Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P1B9W4

Protein Details
Accession A0A0P1B9W4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-105LKEARAERDRKRAKKLNVNAKVDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-96RGGKEKRREEEVAQEKRRALKEARAERDRKRAKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 9.666, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
PF08799  PRP4  
Amino Acid Sequences MDALKAEIRKRKAEARSGEGGGGGGDYAALSDVQGESSLQGGAGASKHAGRGGGAAQAVEQERGGKEKRREEEVAQEKRRALKEARAERDRKRAKKLNVNAKVDECGGARDDGNASGSADATAAAASKDASLIDSQDATAAAAAHSLSELNSILETQRGLRAKGEPIQLFGESIKERRLRLRALELLEERGGGAGRSGQNDFMRAMAGAEAKDAEVALEAARRAELGMSSSADKFNLAKEGKDTQGDTQEGEEAQKKEKESVEEKGREGVGMNSLLDLELVKKDIDKVYPIIYYTLKGLLRDWEEALAQRSLEVRQTTQGKLMAATQVQSAEYLKPLFKQLRQRAVLPDVLMRLAEIVHYVQKRQYRYANDSYLQLSIGNAPWPIGVTMVGIHERSGREKIFSSNVAHVLNDEVSRKYIQSLKRLMTFAQTKYPPKDASFLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.65
4 0.61
5 0.55
6 0.46
7 0.38
8 0.28
9 0.21
10 0.13
11 0.06
12 0.05
13 0.04
14 0.04
15 0.04
16 0.04
17 0.04
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.06
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.15
45 0.16
46 0.14
47 0.13
48 0.13
49 0.13
50 0.19
51 0.23
52 0.28
53 0.35
54 0.44
55 0.48
56 0.53
57 0.56
58 0.54
59 0.6
60 0.62
61 0.65
62 0.61
63 0.6
64 0.56
65 0.59
66 0.58
67 0.53
68 0.47
69 0.44
70 0.5
71 0.56
72 0.62
73 0.63
74 0.67
75 0.68
76 0.76
77 0.78
78 0.75
79 0.75
80 0.76
81 0.76
82 0.8
83 0.83
84 0.84
85 0.83
86 0.81
87 0.74
88 0.66
89 0.59
90 0.49
91 0.41
92 0.3
93 0.21
94 0.17
95 0.15
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.07
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.18
149 0.2
150 0.25
151 0.31
152 0.26
153 0.27
154 0.27
155 0.25
156 0.23
157 0.2
158 0.19
159 0.13
160 0.14
161 0.18
162 0.19
163 0.21
164 0.26
165 0.3
166 0.29
167 0.31
168 0.36
169 0.34
170 0.33
171 0.36
172 0.32
173 0.29
174 0.27
175 0.23
176 0.17
177 0.13
178 0.11
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.16
227 0.19
228 0.2
229 0.21
230 0.21
231 0.16
232 0.2
233 0.2
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.14
239 0.17
240 0.14
241 0.17
242 0.19
243 0.19
244 0.21
245 0.23
246 0.26
247 0.25
248 0.31
249 0.37
250 0.37
251 0.37
252 0.36
253 0.34
254 0.3
255 0.27
256 0.2
257 0.13
258 0.11
259 0.11
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.08
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.17
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.18
287 0.2
288 0.21
289 0.2
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.19
294 0.15
295 0.12
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.16
300 0.16
301 0.14
302 0.19
303 0.24
304 0.24
305 0.26
306 0.27
307 0.23
308 0.22
309 0.23
310 0.2
311 0.17
312 0.16
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.1
319 0.11
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.2
324 0.24
325 0.28
326 0.38
327 0.45
328 0.53
329 0.55
330 0.57
331 0.56
332 0.55
333 0.52
334 0.42
335 0.36
336 0.27
337 0.24
338 0.21
339 0.15
340 0.12
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.21
349 0.26
350 0.3
351 0.35
352 0.41
353 0.43
354 0.5
355 0.56
356 0.58
357 0.54
358 0.53
359 0.48
360 0.41
361 0.34
362 0.26
363 0.18
364 0.14
365 0.14
366 0.13
367 0.12
368 0.11
369 0.11
370 0.12
371 0.11
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.1
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.15
381 0.16
382 0.2
383 0.24
384 0.23
385 0.25
386 0.26
387 0.3
388 0.32
389 0.35
390 0.35
391 0.34
392 0.37
393 0.35
394 0.33
395 0.29
396 0.26
397 0.24
398 0.22
399 0.2
400 0.17
401 0.19
402 0.2
403 0.2
404 0.22
405 0.27
406 0.31
407 0.38
408 0.44
409 0.47
410 0.52
411 0.53
412 0.49
413 0.52
414 0.52
415 0.46
416 0.48
417 0.49
418 0.51
419 0.55
420 0.61
421 0.56
422 0.52
423 0.53