21
404	0.24
405	0.23
406	0.22
407	0.23
408	0.21
409	0.19
410	0.14
411	0.11
412	0.08
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.11
418	0.12
419	0.13
420	0.15
421	0.16
422	0.17
423	0.18
424	0.21
425	0.2
426	0.18
427	0.18
428	0.16
429	0.12
430	0.12
431	0.09
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.11
437	0.1
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.14
442	0.15
443	0.15
444	0.17
445	0.25
446	0.31
447	0.34
448	0.41
449	0.47
450	0.52
451	0.61
452	0.66
453	0.67
454	0.66
455	0.71
456	0.74
457	0.77
458	0.82
459	0.83
460	0.85
461	0.88
462	0.93
463	0.95
464	0.95
465	0.93
466	0.93
467	0.93
468	0.92
469	0.92
470	0.92
471	0.92
472	0.89
473	0.88
474	0.8
475	0.76
476	0.75
477	0.75
478	0.74
479	0.72
480	0.7
481	0.69
482	0.72
483	0.68
484	0.63
485	0.61
486	0.58
487	0.53
488	0.56
489	0.56
490	0.56
491	0.63
492	0.66
493	0.67
494	0.71
495	0.72
496	0.73
497	0.73
498	0.72
499	0.66
500	0.59
501	0.51
502	0.4
503	0.34
504	0.27
505	0.22
506	0.2
507	0.26
508	0.34
509	0.44
510	0.51

A0A0P1B981

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer