Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RDE2

Protein Details
Accession A0A0J8RDE2    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-51VSSSSSQPSKKPRLHPLRQTSFPTSHydrophilic
88-109GVGAGRGRRKKGKKDRDDASGSBasic
340-361GETRHAGRRRPFKLPPNPHRGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-103GRGRRKKGKKDR
346-357GRRRPFKLPPNP
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6.5, cyto_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSLSPPPTTLSLPASNSKKRPSLSSAVSSSSSQPSKKPRLHPLRQTSFPTSADTDPRVYAGATSARSEIDGASVTGSFTGSLTGSVDGVGAGRGRRKKGKKDRDDASGSVRAGTVDGKGAGSAKGGVGDEEGEEDDDDDLGDTELMERDDVAVDAEAEKKNLAILIDAFNPEQSERYDLFKRAKLNKPTLRKIVNQTLSQSVPPNVITTISGYTKIFIGEMVEKARTVQQQWADTTDAAALEAYEAEEEELTIQEESQAAEQVSDPSGQEKPKPTTSLPSPSIVKVEGPKEPVIKKEESQSFDGISVSTPPNSTQTTLQSTMSFDMSPATTATTVTTAPGETRHAGRRRPFKLPPNPHRGPLLPSHLREAFRRYRRDGEGGGVGFTGLSMNGLSVRGAFTWSVRSGSGGRRLFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.5
3 0.54
4 0.58
5 0.59
6 0.56
7 0.58
8 0.57
9 0.58
10 0.56
11 0.57
12 0.53
13 0.5
14 0.5
15 0.45
16 0.41
17 0.4
18 0.39
19 0.33
20 0.37
21 0.44
22 0.52
23 0.59
24 0.64
25 0.68
26 0.74
27 0.82
28 0.86
29 0.87
30 0.85
31 0.83
32 0.81
33 0.76
34 0.7
35 0.61
36 0.54
37 0.47
38 0.42
39 0.4
40 0.36
41 0.32
42 0.28
43 0.28
44 0.24
45 0.2
46 0.17
47 0.15
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.14
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.15
80 0.2
81 0.26
82 0.36
83 0.45
84 0.55
85 0.65
86 0.75
87 0.79
88 0.83
89 0.82
90 0.81
91 0.78
92 0.69
93 0.64
94 0.58
95 0.47
96 0.39
97 0.33
98 0.25
99 0.2
100 0.18
101 0.12
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.09
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.11
162 0.11
163 0.16
164 0.19
165 0.22
166 0.26
167 0.28
168 0.35
169 0.4
170 0.47
171 0.5
172 0.57
173 0.61
174 0.65
175 0.68
176 0.68
177 0.64
178 0.59
179 0.58
180 0.58
181 0.54
182 0.47
183 0.43
184 0.39
185 0.35
186 0.32
187 0.27
188 0.18
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.16
216 0.19
217 0.21
218 0.22
219 0.24
220 0.21
221 0.2
222 0.19
223 0.15
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.12
255 0.13
256 0.17
257 0.22
258 0.26
259 0.3
260 0.33
261 0.32
262 0.36
263 0.4
264 0.44
265 0.41
266 0.4
267 0.38
268 0.35
269 0.35
270 0.29
271 0.26
272 0.22
273 0.22
274 0.21
275 0.23
276 0.25
277 0.28
278 0.29
279 0.32
280 0.32
281 0.33
282 0.31
283 0.37
284 0.41
285 0.39
286 0.4
287 0.37
288 0.33
289 0.3
290 0.29
291 0.2
292 0.14
293 0.14
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.15
299 0.17
300 0.18
301 0.18
302 0.21
303 0.27
304 0.28
305 0.28
306 0.26
307 0.26
308 0.25
309 0.24
310 0.19
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.11
327 0.13
328 0.14
329 0.19
330 0.28
331 0.33
332 0.4
333 0.48
334 0.57
335 0.59
336 0.66
337 0.7
338 0.71
339 0.76
340 0.8
341 0.82
342 0.81
343 0.79
344 0.74
345 0.7
346 0.62
347 0.55
348 0.51
349 0.51
350 0.48
351 0.46
352 0.49
353 0.49
354 0.49
355 0.48
356 0.49
357 0.5
358 0.52
359 0.58
360 0.57
361 0.6
362 0.63
363 0.66
364 0.59
365 0.54
366 0.52
367 0.45
368 0.39
369 0.31
370 0.25
371 0.19
372 0.17
373 0.12
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.08
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.16
388 0.18
389 0.19
390 0.18
391 0.21
392 0.23
393 0.3
394 0.38