Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RQA7

Protein Details
Accession A0A0J8RQA7    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-88VSSPMAAEKKDKKRKAASSSSAVETDPPSKKSKKSFVKNAKAPTETKSKGASKDKKPNNVTNGKAHydrophilic
132-156ASVTNESVKRPKKKAKEEAKATTTTHydrophilic
167-187ANAKEKKESFKKSKKEVEVRAHydrophilic
226-251PQIPDSKQVKRKIRKLKKNHTDEPEEBasic
441-465QEELKKATKKSKKSKDSANASAKKAHydrophilic
488-517DTRKAQNGETKSKKDKRPKAKTPTVVADNTHydrophilic
536-557IKDKLGKVEKPEKSKKSKKSKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-42EKKDKKRKAASS
49-81DPPSKKSKKSFVKNAKAPTETKSKGASKDKKPN
140-151KRPKKKAKEEAK
168-181NAKEKKESFKKSKK
235-243KRKIRKLKK
369-385SKKIAKEESKRAAKAEK
445-465KKATKKSKKSKDSANASAKKA
478-510HEKPAKIKEADTRKAQNGETKSKKDKRPKAKTP
519-557KPSKSNPSEAKDPKGKEIKDKLGKVEKPEKSKKSKKSKA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSLVGAKNTRTAEPDRKQTQNPRVSSPMAAEKKDKKRKAASSSSAVETDPPSKKSKKSFVKNAKAPTETKSKGASKDKKPNNVTNGKATKPLNLDNAPARDIKPRKRAADFLSDEEDEITKRDKKDALKDSASVTNESVKRPKKKAKEEAKATTTTTEKVSLKKDDANAKEKKESFKKSKKEVEVRADNEHESEDDQTLALIRGFDSSGEEDISGDEGFEPGQAVPQIPDSKQVKRKIRKLKKNHTDEPEEPGTVYIGRIPHGFYEHEMRAYFSQFGDITRLRMSRNRTTGRSKHYGYIEFASESVAKIVADTMDNYLMFGHILKCKFVPQDQLHPETFKGANRRFKSVPWNQIEKKQLEAGKTRDQWSKKIAKEESKRAAKAEKMKALGYEIDLPKLASVDGVPAQKTLAQAKTAIEDDNIEAPKAIEAPPKAITKPDAQEELKKATKKSKKSKDSANASAKKADAPVSEQTKEATHEKPAKIKEADTRKAQNGETKSKKDKRPKAKTPTVVADNTEKPSKSNPSEAKDPKGKEIKDKLGKVEKPEKSKKSKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.59
3 0.63
4 0.7
5 0.76
6 0.79
7 0.77
8 0.73
9 0.7
10 0.68
11 0.63
12 0.56
13 0.51
14 0.51
15 0.47
16 0.47
17 0.49
18 0.53
19 0.62
20 0.71
21 0.72
22 0.71
23 0.75
24 0.82
25 0.83
26 0.83
27 0.8
28 0.77
29 0.75
30 0.69
31 0.6
32 0.51
33 0.43
34 0.36
35 0.36
36 0.33
37 0.32
38 0.36
39 0.41
40 0.47
41 0.55
42 0.62
43 0.65
44 0.7
45 0.78
46 0.82
47 0.87
48 0.88
49 0.88
50 0.85
51 0.78
52 0.7
53 0.64
54 0.63
55 0.53
56 0.5
57 0.48
58 0.46
59 0.5
60 0.59
61 0.64
62 0.64
63 0.73
64 0.78
65 0.8
66 0.82
67 0.82
68 0.81
69 0.8
70 0.74
71 0.73
72 0.71
73 0.62
74 0.61
75 0.54
76 0.49
77 0.46
78 0.46
79 0.43
80 0.38
81 0.41
82 0.4
83 0.42
84 0.38
85 0.35
86 0.32
87 0.35
88 0.41
89 0.47
90 0.5
91 0.56
92 0.6
93 0.63
94 0.67
95 0.63
96 0.65
97 0.59
98 0.53
99 0.5
100 0.44
101 0.39
102 0.34
103 0.3
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.24
110 0.28
111 0.34
112 0.44
113 0.51
114 0.54
115 0.51
116 0.52
117 0.51
118 0.52
119 0.47
120 0.38
121 0.3
122 0.3
123 0.29
124 0.31
125 0.36
126 0.39
127 0.46
128 0.54
129 0.63
130 0.65
131 0.74
132 0.81
133 0.83
134 0.85
135 0.86
136 0.86
137 0.8
138 0.72
139 0.63
140 0.56
141 0.46
142 0.37
143 0.29
144 0.27
145 0.24
146 0.26
147 0.3
148 0.31
149 0.32
150 0.35
151 0.38
152 0.41
153 0.45
154 0.49
155 0.5
156 0.49
157 0.54
158 0.53
159 0.56
160 0.56
161 0.6
162 0.63
163 0.67
164 0.72
165 0.73
166 0.79
167 0.81
168 0.81
169 0.8
170 0.79
171 0.77
172 0.72
173 0.68
174 0.6
175 0.51
176 0.42
177 0.34
178 0.25
179 0.17
180 0.15
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.1
214 0.12
215 0.11
216 0.2
217 0.22
218 0.29
219 0.36
220 0.45
221 0.51
222 0.58
223 0.68
224 0.71
225 0.79
226 0.82
227 0.85
228 0.88
229 0.88
230 0.89
231 0.87
232 0.82
233 0.78
234 0.69
235 0.65
236 0.55
237 0.45
238 0.36
239 0.28
240 0.22
241 0.15
242 0.13
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.15
253 0.14
254 0.16
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.16
259 0.15
260 0.1
261 0.11
262 0.09
263 0.1
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.14
268 0.15
269 0.14
270 0.19
271 0.24
272 0.27
273 0.35
274 0.38
275 0.41
276 0.48
277 0.53
278 0.56
279 0.56
280 0.51
281 0.48
282 0.47
283 0.44
284 0.38
285 0.33
286 0.27
287 0.21
288 0.19
289 0.15
290 0.12
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.1
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.15
314 0.17
315 0.18
316 0.25
317 0.24
318 0.33
319 0.37
320 0.41
321 0.39
322 0.38
323 0.37
324 0.31
325 0.3
326 0.23
327 0.28
328 0.3
329 0.39
330 0.4
331 0.46
332 0.43
333 0.45
334 0.52
335 0.51
336 0.54
337 0.51
338 0.57
339 0.54
340 0.59
341 0.63
342 0.54
343 0.48
344 0.43
345 0.4
346 0.35
347 0.39
348 0.37
349 0.39
350 0.42
351 0.44
352 0.46
353 0.46
354 0.46
355 0.48
356 0.51
357 0.46
358 0.51
359 0.52
360 0.55
361 0.61
362 0.67
363 0.68
364 0.67
365 0.65
366 0.58
367 0.57
368 0.53
369 0.55
370 0.53
371 0.49
372 0.44
373 0.43
374 0.42
375 0.39
376 0.34
377 0.26
378 0.26
379 0.2
380 0.19
381 0.19
382 0.18
383 0.16
384 0.16
385 0.14
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.16
396 0.19
397 0.17
398 0.16
399 0.17
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.14
405 0.13
406 0.14
407 0.18
408 0.18
409 0.15
410 0.14
411 0.13
412 0.14
413 0.14
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.17
418 0.22
419 0.25
420 0.25
421 0.26
422 0.27
423 0.28
424 0.31
425 0.33
426 0.35
427 0.34
428 0.4
429 0.42
430 0.46
431 0.46
432 0.46
433 0.45
434 0.49
435 0.55
436 0.59
437 0.66
438 0.7
439 0.74
440 0.78
441 0.85
442 0.85
443 0.85
444 0.85
445 0.84
446 0.8
447 0.73
448 0.69
449 0.59
450 0.5
451 0.43
452 0.36
453 0.27
454 0.25
455 0.3
456 0.33
457 0.33
458 0.32
459 0.31
460 0.29
461 0.32
462 0.31
463 0.26
464 0.29
465 0.36
466 0.39
467 0.46
468 0.47
469 0.52
470 0.5
471 0.51
472 0.52
473 0.54
474 0.57
475 0.57
476 0.61
477 0.58
478 0.61
479 0.59
480 0.58
481 0.55
482 0.59
483 0.6
484 0.62
485 0.67
486 0.72
487 0.79
488 0.82
489 0.85
490 0.86
491 0.88
492 0.9
493 0.9
494 0.92
495 0.9
496 0.87
497 0.86
498 0.81
499 0.72
500 0.65
501 0.61
502 0.54
503 0.51
504 0.48
505 0.39
506 0.35
507 0.4
508 0.46
509 0.43
510 0.49
511 0.52
512 0.54
513 0.64
514 0.68
515 0.7
516 0.7
517 0.68
518 0.67
519 0.69
520 0.65
521 0.65
522 0.68
523 0.7
524 0.71
525 0.72
526 0.72
527 0.73
528 0.74
529 0.73
530 0.74
531 0.71
532 0.72
533 0.78
534 0.78
535 0.79
536 0.85
537 0.87