Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JBX0

Protein Details
Accession G3JBX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
218-238AATSAKKQRERERKVKQTVDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-106EGARGGAAARGRGGRGGRRPR
246-318ERPRGGARGGARGGRGARGGDRGDRGDRGDRADRGDRGDRGDRGGRGDRGGRGDRGGRGDRGGRGGERGARGG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cmt:CCM_02814  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSSAITSQLTRNDEDGDAKPNAPVKTVDKATTHTTKRNVEPQAPVRAAGATGNRRGGPGGSEGAFRDRNAGSTRNQTRSTDEAPREGARGGAAARGRGGRGGRRPREQDDRHSRQDRDTTAKQTAQGWGSTEGNAELKDEQAGEAIAEGDKNVAIDAEAEPAEPEDNSVSYADYLAQQAEKKLALGGHKVREANEGSKLDKKWAGAKALENDEEAYVAATSAKKQRERERKVKQTVDFDPRFVEAERPRGGARGGARGGRGARGGDRGDRGDRGDRADRGDRGDRGDRGGRGDRGGRGDRGGRGDRGGRGGERGARGGHPAAANINTKDESAFPSLGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.28
4 0.27
5 0.26
6 0.27
7 0.3
8 0.29
9 0.27
10 0.29
11 0.27
12 0.33
13 0.37
14 0.38
15 0.34
16 0.38
17 0.43
18 0.48
19 0.49
20 0.48
21 0.52
22 0.54
23 0.59
24 0.63
25 0.63
26 0.58
27 0.62
28 0.61
29 0.63
30 0.57
31 0.51
32 0.44
33 0.38
34 0.33
35 0.27
36 0.28
37 0.23
38 0.26
39 0.29
40 0.28
41 0.28
42 0.29
43 0.26
44 0.21
45 0.18
46 0.18
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.22
51 0.23
52 0.2
53 0.22
54 0.19
55 0.22
56 0.24
57 0.26
58 0.24
59 0.33
60 0.41
61 0.42
62 0.45
63 0.43
64 0.45
65 0.47
66 0.49
67 0.47
68 0.42
69 0.39
70 0.39
71 0.39
72 0.35
73 0.29
74 0.24
75 0.16
76 0.15
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.18
86 0.2
87 0.29
88 0.39
89 0.44
90 0.51
91 0.57
92 0.6
93 0.68
94 0.66
95 0.67
96 0.68
97 0.69
98 0.7
99 0.72
100 0.67
101 0.61
102 0.62
103 0.56
104 0.53
105 0.5
106 0.45
107 0.44
108 0.44
109 0.4
110 0.36
111 0.35
112 0.28
113 0.24
114 0.21
115 0.19
116 0.18
117 0.16
118 0.15
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.04
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.15
173 0.18
174 0.2
175 0.23
176 0.23
177 0.23
178 0.25
179 0.26
180 0.22
181 0.24
182 0.23
183 0.22
184 0.27
185 0.26
186 0.26
187 0.25
188 0.25
189 0.25
190 0.27
191 0.28
192 0.25
193 0.29
194 0.3
195 0.32
196 0.31
197 0.25
198 0.22
199 0.19
200 0.17
201 0.13
202 0.09
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.14
209 0.2
210 0.25
211 0.32
212 0.42
213 0.52
214 0.61
215 0.69
216 0.74
217 0.79
218 0.83
219 0.84
220 0.79
221 0.75
222 0.73
223 0.73
224 0.63
225 0.53
226 0.46
227 0.39
228 0.35
229 0.29
230 0.29
231 0.22
232 0.28
233 0.29
234 0.29
235 0.28
236 0.28
237 0.28
238 0.24
239 0.23
240 0.23
241 0.24
242 0.23
243 0.24
244 0.25
245 0.26
246 0.24
247 0.23
248 0.17
249 0.17
250 0.2
251 0.21
252 0.22
253 0.24
254 0.26
255 0.27
256 0.27
257 0.29
258 0.31
259 0.31
260 0.33
261 0.36
262 0.35
263 0.38
264 0.43
265 0.41
266 0.41
267 0.46
268 0.41
269 0.42
270 0.46
271 0.41
272 0.41
273 0.44
274 0.4
275 0.4
276 0.44
277 0.4
278 0.38
279 0.4
280 0.39
281 0.4
282 0.43
283 0.38
284 0.36
285 0.38
286 0.38
287 0.41
288 0.41
289 0.36
290 0.35
291 0.38
292 0.37
293 0.36
294 0.36
295 0.3
296 0.29
297 0.31
298 0.33
299 0.31
300 0.31
301 0.29
302 0.27
303 0.29
304 0.28
305 0.28
306 0.23
307 0.22
308 0.23
309 0.25
310 0.29
311 0.26
312 0.29
313 0.25
314 0.25
315 0.25
316 0.23
317 0.23
318 0.23