Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U5HMQ6

Protein Details
Accession A0A0U5HMQ6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-26STINKRPTLNRSPSRENQNYSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR004152  GAT_dom  
IPR038425  GAT_sf  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF03127  GAT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50909  GAT  
PS50179  VHS  
CDD cd21383  GAT_GGA_Tom1-like  
Amino Acid Sequences MKRLLSTINKRPTLNRSPSRENQNYSEDSPESIIIREVNAFCQEGQGPHHPQGEEYVHLPSIVESAESSPNAAREAAHLLRKLLSTPNSTPTNIQYNAIMLMRILIDNPGHTFSRNLDAKFIATIKDMLRQGKDMGVQRFLRETLDALETQRGWDEDLKPFVEMWKKEKVKMDKAYNNNKSNGRGTWRGSPSRQNSDQMFRVERTDSLPSPDELVARISEAKTSAKLLMQFVQSTTPAEMLSNDLITEFSGRCRRASRAIQNYIHATNPPPDEDTLLTLIETNDELSVALSKHQRAMLQARKALGQQTPPVESANQSPEPNDQLAGAGAVRQIPPPPLPQRSQTPPPHSPPSPISPEALTHRSGTTKTVVSDVSTAGGNPSAGRYEYRSEDYQVQNPFADNYSIPAILPGPADEPGRVEEQRDQWNGTSQTAKPPQNQNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.69
3 0.67
4 0.72
5 0.78
6 0.82
7 0.81
8 0.76
9 0.71
10 0.69
11 0.65
12 0.58
13 0.55
14 0.45
15 0.38
16 0.34
17 0.3
18 0.24
19 0.2
20 0.19
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.17
25 0.18
26 0.2
27 0.2
28 0.18
29 0.21
30 0.22
31 0.19
32 0.23
33 0.28
34 0.31
35 0.35
36 0.4
37 0.36
38 0.35
39 0.39
40 0.37
41 0.31
42 0.28
43 0.25
44 0.2
45 0.2
46 0.2
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.09
51 0.07
52 0.09
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.19
63 0.21
64 0.25
65 0.25
66 0.25
67 0.27
68 0.27
69 0.27
70 0.27
71 0.27
72 0.28
73 0.3
74 0.35
75 0.37
76 0.37
77 0.37
78 0.35
79 0.38
80 0.33
81 0.31
82 0.25
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.17
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.23
102 0.26
103 0.25
104 0.24
105 0.25
106 0.25
107 0.26
108 0.24
109 0.16
110 0.13
111 0.16
112 0.14
113 0.2
114 0.22
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.24
119 0.23
120 0.28
121 0.28
122 0.27
123 0.31
124 0.3
125 0.3
126 0.3
127 0.28
128 0.24
129 0.18
130 0.17
131 0.13
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.12
140 0.11
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.2
145 0.21
146 0.2
147 0.2
148 0.22
149 0.24
150 0.23
151 0.24
152 0.31
153 0.32
154 0.36
155 0.44
156 0.48
157 0.5
158 0.57
159 0.62
160 0.6
161 0.67
162 0.74
163 0.75
164 0.72
165 0.68
166 0.62
167 0.56
168 0.51
169 0.45
170 0.39
171 0.35
172 0.34
173 0.37
174 0.4
175 0.41
176 0.41
177 0.47
178 0.47
179 0.5
180 0.5
181 0.46
182 0.43
183 0.44
184 0.45
185 0.39
186 0.36
187 0.28
188 0.28
189 0.24
190 0.22
191 0.2
192 0.2
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.17
197 0.18
198 0.18
199 0.15
200 0.12
201 0.13
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.09
237 0.15
238 0.16
239 0.18
240 0.2
241 0.23
242 0.29
243 0.38
244 0.43
245 0.47
246 0.55
247 0.54
248 0.54
249 0.55
250 0.48
251 0.4
252 0.31
253 0.23
254 0.2
255 0.19
256 0.18
257 0.16
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.09
277 0.12
278 0.13
279 0.15
280 0.17
281 0.18
282 0.2
283 0.29
284 0.34
285 0.37
286 0.38
287 0.37
288 0.37
289 0.37
290 0.37
291 0.3
292 0.26
293 0.24
294 0.24
295 0.26
296 0.25
297 0.25
298 0.22
299 0.21
300 0.21
301 0.23
302 0.23
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.26
307 0.25
308 0.21
309 0.15
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.09
314 0.06
315 0.06
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.14
322 0.21
323 0.28
324 0.32
325 0.34
326 0.38
327 0.44
328 0.49
329 0.57
330 0.59
331 0.6
332 0.62
333 0.66
334 0.69
335 0.63
336 0.6
337 0.56
338 0.54
339 0.52
340 0.46
341 0.41
342 0.34
343 0.36
344 0.37
345 0.35
346 0.29
347 0.24
348 0.24
349 0.25
350 0.25
351 0.24
352 0.22
353 0.22
354 0.21
355 0.22
356 0.21
357 0.2
358 0.21
359 0.18
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.1
364 0.11
365 0.09
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.15
372 0.19
373 0.24
374 0.29
375 0.3
376 0.32
377 0.39
378 0.41
379 0.44
380 0.43
381 0.41
382 0.36
383 0.35
384 0.33
385 0.27
386 0.24
387 0.18
388 0.17
389 0.18
390 0.17
391 0.16
392 0.16
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.11
398 0.13
399 0.15
400 0.14
401 0.15
402 0.17
403 0.21
404 0.21
405 0.22
406 0.27
407 0.32
408 0.41
409 0.42
410 0.43
411 0.39
412 0.48
413 0.47
414 0.43
415 0.42
416 0.35
417 0.42
418 0.48
419 0.52
420 0.52