Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U5FVY2

Protein Details
Accession A0A0U5FVY2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
345-365IISTPQKSNKKRQQTKPSLDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-472RGKGKGKQLALEQQKSPAIRPKLAATGKSKGLGTIGGKKGAKPKPKEPSPAP
524-541APKPSRGLGVIGGKKKKE
585-605KKNKPIGKLGIIGGSKAKPKT
669-693DRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 13, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MRVKARVRKKVGVSRCSVDSSCERREGGRKVCHLKVARALLPSPLGCLPACQQQLRLLTSSGIALSSLLLSITQKVRTIMSTAWQQLRLSNQGNLPPLLFKYSTTASGYELFMTDLSYIWSERLDRKAILKRADEEDTTIDPSEDPEQFEVLLQKIGEGLQNGPGSSSILTPKTHDKTQGFALTVTSKLPAPLRPLEWRLHLFREPQSSTTSHLLLPLIRAEGDRAARQQSLIEELGKKDWVLSKLFDKIEAMGIDLSTIFPGTSGLRSGRKGPTLAQAAKYIKGLAPFNEKSWLEEVDKSANDSGLVGNIVAAVSSQFSKESASLKPPPDEWWNDLTVSDSPTIISTPQKSNKKRQQTKPSLDAMDIDTDAGSETGDEEFERQETPPQLKKPTETPPKAVFEDADEETQSEDEDVRLPNRGKGKGKQLALEQQKSPAIRPKLAATGKSKGLGTIGGKKGAKPKPKEPSPAPAPSPPEAKAETTSPQTTKHQPLKPPLNEYDDGTTDDEPSKTTKANNDTRKTAPKPSRGLGVIGGKKKKEPEPEPEPEPETRSQSPSQAKPDEDSQSPDPDLRTQAQQTVSEPKKNKPIGKLGIIGGSKAKPKTNTKPRESVFPTPIWEKVGDEEKEDRKGLRESTPSALAPADRMVKKDTPAPPEPEREETEQERADRKREELKRQLEAKSKAPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.67
3 0.64
4 0.54
5 0.49
6 0.49
7 0.48
8 0.47
9 0.46
10 0.44
11 0.44
12 0.52
13 0.56
14 0.56
15 0.58
16 0.62
17 0.65
18 0.67
19 0.7
20 0.66
21 0.63
22 0.62
23 0.6
24 0.55
25 0.51
26 0.48
27 0.42
28 0.42
29 0.36
30 0.31
31 0.25
32 0.23
33 0.19
34 0.21
35 0.21
36 0.25
37 0.29
38 0.27
39 0.29
40 0.33
41 0.38
42 0.39
43 0.38
44 0.3
45 0.26
46 0.26
47 0.24
48 0.18
49 0.13
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.11
59 0.14
60 0.16
61 0.17
62 0.18
63 0.2
64 0.21
65 0.23
66 0.2
67 0.21
68 0.27
69 0.31
70 0.34
71 0.36
72 0.35
73 0.34
74 0.38
75 0.4
76 0.36
77 0.34
78 0.33
79 0.35
80 0.38
81 0.35
82 0.31
83 0.26
84 0.24
85 0.25
86 0.22
87 0.17
88 0.19
89 0.2
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.18
97 0.16
98 0.14
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.12
109 0.17
110 0.21
111 0.23
112 0.24
113 0.32
114 0.4
115 0.46
116 0.49
117 0.48
118 0.48
119 0.5
120 0.51
121 0.44
122 0.37
123 0.34
124 0.3
125 0.28
126 0.24
127 0.19
128 0.16
129 0.17
130 0.19
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.14
155 0.12
156 0.14
157 0.15
158 0.17
159 0.25
160 0.29
161 0.31
162 0.37
163 0.35
164 0.35
165 0.41
166 0.42
167 0.35
168 0.3
169 0.3
170 0.24
171 0.23
172 0.2
173 0.16
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.15
178 0.19
179 0.22
180 0.25
181 0.3
182 0.33
183 0.34
184 0.37
185 0.38
186 0.36
187 0.37
188 0.37
189 0.35
190 0.36
191 0.41
192 0.37
193 0.35
194 0.35
195 0.31
196 0.32
197 0.31
198 0.28
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.16
203 0.16
204 0.13
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.12
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.15
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.13
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.25
233 0.25
234 0.24
235 0.2
236 0.19
237 0.2
238 0.18
239 0.15
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.05
246 0.05
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.1
254 0.13
255 0.14
256 0.19
257 0.21
258 0.23
259 0.23
260 0.23
261 0.28
262 0.32
263 0.33
264 0.3
265 0.33
266 0.32
267 0.32
268 0.3
269 0.24
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.15
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.27
278 0.26
279 0.24
280 0.25
281 0.25
282 0.19
283 0.2
284 0.2
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.16
289 0.14
290 0.12
291 0.11
292 0.09
293 0.06
294 0.06
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.07
309 0.09
310 0.1
311 0.16
312 0.21
313 0.23
314 0.24
315 0.24
316 0.26
317 0.28
318 0.29
319 0.27
320 0.24
321 0.23
322 0.22
323 0.21
324 0.19
325 0.15
326 0.14
327 0.11
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.09
334 0.1
335 0.16
336 0.24
337 0.33
338 0.38
339 0.48
340 0.56
341 0.65
342 0.72
343 0.76
344 0.8
345 0.81
346 0.83
347 0.79
348 0.75
349 0.65
350 0.55
351 0.46
352 0.35
353 0.26
354 0.19
355 0.13
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.05
360 0.04
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.1
372 0.12
373 0.18
374 0.23
375 0.26
376 0.31
377 0.32
378 0.34
379 0.36
380 0.43
381 0.49
382 0.46
383 0.48
384 0.47
385 0.5
386 0.49
387 0.44
388 0.34
389 0.25
390 0.26
391 0.22
392 0.17
393 0.13
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.1
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.13
405 0.14
406 0.18
407 0.23
408 0.29
409 0.32
410 0.36
411 0.45
412 0.47
413 0.48
414 0.47
415 0.45
416 0.48
417 0.51
418 0.5
419 0.4
420 0.36
421 0.37
422 0.35
423 0.34
424 0.33
425 0.29
426 0.27
427 0.28
428 0.27
429 0.33
430 0.35
431 0.37
432 0.34
433 0.35
434 0.34
435 0.34
436 0.32
437 0.24
438 0.22
439 0.2
440 0.18
441 0.22
442 0.23
443 0.26
444 0.27
445 0.29
446 0.38
447 0.42
448 0.48
449 0.46
450 0.53
451 0.58
452 0.65
453 0.71
454 0.65
455 0.67
456 0.66
457 0.65
458 0.6
459 0.54
460 0.51
461 0.46
462 0.45
463 0.37
464 0.34
465 0.29
466 0.28
467 0.25
468 0.23
469 0.23
470 0.24
471 0.26
472 0.24
473 0.26
474 0.29
475 0.34
476 0.41
477 0.47
478 0.49
479 0.52
480 0.6
481 0.67
482 0.67
483 0.66
484 0.61
485 0.58
486 0.53
487 0.49
488 0.43
489 0.34
490 0.31
491 0.27
492 0.23
493 0.18
494 0.19
495 0.17
496 0.14
497 0.16
498 0.16
499 0.15
500 0.18
501 0.23
502 0.3
503 0.4
504 0.49
505 0.52
506 0.55
507 0.59
508 0.66
509 0.63
510 0.65
511 0.63
512 0.62
513 0.63
514 0.59
515 0.6
516 0.51
517 0.49
518 0.43
519 0.44
520 0.42
521 0.43
522 0.46
523 0.41
524 0.43
525 0.47
526 0.49
527 0.5
528 0.49
529 0.51
530 0.55
531 0.6
532 0.61
533 0.59
534 0.57
535 0.49
536 0.48
537 0.42
538 0.39
539 0.36
540 0.37
541 0.35
542 0.39
543 0.45
544 0.46
545 0.51
546 0.49
547 0.48
548 0.46
549 0.5
550 0.46
551 0.41
552 0.4
553 0.35
554 0.35
555 0.34
556 0.33
557 0.29
558 0.27
559 0.29
560 0.26
561 0.29
562 0.26
563 0.3
564 0.31
565 0.31
566 0.31
567 0.38
568 0.4
569 0.43
570 0.44
571 0.45
572 0.52
573 0.58
574 0.61
575 0.58
576 0.63
577 0.61
578 0.63
579 0.61
580 0.52
581 0.51
582 0.46
583 0.39
584 0.33
585 0.29
586 0.3
587 0.29
588 0.33
589 0.34
590 0.43
591 0.53
592 0.6
593 0.68
594 0.7
595 0.77
596 0.73
597 0.77
598 0.75
599 0.72
600 0.66
601 0.59
602 0.56
603 0.49
604 0.49
605 0.41
606 0.35
607 0.27
608 0.27
609 0.32
610 0.28
611 0.3
612 0.36
613 0.38
614 0.42
615 0.42
616 0.39
617 0.35
618 0.39
619 0.38
620 0.38
621 0.4
622 0.39
623 0.42
624 0.45
625 0.41
626 0.37
627 0.35
628 0.27
629 0.23
630 0.23
631 0.27
632 0.24
633 0.26
634 0.31
635 0.33
636 0.35
637 0.41
638 0.44
639 0.43
640 0.49
641 0.53
642 0.54
643 0.58
644 0.61
645 0.59
646 0.57
647 0.55
648 0.55
649 0.52
650 0.53
651 0.49
652 0.48
653 0.51
654 0.5
655 0.51
656 0.48
657 0.5
658 0.53
659 0.58
660 0.64
661 0.66
662 0.7
663 0.73
664 0.75
665 0.78
666 0.77
667 0.73
668 0.68
669 0.68
670 0.68
671 0.67
672 0.7
673 0.73