Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0P1BQN6

Protein Details
Accession A0A0P1BQN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-360ERERAKTKWGFRRAIRRGTLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-251KNSKGKERAKER
337-357KDGFERERAKTKWGFRRAIRR
Subcellular Location(s) mito 13, cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022801  Ribosomal_S4/S9  
IPR018079  Ribosomal_S4_CS  
IPR002942  S4_RNA-bd  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01479  S4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00632  RIBOSOMAL_S4  
PS50889  S4  
CDD cd00165  S4  
Amino Acid Sequences MRNARTFAHDLKGNKPRMAWSADNLYSLIARSTVPNFVRETTFRATALTMYQQRWRSKRLLRSYHGDWLPEKRFKRWFLPTALPALLRDAIPSSKSTAAGARDRLALSRSASSSASGKPLLPGFGHDEPSADQQMPVASLFVREIERRLDTAVFRACFARSVYEARSLVVHGHVNLNGFRMRNPNTLLNPGDLISVDPTSIPMLSPKLRTGLFRNGGSAAFGDDVATEPVKRTTRPVNAKNSKGKERAKEREQTKEVKEASSARDESKDVGKEEAAAKNLAEEHLPQQTQKKVQLSPRRPPLLPAGVEPLAWEYYVKNSPRVRSDLRRQRETARVGKDGFERERAKTKWGFRRAIRRGTLGIYSPGGRIAPYDVGVSPKTPGPKPLMGKTPHPSRTARP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.47
4 0.47
5 0.51
6 0.44
7 0.4
8 0.44
9 0.43
10 0.42
11 0.37
12 0.32
13 0.26
14 0.23
15 0.19
16 0.11
17 0.1
18 0.12
19 0.14
20 0.21
21 0.22
22 0.24
23 0.26
24 0.28
25 0.32
26 0.31
27 0.34
28 0.31
29 0.32
30 0.29
31 0.28
32 0.26
33 0.23
34 0.24
35 0.26
36 0.26
37 0.27
38 0.34
39 0.4
40 0.48
41 0.52
42 0.55
43 0.56
44 0.59
45 0.66
46 0.7
47 0.72
48 0.69
49 0.72
50 0.72
51 0.72
52 0.65
53 0.58
54 0.5
55 0.49
56 0.51
57 0.52
58 0.49
59 0.47
60 0.53
61 0.55
62 0.6
63 0.61
64 0.59
65 0.58
66 0.63
67 0.58
68 0.55
69 0.52
70 0.44
71 0.35
72 0.31
73 0.26
74 0.18
75 0.16
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.25
87 0.27
88 0.25
89 0.26
90 0.26
91 0.26
92 0.23
93 0.21
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.18
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.15
110 0.18
111 0.2
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.2
116 0.23
117 0.23
118 0.16
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.18
139 0.22
140 0.19
141 0.19
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.15
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.21
151 0.21
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.15
157 0.14
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.17
168 0.2
169 0.22
170 0.24
171 0.27
172 0.27
173 0.31
174 0.3
175 0.25
176 0.22
177 0.19
178 0.16
179 0.12
180 0.1
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.14
195 0.15
196 0.17
197 0.2
198 0.26
199 0.28
200 0.27
201 0.28
202 0.26
203 0.25
204 0.24
205 0.19
206 0.11
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.16
220 0.22
221 0.31
222 0.41
223 0.47
224 0.54
225 0.6
226 0.67
227 0.72
228 0.71
229 0.69
230 0.69
231 0.68
232 0.65
233 0.68
234 0.69
235 0.67
236 0.7
237 0.66
238 0.67
239 0.66
240 0.64
241 0.57
242 0.56
243 0.51
244 0.43
245 0.42
246 0.34
247 0.33
248 0.32
249 0.3
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.24
254 0.27
255 0.27
256 0.21
257 0.21
258 0.2
259 0.2
260 0.24
261 0.24
262 0.2
263 0.18
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.15
268 0.12
269 0.1
270 0.11
271 0.16
272 0.17
273 0.17
274 0.22
275 0.27
276 0.31
277 0.36
278 0.39
279 0.39
280 0.48
281 0.57
282 0.6
283 0.64
284 0.7
285 0.69
286 0.64
287 0.62
288 0.6
289 0.56
290 0.49
291 0.41
292 0.37
293 0.32
294 0.32
295 0.29
296 0.23
297 0.16
298 0.15
299 0.13
300 0.08
301 0.13
302 0.2
303 0.21
304 0.27
305 0.31
306 0.36
307 0.41
308 0.47
309 0.5
310 0.53
311 0.62
312 0.65
313 0.7
314 0.72
315 0.7
316 0.7
317 0.71
318 0.69
319 0.67
320 0.62
321 0.59
322 0.53
323 0.53
324 0.52
325 0.51
326 0.46
327 0.46
328 0.43
329 0.42
330 0.51
331 0.48
332 0.5
333 0.5
334 0.57
335 0.59
336 0.65
337 0.68
338 0.67
339 0.77
340 0.78
341 0.8
342 0.75
343 0.68
344 0.62
345 0.57
346 0.52
347 0.43
348 0.38
349 0.31
350 0.28
351 0.24
352 0.23
353 0.19
354 0.16
355 0.14
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.16
360 0.15
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.2
366 0.25
367 0.25
368 0.3
369 0.33
370 0.4
371 0.46
372 0.51
373 0.57
374 0.55
375 0.61
376 0.65
377 0.68
378 0.66
379 0.65