Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RNB3

Protein Details
Accession A0A0J8RNB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-204SPQPRAARHVFKRQRRDNNGLSHydrophilic
363-387VFSRKGSKVVRERRQLKERQKQAQDHydrophilic
509-536AMSVAKRQRNCHKIYDRRRAPKRVFGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSSASPSNPKEPEVESAAQSGDDPEHMEREHQDTQPQTQGEFEVKEQDRWLPIANVARIMKTALPENAKIAKEAKECMQECAPYIASEKCQGEKRKTVNGEDILFAMTSLGFENYSEALKIYLSKYREGGEPEPASEQRIPQGGPVGGTGAQAPAPLNCLCKMAREDSPKRRKLDPDRYASSSPQPRAARHVFKRQRRDNNGLSTPRGSHNGSSTPHQHEFDGPEPLVNYEDAMALDRDWYAGDEFGHSFGDETHNPFGGPDNSWKDMQREAALSEKKNNRRFNARAVQKQKDVDAWETNRMLTSGVAQRRDYEADFEDDEDSTRVHLLVHDLRPPFLDGRTIFTKQLEPVPAVRDPQSDMAVFSRKGSKVVRERRQLKERQKQAQDATNVAGTALGNLMGIKEDEGDSAAAIPGEEDHKGGSKFAQHLKKNEGVSAFSRSKTLREQREFLPAFAVREELLRVVRDNQVVIVVGQTGSGKTTQLTQFLYEDGYGALGMIGCTQPRRVAAMSVAKRQRNCHKIYDRRRAPKRVFGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.31
4 0.29
5 0.26
6 0.23
7 0.2
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.16
13 0.16
14 0.19
15 0.2
16 0.26
17 0.31
18 0.3
19 0.35
20 0.35
21 0.4
22 0.44
23 0.42
24 0.35
25 0.31
26 0.31
27 0.29
28 0.28
29 0.24
30 0.27
31 0.28
32 0.3
33 0.3
34 0.31
35 0.3
36 0.29
37 0.31
38 0.23
39 0.26
40 0.31
41 0.3
42 0.33
43 0.31
44 0.3
45 0.28
46 0.28
47 0.25
48 0.2
49 0.23
50 0.23
51 0.26
52 0.26
53 0.31
54 0.35
55 0.34
56 0.34
57 0.33
58 0.34
59 0.33
60 0.35
61 0.35
62 0.38
63 0.39
64 0.41
65 0.42
66 0.36
67 0.35
68 0.36
69 0.31
70 0.22
71 0.24
72 0.22
73 0.2
74 0.26
75 0.26
76 0.27
77 0.34
78 0.41
79 0.45
80 0.52
81 0.55
82 0.59
83 0.61
84 0.61
85 0.61
86 0.58
87 0.52
88 0.44
89 0.39
90 0.3
91 0.25
92 0.2
93 0.13
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.16
110 0.17
111 0.19
112 0.2
113 0.22
114 0.25
115 0.28
116 0.28
117 0.31
118 0.3
119 0.29
120 0.32
121 0.3
122 0.31
123 0.26
124 0.25
125 0.2
126 0.22
127 0.21
128 0.17
129 0.22
130 0.18
131 0.17
132 0.16
133 0.15
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.17
149 0.2
150 0.21
151 0.27
152 0.35
153 0.44
154 0.52
155 0.63
156 0.65
157 0.67
158 0.68
159 0.71
160 0.72
161 0.74
162 0.72
163 0.7
164 0.68
165 0.69
166 0.66
167 0.59
168 0.56
169 0.52
170 0.45
171 0.45
172 0.42
173 0.38
174 0.44
175 0.49
176 0.5
177 0.48
178 0.58
179 0.59
180 0.65
181 0.75
182 0.77
183 0.8
184 0.79
185 0.8
186 0.76
187 0.75
188 0.74
189 0.66
190 0.59
191 0.5
192 0.44
193 0.38
194 0.35
195 0.28
196 0.21
197 0.21
198 0.24
199 0.23
200 0.25
201 0.28
202 0.31
203 0.32
204 0.32
205 0.29
206 0.27
207 0.29
208 0.28
209 0.26
210 0.2
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.16
215 0.11
216 0.09
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.1
239 0.09
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.15
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.22
253 0.21
254 0.21
255 0.21
256 0.17
257 0.14
258 0.13
259 0.19
260 0.21
261 0.2
262 0.27
263 0.33
264 0.4
265 0.48
266 0.52
267 0.49
268 0.54
269 0.56
270 0.57
271 0.59
272 0.58
273 0.59
274 0.61
275 0.62
276 0.57
277 0.56
278 0.48
279 0.41
280 0.36
281 0.3
282 0.29
283 0.26
284 0.26
285 0.26
286 0.25
287 0.22
288 0.2
289 0.17
290 0.11
291 0.12
292 0.15
293 0.18
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.23
298 0.25
299 0.22
300 0.18
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.16
305 0.14
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.1
316 0.15
317 0.17
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.22
322 0.24
323 0.2
324 0.15
325 0.18
326 0.14
327 0.19
328 0.23
329 0.24
330 0.24
331 0.24
332 0.25
333 0.22
334 0.26
335 0.22
336 0.19
337 0.19
338 0.22
339 0.22
340 0.22
341 0.22
342 0.18
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.16
347 0.16
348 0.17
349 0.19
350 0.18
351 0.18
352 0.22
353 0.2
354 0.24
355 0.26
356 0.32
357 0.38
358 0.49
359 0.56
360 0.6
361 0.68
362 0.73
363 0.8
364 0.81
365 0.82
366 0.82
367 0.82
368 0.81
369 0.8
370 0.77
371 0.72
372 0.7
373 0.61
374 0.53
375 0.45
376 0.36
377 0.29
378 0.22
379 0.18
380 0.11
381 0.09
382 0.07
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.04
388 0.05
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.17
411 0.23
412 0.31
413 0.4
414 0.41
415 0.46
416 0.52
417 0.56
418 0.52
419 0.5
420 0.43
421 0.37
422 0.34
423 0.37
424 0.33
425 0.28
426 0.31
427 0.28
428 0.3
429 0.37
430 0.44
431 0.46
432 0.5
433 0.54
434 0.53
435 0.63
436 0.6
437 0.51
438 0.47
439 0.38
440 0.33
441 0.29
442 0.28
443 0.17
444 0.17
445 0.17
446 0.14
447 0.14
448 0.14
449 0.15
450 0.18
451 0.22
452 0.22
453 0.22
454 0.2
455 0.19
456 0.18
457 0.16
458 0.13
459 0.1
460 0.08
461 0.08
462 0.09
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.15
469 0.17
470 0.21
471 0.22
472 0.23
473 0.24
474 0.24
475 0.25
476 0.18
477 0.16
478 0.12
479 0.11
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.05
484 0.05
485 0.06
486 0.07
487 0.09
488 0.1
489 0.12
490 0.15
491 0.16
492 0.2
493 0.2
494 0.22
495 0.27
496 0.36
497 0.41
498 0.48
499 0.55
500 0.57
501 0.6
502 0.65
503 0.69
504 0.68
505 0.67
506 0.68
507 0.71
508 0.76
509 0.83
510 0.86
511 0.86
512 0.88
513 0.92
514 0.92
515 0.88
516 0.88