Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3JIF1

Protein Details
Accession G3JIF1    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-220ARARADKKESRHKHRSHRPHRSKHDDDDRRRSRRBasic
223-243SDSERRHRHRGDHRSDRHRDGBasic
251-323KRHDDNSREHRSRRRDKDEKERSRDRDRDLDRRQHDRRQNDERQHQTHINRKDEAERGHKRRRRSHSPRRSEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-287KKEVQEARARADKKESRHKHRSHRPHRSKHDDDDRRRSRRDESDSERRHRHRGDHRSDRHRDGDEERHRGKRHDDNSREHRSRRRDKDEKERSRDRDRDLDRRQHDR
300-322NRKDEAERGHKRRRRSHSPRRSE
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cmt:CCM_05209  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNQIRAIQALNKKEIENGISPEASWHTDYRDTAYVYFGGLPYELSEGDVITIFSQFGEPVFLKLVRDKESGKSKGFGWLKYENQKSTDLAVDNLGGAQVGGRLLRVDHARYSMRDDEDQDECRVGWEDLQRKQGKPLSEDESSEDEAPQRPMLQEERDLAKLIHDHDDDDPMKAFLIEEKKKEVQEARARADKKESRHKHRSHRPHRSKHDDDDRRRSRRDESDSERRHRHRGDHRSDRHRDGDEERHRGKRHDDNSREHRSRRRDKDEKERSRDRDRDLDRRQHDRRQNDERQHQTHINRKDEAERGHKRRRRSHSPRRSEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.34
4 0.32
5 0.31
6 0.28
7 0.28
8 0.27
9 0.27
10 0.25
11 0.23
12 0.2
13 0.2
14 0.24
15 0.25
16 0.27
17 0.29
18 0.28
19 0.27
20 0.27
21 0.23
22 0.2
23 0.21
24 0.16
25 0.12
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.06
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.19
51 0.24
52 0.25
53 0.27
54 0.28
55 0.33
56 0.42
57 0.46
58 0.44
59 0.41
60 0.37
61 0.44
62 0.45
63 0.4
64 0.35
65 0.37
66 0.41
67 0.48
68 0.53
69 0.46
70 0.45
71 0.45
72 0.4
73 0.36
74 0.33
75 0.25
76 0.2
77 0.18
78 0.16
79 0.13
80 0.12
81 0.1
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.08
92 0.1
93 0.12
94 0.13
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.27
103 0.27
104 0.28
105 0.29
106 0.24
107 0.21
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.13
112 0.13
113 0.17
114 0.22
115 0.26
116 0.35
117 0.37
118 0.36
119 0.42
120 0.42
121 0.39
122 0.35
123 0.36
124 0.32
125 0.3
126 0.3
127 0.27
128 0.27
129 0.26
130 0.24
131 0.19
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.13
136 0.1
137 0.09
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.16
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.08
163 0.17
164 0.19
165 0.2
166 0.25
167 0.27
168 0.28
169 0.31
170 0.3
171 0.3
172 0.36
173 0.4
174 0.4
175 0.44
176 0.45
177 0.43
178 0.49
179 0.45
180 0.43
181 0.49
182 0.54
183 0.57
184 0.67
185 0.74
186 0.75
187 0.82
188 0.86
189 0.86
190 0.89
191 0.9
192 0.9
193 0.92
194 0.91
195 0.86
196 0.84
197 0.84
198 0.83
199 0.81
200 0.81
201 0.81
202 0.77
203 0.75
204 0.68
205 0.65
206 0.64
207 0.63
208 0.61
209 0.6
210 0.64
211 0.69
212 0.74
213 0.76
214 0.7
215 0.7
216 0.65
217 0.66
218 0.66
219 0.69
220 0.72
221 0.73
222 0.79
223 0.81
224 0.84
225 0.8
226 0.75
227 0.67
228 0.6
229 0.55
230 0.56
231 0.55
232 0.57
233 0.57
234 0.59
235 0.58
236 0.58
237 0.59
238 0.58
239 0.58
240 0.6
241 0.62
242 0.64
243 0.72
244 0.79
245 0.78
246 0.75
247 0.75
248 0.75
249 0.79
250 0.79
251 0.81
252 0.8
253 0.82
254 0.87
255 0.9
256 0.9
257 0.88
258 0.88
259 0.84
260 0.85
261 0.83
262 0.78
263 0.77
264 0.74
265 0.75
266 0.75
267 0.77
268 0.74
269 0.77
270 0.78
271 0.78
272 0.79
273 0.78
274 0.78
275 0.78
276 0.81
277 0.81
278 0.84
279 0.84
280 0.79
281 0.77
282 0.75
283 0.73
284 0.72
285 0.71
286 0.67
287 0.61
288 0.59
289 0.59
290 0.58
291 0.57
292 0.58
293 0.6
294 0.64
295 0.71
296 0.73
297 0.76
298 0.8
299 0.82
300 0.83
301 0.84
302 0.86
303 0.86