Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0U5G219

Protein Details
Accession A0A0U5G219    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-423LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-414KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MGASKQKQTQAKKSTTLPTDLVPAISAFLAENGFPDTGKAFAQELAKKSISSNKTSGVSLLELFQQREAQTKVESTTSSSAASKSSSDSSSDSDADSSSDDSDSDVEMAETPKSKRRGSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSCDSDADDEDEDEAALTPAPVPKGVKRKAESSSSSSGSDSEEAPKTKKTKITSAKGKESSSSSSDSDSSSTSSGSSSDSDSSSDSDSDSSSDSSSGSSSSSSDSSSDSDSDSSSESSSSDSESESDSVKKADKKALKTATKTPLPESGSDSDSSSSSEEGDSSDKSSGTLDNSESEAVSASKPTTAATTTTTTRTITETPVSSSASPAPGNGNKKKHTGARPTPLAALSELPSANDHISNDYVPYAYAERAWKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDISGGKGFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.68
3 0.64
4 0.55
5 0.47
6 0.45
7 0.4
8 0.33
9 0.25
10 0.2
11 0.16
12 0.14
13 0.13
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.08
19 0.1
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.12
27 0.11
28 0.14
29 0.21
30 0.25
31 0.28
32 0.33
33 0.33
34 0.32
35 0.33
36 0.39
37 0.37
38 0.38
39 0.38
40 0.36
41 0.38
42 0.38
43 0.36
44 0.29
45 0.26
46 0.21
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.21
54 0.26
55 0.26
56 0.23
57 0.22
58 0.23
59 0.24
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.22
64 0.21
65 0.21
66 0.2
67 0.19
68 0.18
69 0.19
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.16
74 0.18
75 0.19
76 0.2
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.14
99 0.21
100 0.26
101 0.28
102 0.32
103 0.38
104 0.43
105 0.46
106 0.53
107 0.53
108 0.53
109 0.54
110 0.51
111 0.45
112 0.39
113 0.34
114 0.25
115 0.2
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.08
140 0.07
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.15
150 0.25
151 0.31
152 0.37
153 0.38
154 0.43
155 0.46
156 0.5
157 0.48
158 0.44
159 0.43
160 0.38
161 0.36
162 0.31
163 0.28
164 0.23
165 0.2
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.17
171 0.22
172 0.23
173 0.26
174 0.31
175 0.3
176 0.37
177 0.45
178 0.53
179 0.58
180 0.62
181 0.66
182 0.65
183 0.62
184 0.54
185 0.47
186 0.41
187 0.33
188 0.29
189 0.21
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.1
254 0.11
255 0.15
256 0.19
257 0.2
258 0.27
259 0.32
260 0.36
261 0.44
262 0.52
263 0.54
264 0.55
265 0.6
266 0.6
267 0.58
268 0.55
269 0.48
270 0.46
271 0.41
272 0.39
273 0.35
274 0.3
275 0.27
276 0.26
277 0.25
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.13
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.13
315 0.16
316 0.18
317 0.2
318 0.21
319 0.2
320 0.2
321 0.22
322 0.21
323 0.2
324 0.22
325 0.21
326 0.22
327 0.24
328 0.25
329 0.22
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.19
334 0.17
335 0.21
336 0.25
337 0.34
338 0.4
339 0.46
340 0.46
341 0.51
342 0.56
343 0.59
344 0.62
345 0.64
346 0.66
347 0.68
348 0.69
349 0.67
350 0.63
351 0.55
352 0.47
353 0.37
354 0.3
355 0.22
356 0.2
357 0.17
358 0.16
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.15
375 0.19
376 0.2
377 0.23
378 0.24
379 0.22
380 0.23
381 0.27
382 0.31
383 0.35
384 0.36
385 0.36
386 0.41
387 0.41
388 0.46
389 0.49
390 0.52
391 0.55
392 0.63
393 0.71
394 0.76
395 0.85
396 0.87
397 0.9
398 0.91
399 0.9
400 0.9
401 0.89
402 0.88
403 0.88
404 0.83
405 0.72
406 0.62
407 0.57
408 0.47
409 0.41
410 0.32
411 0.23
412 0.2