Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RDJ2

Protein Details
Accession A0A0J8RDJ2    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-214KTAFSRAKYTLRKRKKYLKRFTPVPLDHydrophilic
421-449EDWKPSRRGAYYRKRRRWTKVRTVVQEARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-203RKRKK
433-437RKRRR
603-612RGVPGRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 10cyto 10cyto_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MGEVHAWKGVTRERKANLCLGVVGECDRRFQIKMESRIPPNSYIALQLPSGTTKVQQIIPSTTISLGKYGSFPANQIIGRPFYLTFEILDEADENGHVLRVVPAAELHTEALMTEGSTPAELEDGPDLGNGTGEDDTPQPRDNRNIIDDNSAQRMTMEEIENLKQGTTGAGKEIISKLLRSHSALDQKTAFSRAKYTLRKRKKYLKRFTPVPLDVSLLTNWMLNDKDAARTMELRDELLGLIGCWANVHHGGEDSPPDSTTAQACGRWLVVDDTGGLVVAAMAERMGILYPSSTESDLSASEEAEPSSDTPGETEIMSVENPNDKSLGDHPESHLAPSHQPRHRHRPAPMSAKHTTLTVIHPNFQPNLTLLKYFSYDLNDPPESHPLYTHLKTLSWIQLVDPDSDHTYTNEPAVVPDSVLEDWKPSRRGAYYRKRRRWTKVRTVVQEARAGGFDGLVVATLMDPASILKYTVPLLAGSAPVVVYSPHIEPLIKLSDLYSTMRRAAFLNRKQAIQESQGTGTRESAAVLEDGTRNCFQDENSEDDDFPVDPSLLLAPSIQTSRVRTWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAIRVIPAGGRVEARGVPGRKKRKVAIDTPGQTPKESEDTDMQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.58
3 0.6
4 0.55
5 0.47
6 0.43
7 0.36
8 0.31
9 0.25
10 0.24
11 0.24
12 0.21
13 0.23
14 0.24
15 0.25
16 0.25
17 0.27
18 0.35
19 0.38
20 0.46
21 0.51
22 0.57
23 0.59
24 0.65
25 0.65
26 0.58
27 0.51
28 0.45
29 0.38
30 0.34
31 0.31
32 0.26
33 0.23
34 0.2
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.16
39 0.15
40 0.17
41 0.21
42 0.23
43 0.25
44 0.27
45 0.3
46 0.31
47 0.31
48 0.28
49 0.26
50 0.25
51 0.22
52 0.2
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.17
57 0.19
58 0.17
59 0.17
60 0.19
61 0.23
62 0.22
63 0.24
64 0.24
65 0.23
66 0.23
67 0.24
68 0.21
69 0.19
70 0.21
71 0.19
72 0.16
73 0.15
74 0.16
75 0.14
76 0.14
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.06
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.15
125 0.18
126 0.2
127 0.23
128 0.29
129 0.32
130 0.34
131 0.38
132 0.41
133 0.39
134 0.41
135 0.41
136 0.37
137 0.38
138 0.33
139 0.27
140 0.22
141 0.21
142 0.18
143 0.19
144 0.17
145 0.15
146 0.18
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.17
151 0.14
152 0.12
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.15
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.19
166 0.21
167 0.2
168 0.23
169 0.25
170 0.33
171 0.33
172 0.34
173 0.31
174 0.31
175 0.31
176 0.32
177 0.27
178 0.19
179 0.22
180 0.25
181 0.32
182 0.41
183 0.5
184 0.56
185 0.66
186 0.75
187 0.79
188 0.84
189 0.86
190 0.88
191 0.88
192 0.88
193 0.86
194 0.83
195 0.81
196 0.8
197 0.71
198 0.62
199 0.52
200 0.43
201 0.35
202 0.3
203 0.23
204 0.15
205 0.13
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.1
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.1
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.03
265 0.03
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.03
277 0.03
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.13
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.22
319 0.22
320 0.21
321 0.2
322 0.16
323 0.19
324 0.24
325 0.32
326 0.32
327 0.4
328 0.46
329 0.55
330 0.62
331 0.64
332 0.62
333 0.62
334 0.66
335 0.67
336 0.65
337 0.61
338 0.55
339 0.5
340 0.46
341 0.37
342 0.3
343 0.22
344 0.21
345 0.22
346 0.21
347 0.21
348 0.23
349 0.24
350 0.24
351 0.23
352 0.2
353 0.13
354 0.16
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.14
361 0.13
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.21
369 0.25
370 0.22
371 0.21
372 0.2
373 0.19
374 0.24
375 0.23
376 0.25
377 0.2
378 0.19
379 0.2
380 0.23
381 0.23
382 0.18
383 0.17
384 0.14
385 0.19
386 0.2
387 0.2
388 0.17
389 0.15
390 0.16
391 0.16
392 0.17
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.12
401 0.11
402 0.08
403 0.08
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.12
410 0.17
411 0.19
412 0.17
413 0.21
414 0.23
415 0.31
416 0.4
417 0.49
418 0.55
419 0.64
420 0.74
421 0.81
422 0.86
423 0.88
424 0.88
425 0.88
426 0.88
427 0.87
428 0.86
429 0.82
430 0.83
431 0.78
432 0.71
433 0.65
434 0.54
435 0.44
436 0.35
437 0.3
438 0.21
439 0.14
440 0.1
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.05
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.06
471 0.08
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.15
478 0.18
479 0.15
480 0.15
481 0.13
482 0.15
483 0.17
484 0.2
485 0.19
486 0.17
487 0.21
488 0.21
489 0.22
490 0.21
491 0.29
492 0.36
493 0.4
494 0.48
495 0.46
496 0.47
497 0.48
498 0.51
499 0.45
500 0.4
501 0.38
502 0.31
503 0.32
504 0.35
505 0.36
506 0.32
507 0.29
508 0.25
509 0.19
510 0.17
511 0.14
512 0.11
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.12
517 0.13
518 0.17
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.18
523 0.17
524 0.22
525 0.25
526 0.27
527 0.3
528 0.31
529 0.3
530 0.3
531 0.31
532 0.22
533 0.2
534 0.14
535 0.1
536 0.09
537 0.09
538 0.1
539 0.09
540 0.09
541 0.08
542 0.08
543 0.1
544 0.11
545 0.13
546 0.15
547 0.19
548 0.24
549 0.31
550 0.34
551 0.34
552 0.37
553 0.43
554 0.48
555 0.5
556 0.49
557 0.48
558 0.52
559 0.51
560 0.47
561 0.4
562 0.37
563 0.34
564 0.32
565 0.31
566 0.23
567 0.24
568 0.23
569 0.22
570 0.17
571 0.13
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.13
576 0.15
577 0.15
578 0.15
579 0.17
580 0.16
581 0.1
582 0.13
583 0.16
584 0.15
585 0.16
586 0.16
587 0.17
588 0.17
589 0.21
590 0.26
591 0.29
592 0.37
593 0.46
594 0.56
595 0.61
596 0.68
597 0.71
598 0.74
599 0.78
600 0.76
601 0.76
602 0.76
603 0.72
604 0.72
605 0.73
606 0.64
607 0.56
608 0.49
609 0.44
610 0.41
611 0.37
612 0.34