Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RH25

Protein Details
Accession A0A0J8RH25    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-56AEVKKLKKSAGDKEKKEKKSNKKEKKRAKDEHVDINGBasic
60-89AEVNIEKSEKKKKEKKAKKQEKTENESTENHydrophilic
100-147NGEKEDKKERKEKKQKKEKKEKKEGKGKKDKKDKKEKKEKKAKAEDEABasic
281-300KSETRKARIIEKNKKLNEERBasic
304-324AKEAAKRKRIDEKKQEGQEAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-48KKLKKSAGDKEKKEKKSNKKEKKRAK
66-79KSEKKKKEKKAKKQ
104-142EDKKERKEKKQKKEKKEKKEGKGKKDKKDKKEKKEKKAK
281-317KSETRKARIIEKNKKLNEERARAAKEAAKRKRIDEKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017404  Ladinin_1  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0005198  F:structural molecule activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGDKRKRNQDAGDEDTVEVAEVKKLKKSAGDKEKKEKKSNKKEKKRAKDEHVDINGAESAEVNIEKSEKKKKEKKAKKQEKTENESTENSAQVAAAADINGEKEDKKERKEKKQKKEKKEKKEGKGKKDKKDKKEKKEKKAKAEDEAAKMELDEPDKMPEDATAPNNEAEEPAMEDAKEQEDDYIHPDRKEGRFIVFISNLPYSADYDSVSKHFAKLQPIQIRVPLERGGKKGRGFAFVEFSNYDRMKTCLKLYHHTMFDDGKSPSRKIGVELTAGGGGSKSETRKARIIEKNKKLNEERARAAKEAAKRKRIDEKKQEGQEAGGDDAQETNELADIHPSRRRRFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.44
3 0.37
4 0.27
5 0.19
6 0.13
7 0.12
8 0.15
9 0.17
10 0.21
11 0.23
12 0.25
13 0.32
14 0.39
15 0.46
16 0.53
17 0.62
18 0.66
19 0.75
20 0.84
21 0.85
22 0.88
23 0.87
24 0.87
25 0.88
26 0.91
27 0.92
28 0.93
29 0.95
30 0.95
31 0.96
32 0.96
33 0.95
34 0.93
35 0.93
36 0.87
37 0.87
38 0.79
39 0.7
40 0.58
41 0.5
42 0.41
43 0.3
44 0.24
45 0.14
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.08
50 0.07
51 0.09
52 0.12
53 0.18
54 0.28
55 0.35
56 0.46
57 0.55
58 0.65
59 0.75
60 0.83
61 0.89
62 0.9
63 0.93
64 0.93
65 0.94
66 0.94
67 0.93
68 0.91
69 0.88
70 0.82
71 0.75
72 0.66
73 0.6
74 0.51
75 0.4
76 0.32
77 0.23
78 0.17
79 0.13
80 0.12
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.18
92 0.23
93 0.29
94 0.39
95 0.48
96 0.59
97 0.7
98 0.78
99 0.79
100 0.86
101 0.9
102 0.92
103 0.94
104 0.93
105 0.93
106 0.94
107 0.93
108 0.92
109 0.93
110 0.9
111 0.9
112 0.91
113 0.89
114 0.87
115 0.89
116 0.88
117 0.87
118 0.9
119 0.89
120 0.89
121 0.92
122 0.92
123 0.91
124 0.93
125 0.91
126 0.9
127 0.9
128 0.83
129 0.77
130 0.76
131 0.69
132 0.62
133 0.55
134 0.45
135 0.34
136 0.3
137 0.25
138 0.17
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.11
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.11
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.23
176 0.24
177 0.27
178 0.24
179 0.21
180 0.21
181 0.22
182 0.25
183 0.21
184 0.2
185 0.19
186 0.18
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.15
201 0.18
202 0.23
203 0.27
204 0.35
205 0.39
206 0.41
207 0.41
208 0.41
209 0.4
210 0.35
211 0.33
212 0.28
213 0.28
214 0.28
215 0.32
216 0.34
217 0.37
218 0.38
219 0.42
220 0.39
221 0.38
222 0.36
223 0.34
224 0.32
225 0.27
226 0.28
227 0.23
228 0.22
229 0.23
230 0.22
231 0.21
232 0.18
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.25
237 0.25
238 0.29
239 0.34
240 0.4
241 0.45
242 0.43
243 0.42
244 0.41
245 0.36
246 0.33
247 0.32
248 0.26
249 0.27
250 0.28
251 0.28
252 0.28
253 0.29
254 0.29
255 0.27
256 0.31
257 0.27
258 0.25
259 0.25
260 0.24
261 0.21
262 0.2
263 0.17
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.18
270 0.22
271 0.26
272 0.32
273 0.36
274 0.44
275 0.51
276 0.61
277 0.65
278 0.71
279 0.77
280 0.76
281 0.81
282 0.76
283 0.76
284 0.75
285 0.71
286 0.69
287 0.67
288 0.67
289 0.59
290 0.58
291 0.53
292 0.52
293 0.55
294 0.57
295 0.57
296 0.56
297 0.61
298 0.69
299 0.73
300 0.76
301 0.76
302 0.77
303 0.78
304 0.82
305 0.8
306 0.7
307 0.62
308 0.54
309 0.45
310 0.38
311 0.29
312 0.21
313 0.17
314 0.17
315 0.16
316 0.13
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.16
323 0.19
324 0.23
325 0.3
326 0.37