FuNGI

A0A0J8RGM0

Protein Details

Accession

A0A0J8RGM0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1125-1144	KWFRNKPSPIPQKIRGVPRN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 16, nucl 8, cyto_pero 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPKFFRWLSERYPAISQLIAENRIPEFDCLYLDMNGIIHNCTHKDSDSPTFRMTEDKMFIAIFNYIEHLFGKIKPKKLFFMAIDGVAPRAKMNQQRARRFRTALDAEIAKEKAIREGIEMPKEDPFDSNCITPGTEFMAKLTKQLKYFINKKVSEDAEWQGVEVILSGHEVPGEGEHKIMEYIRQAKAQPDYDPNVRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVTFGRQNQKKVKELEHQNFYLLHLCIVREYLELEFQELEQEGALQFEFDMERVIDDFILMAFFVGNDFLPNLPNLHINEGALAWMFKVYKEVLPKLDGYINERGRINLNRLGVLLDSLGDVEFRFFEAEYSDSRWLKSKLSRGEEKPEILDDPKALTISPAQKHILSKVKKYISHRPVNDDGYPVPLDLLPSLPARDRKFVEQLADDLRISWSSVSNEHGDRFLRLQLPSKQQLANGDSASEDEDEEAQIAVLRVLKKYENAKVKETTAEEAQQIAEKKYEQKFQEWKNKYYEGKFGWGTDNDEEMRKLTENYVQGLQWVLYYYYRGVASWPWFYRYHYSPMISDVKRGLGADMDFKLGQPFFPFQQLMGVLPDRSKKIVPQAYHELMISPDSPIIDFYPRDFELDMNGKKMEWEAVVKIPFINEDRLLKAMASKEHLLTPEEKARNNFGVTLKFTHSPDIEFTYPSSFVGVFPDIPRCHCIENVYELPTMEGLEPYVGLMDGVKLGTEALAGFPSLKTLPHTAQLGFHGVTVFQQESRNESMVVTLTEPESRSRVETAKSKIGKRVHIGYPFLHEALVVRVSDELFDYVQVDGEEHIVQIPHSPGQIDQWKKKSDRIESSYSKRLGMIIGEVESIVHVHVLKGLVKTELGATVKEFAEIPGIETDYASQLIVDEVISQDDRFIEREAVPIEEEFPEGTRAFFLGEYNYGAPVHITGHDDGKLQGLVSTTKGAKEPEFGKEQVDIAESHSPYTPSFAVSRNLQLNPLTVAKITSSFSVMCEGKRINLGLNLKFEAKKLKVLGYSRRGQNGWEFSEKAIGLLREYMIKFPEFIAGIQRKPQGDLFEPTDFYPPEVAATKIKEIQSWLKSIEAKNFERVPLEAEQLDSDVVGAIEEAADKWFRNKPSPIPQKIRGVPRNAVLKPADAEHRLGNQRFALGDRVIYAQDSGKVPIATKGTVVGLTRTSRTVLLDVISTFFMSGTTLSGRARHSGAKRSLHRLY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.43
3	0.4
4	0.35
5	0.29
6	0.27
7	0.3
8	0.3
9	0.27
10	0.27
11	0.26
12	0.27
13	0.28
14	0.22
15	0.19
16	0.17
17	0.17
18	0.17
19	0.19
20	0.17
21	0.16
22	0.15
23	0.13
24	0.15
25	0.14
26	0.13
27	0.12
28	0.15
29	0.16
30	0.19
31	0.21
32	0.2
33	0.23
34	0.28
35	0.36
36	0.4
37	0.43
38	0.42
39	0.41
40	0.41
41	0.43
42	0.4
43	0.37
44	0.33
45	0.3
46	0.29
47	0.27
48	0.27
49	0.23
50	0.21
51	0.14
52	0.12
53	0.14
54	0.12
55	0.13
56	0.13
57	0.14
58	0.15
59	0.19
60	0.29
61	0.33
62	0.41
63	0.48
64	0.52
65	0.54
66	0.57
67	0.61
68	0.52
69	0.53
70	0.47
71	0.41
72	0.38
73	0.33
74	0.3
75	0.23
76	0.21
77	0.14
78	0.15
79	0.21
80	0.27
81	0.38
82	0.46
83	0.55
84	0.66
85	0.75
86	0.8
87	0.8
88	0.75
89	0.68
90	0.68
91	0.63
92	0.55
93	0.51
94	0.44
95	0.39
96	0.41
97	0.38
98	0.28
99	0.25
100	0.23
101	0.22
102	0.23
103	0.21
104	0.2
105	0.28
106	0.34
107	0.38
108	0.39
109	0.35
110	0.37
111	0.38
112	0.35
113	0.29
114	0.25
115	0.25
116	0.25
117	0.24
118	0.22
119	0.21
120	0.21
121	0.19
122	0.18
123	0.18
124	0.19
125	0.18
126	0.18
127	0.24
128	0.23
129	0.29
130	0.34
131	0.33
132	0.32
133	0.37
134	0.42
135	0.44
136	0.52
137	0.55
138	0.6
139	0.57
140	0.59
141	0.62
142	0.58
143	0.52
144	0.49
145	0.43
146	0.38
147	0.36
148	0.32
149	0.24
150	0.21
151	0.17
152	0.13
153	0.1
154	0.05
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.09
162	0.1
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.1
167	0.11
168	0.12
169	0.11
170	0.16
171	0.22
172	0.25
173	0.28
174	0.29
175	0.32
176	0.38
177	0.39
178	0.36
179	0.37
180	0.4
181	0.43
182	0.47
183	0.45
184	0.46
185	0.44
186	0.39
187	0.33
188	0.29
189	0.25
190	0.22
191	0.2
192	0.14
193	0.14
194	0.13
195	0.13
196	0.1
197	0.08
198	0.05
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.09
207	0.11
208	0.11
209	0.14
210	0.15
211	0.17
212	0.17
213	0.19
214	0.19
215	0.22
216	0.26
217	0.24
218	0.33
219	0.34
220	0.41
221	0.47
222	0.53
223	0.55
224	0.56
225	0.61
226	0.61
227	0.68
228	0.69
229	0.67
230	0.61
231	0.56
232	0.51
233	0.45
234	0.4
235	0.3
236	0.23
237	0.17
238	0.16
239	0.15
240	0.15
241	0.14
242	0.1
243	0.11
244	0.1
245	0.12
246	0.12
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.13
251	0.11
252	0.11
253	0.07
254	0.08
255	0.06
256	0.07
257	0.06
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.13
288	0.13
289	0.16
290	0.16
291	0.15
292	0.15
293	0.14
294	0.13
295	0.1
296	0.09
297	0.05
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.09
302	0.1
303	0.13
304	0.19
305	0.22
306	0.22
307	0.24
308	0.25
309	0.25
310	0.26
311	0.24
312	0.23
313	0.3
314	0.29
315	0.3
316	0.3
317	0.29
318	0.31
319	0.33
320	0.33
321	0.28
322	0.28
323	0.25
324	0.25
325	0.25
326	0.19
327	0.16
328	0.11
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.05
340	0.06
341	0.07
342	0.09
343	0.1
344	0.14
345	0.19
346	0.19
347	0.2
348	0.25
349	0.25
350	0.29
351	0.33
352	0.37
353	0.4
354	0.46
355	0.54
356	0.53
357	0.59
358	0.58
359	0.53
360	0.46
361	0.39
362	0.35
363	0.28
364	0.25
365	0.17
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.11
370	0.1
371	0.14
372	0.2
373	0.21
374	0.23
375	0.24
376	0.25
377	0.27
378	0.32
379	0.36
380	0.33
381	0.36
382	0.41
383	0.46
384	0.49
385	0.54
386	0.59
387	0.59
388	0.64
389	0.62
390	0.6
391	0.6
392	0.59
393	0.54
394	0.45
395	0.36
396	0.3
397	0.28
398	0.21
399	0.16
400	0.12
401	0.11
402	0.09
403	0.1
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.12
408	0.18
409	0.2
410	0.25
411	0.26
412	0.29
413	0.33
414	0.34
415	0.33
416	0.28
417	0.28
418	0.26
419	0.26
420	0.21
421	0.17
422	0.16
423	0.13
424	0.12
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.15
431	0.16
432	0.16
433	0.17
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.17
438	0.18
439	0.18
440	0.23
441	0.28
442	0.34
443	0.37
444	0.39
445	0.36
446	0.34
447	0.38
448	0.34
449	0.3
450	0.23
451	0.2
452	0.16
453	0.16
454	0.15
455	0.11
456	0.08
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.04
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.08
467	0.09
468	0.09
469	0.1
470	0.11
471	0.15
472	0.19
473	0.26
474	0.32
475	0.34
476	0.38
477	0.39
478	0.39
479	0.39
480	0.36
481	0.31
482	0.24
483	0.22
484	0.18
485	0.16
486	0.15
487	0.15
488	0.15
489	0.13
490	0.13
491	0.12
492	0.18
493	0.21
494	0.28
495	0.26
496	0.32
497	0.4
498	0.47
499	0.57
500	0.56
501	0.56
502	0.55
503	0.59
504	0.55
505	0.5
506	0.48
507	0.38
508	0.37
509	0.34
510	0.3
511	0.27
512	0.25
513	0.25
514	0.19
515	0.2
516	0.16
517	0.17
518	0.15
519	0.13
520	0.13
521	0.11
522	0.11
523	0.1
524	0.14
525	0.14
526	0.15
527	0.16
528	0.15
529	0.14
530	0.14
531	0.13
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.05
536	0.06
537	0.06
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.08
542	0.1
543	0.12
544	0.17
545	0.17
546	0.19
547	0.2
548	0.21
549	0.26
550	0.26
551	0.28
552	0.26
553	0.26
554	0.23
555	0.27
556	0.33
557	0.28
558	0.27
559	0.22
560	0.21
561	0.2
562	0.2
563	0.15
564	0.08
565	0.09
566	0.1
567	0.09
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.11
572	0.09
573	0.09
574	0.08
575	0.09
576	0.09
577	0.11
578	0.11
579	0.1
580	0.11
581	0.12
582	0.1
583	0.11
584	0.11
585	0.08
586	0.1
587	0.12
588	0.11
589	0.12
590	0.12
591	0.12
592	0.2
593	0.24
594	0.24
595	0.27
596	0.34
597	0.34
598	0.34
599	0.32
600	0.24
601	0.19
602	0.19
603	0.14
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.12
614	0.12
615	0.13
616	0.13
617	0.12
618	0.14
619	0.2
620	0.2
621	0.17
622	0.17
623	0.16
624	0.16
625	0.16
626	0.13
627	0.07
628	0.08
629	0.08
630	0.11
631	0.12
632	0.12
633	0.12
634	0.11
635	0.12
636	0.12
637	0.12
638	0.1
639	0.11
640	0.12
641	0.13
642	0.13
643	0.11
644	0.12
645	0.12
646	0.12
647	0.14
648	0.14
649	0.14
650	0.15
651	0.16
652	0.15
653	0.15
654	0.17
655	0.22
656	0.23
657	0.24
658	0.24
659	0.26
660	0.27
661	0.26
662	0.26
663	0.19
664	0.2
665	0.2
666	0.21
667	0.21
668	0.21
669	0.21
670	0.21
671	0.19
672	0.17
673	0.17
674	0.19
675	0.17
676	0.15
677	0.16
678	0.15
679	0.14
680	0.13
681	0.13
682	0.08
683	0.08
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.1
688	0.16
689	0.15
690	0.16
691	0.18
692	0.17
693	0.18
694	0.18
695	0.18
696	0.14
697	0.2
698	0.21
699	0.21
700	0.2
701	0.19
702	0.18
703	0.16
704	0.15
705	0.09
706	0.07
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.04
711	0.04
712	0.03
713	0.03
714	0.03
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.06
730	0.06
731	0.06
732	0.08
733	0.11
734	0.12
735	0.15
736	0.16
737	0.16
738	0.17
739	0.18
740	0.18
741	0.15
742	0.14
743	0.12
744	0.1
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.08
749	0.11
750	0.11
751	0.15
752	0.18
753	0.18
754	0.17
755	0.16
756	0.15
757	0.13
758	0.14
759	0.1
760	0.08
761	0.08
762	0.09
763	0.1
764	0.11
765	0.11
766	0.11
767	0.12
768	0.14
769	0.16
770	0.18
771	0.24
772	0.28
773	0.35
774	0.4
775	0.41
776	0.46
777	0.48
778	0.49
779	0.47
780	0.48
781	0.45
782	0.44
783	0.44
784	0.37
785	0.37
786	0.34
787	0.3
788	0.23
789	0.18
790	0.14
791	0.13
792	0.14
793	0.09
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.09
798	0.08
799	0.07
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.06
804	0.07
805	0.07
806	0.06
807	0.06
808	0.07
809	0.07
810	0.06
811	0.07
812	0.06
813	0.06
814	0.08
815	0.09
816	0.08
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.15
821	0.23
822	0.27
823	0.33
824	0.39
825	0.45
826	0.47
827	0.52
828	0.54
829	0.55
830	0.58
831	0.56
832	0.58
833	0.59
834	0.64
835	0.66
836	0.6
837	0.51
838	0.42
839	0.37
840	0.29
841	0.22
842	0.17
843	0.1
844	0.09
845	0.09
846	0.08
847	0.08
848	0.07
849	0.06
850	0.05
851	0.05
852	0.04
853	0.04
854	0.06
855	0.08
856	0.1
857	0.11
858	0.12
859	0.12
860	0.11
861	0.12
862	0.11
863	0.13
864	0.12
865	0.11
866	0.11
867	0.14
868	0.14
869	0.14
870	0.13
871	0.1
872	0.12
873	0.12
874	0.13
875	0.11
876	0.12
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.09
881	0.1
882	0.08
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.05
888	0.04
889	0.04
890	0.06
891	0.07
892	0.06
893	0.07
894	0.08
895	0.09
896	0.1
897	0.11
898	0.13
899	0.13
900	0.16
901	0.16
902	0.16
903	0.16
904	0.15
905	0.15
906	0.13
907	0.13
908	0.1
909	0.1
910	0.11
911	0.11
912	0.11
913	0.09
914	0.09
915	0.09
916	0.09
917	0.09
918	0.08
919	0.09
920	0.11
921	0.11
922	0.12
923	0.11
924	0.11
925	0.1
926	0.09
927	0.09
928	0.09
929	0.11
930	0.11
931	0.13
932	0.14
933	0.15
934	0.15
935	0.15
936	0.14
937	0.11
938	0.12
939	0.11
940	0.11
941	0.11
942	0.15
943	0.14
944	0.15
945	0.17
946	0.18
947	0.18
948	0.22
949	0.23
950	0.24
951	0.28
952	0.28
953	0.27
954	0.26
955	0.26
956	0.22
957	0.2
958	0.16
959	0.15
960	0.2
961	0.19
962	0.19
963	0.2
964	0.19
965	0.18
966	0.21
967	0.18
968	0.14
969	0.16
970	0.18
971	0.2
972	0.22
973	0.27
974	0.29
975	0.29
976	0.29
977	0.28
978	0.26
979	0.26
980	0.25
981	0.2
982	0.15
983	0.15
984	0.14
985	0.15
986	0.14
987	0.12
988	0.13
989	0.12
990	0.13
991	0.18
992	0.19
993	0.17
994	0.21
995	0.2
996	0.2
997	0.23
998	0.23
999	0.19
1000	0.24
1001	0.29
1002	0.28
1003	0.31
1004	0.31
1005	0.32
1006	0.32
1007	0.32
1008	0.34
1009	0.3
1010	0.33
1011	0.31
1012	0.34
1013	0.37
1014	0.42
1015	0.5
1016	0.49
1017	0.56
1018	0.55
1019	0.58
1020	0.54
1021	0.5
1022	0.51
1023	0.48
1024	0.46
1025	0.42
1026	0.38
1027	0.33
1028	0.38
1029	0.35
1030	0.28
1031	0.25
1032	0.2
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.17
1036	0.18
1037	0.19
1038	0.2
1039	0.19
1040	0.19
1041	0.18
1042	0.17
1043	0.2
1044	0.16
1045	0.15
1046	0.23
1047	0.26
1048	0.27
1049	0.32
1050	0.36
1051	0.33
1052	0.35
1053	0.37
1054	0.33
1055	0.33
1056	0.37
1057	0.36
1058	0.35
1059	0.35
1060	0.34
1061	0.36
1062	0.3
1063	0.27
1064	0.23
1065	0.18
1066	0.17
1067	0.18
1068	0.19
1069	0.18
1070	0.21
1071	0.24
1072	0.28
1073	0.29
1074	0.27
1075	0.3
1076	0.37
1077	0.36
1078	0.36
1079	0.34
1080	0.34
1081	0.38
1082	0.39
1083	0.43
1084	0.42
1085	0.41
1086	0.46
1087	0.46
1088	0.43
1089	0.4
1090	0.38
1091	0.33
1092	0.28
1093	0.29
1094	0.22
1095	0.21
1096	0.2
1097	0.18
1098	0.18
1099	0.13
1100	0.11
1101	0.07
1102	0.07
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.04
1106	0.04
1107	0.05
1108	0.05
1109	0.06
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.13
1113	0.2
1114	0.24
1115	0.31
1116	0.37
1117	0.44
1118	0.54
1119	0.64
1120	0.7
1121	0.73
1122	0.76
1123	0.78
1124	0.8
1125	0.82
1126	0.78
1127	0.74
1128	0.68
1129	0.66
1130	0.69
1131	0.59
1132	0.57
1133	0.48
1134	0.44
1135	0.38
1136	0.38
1137	0.37
1138	0.3
1139	0.32
1140	0.29
1141	0.36
1142	0.41
1143	0.41
1144	0.41
1145	0.36
1146	0.35
1147	0.34
1148	0.32
1149	0.29
1150	0.21
1151	0.21
1152	0.19
1153	0.19
1154	0.18
1155	0.18
1156	0.17
1157	0.14
1158	0.18
1159	0.19
1160	0.19
1161	0.21
1162	0.22
1163	0.22
1164	0.26
1165	0.27
1166	0.23
1167	0.22
1168	0.22
1169	0.19
1170	0.21
1171	0.21
1172	0.18
1173	0.2
1174	0.22
1175	0.24
1176	0.23
1177	0.24
1178	0.22
1179	0.24
1180	0.23
1181	0.2
1182	0.18
1183	0.18
1184	0.17
1185	0.17
1186	0.17
1187	0.14
1188	0.13
1189	0.11
1190	0.1
1191	0.08
1192	0.08
1193	0.08
1194	0.1
1195	0.12
1196	0.14
1197	0.18
1198	0.2
1199	0.23
1200	0.25
1201	0.31
1202	0.36
1203	0.43
1204	0.51
1205	0.57
1206	0.62

A0A0J8RGM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer