Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RV36

Protein Details
Accession A0A0J8RV36    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-314DFETRQTPPRFRKRPRAPSLAGHydrophilic
476-504QIGGKKKDKGPKPEESKSKSKQSPQENIDHydrophilic
510-530EPSRIFSRYRAPKWRNGKASSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-309FRKRPRA
325-329KGKTR
333-359ASPEPPRPTAPPKQTKRSKGLGIIGSK
382-398PKAKSSGFGRIGGRKLK
457-496PSPPPKNKSTTAGAGRVLGQIGGKKKDKGPKPEESKSKSK
Subcellular Location(s) mito_nucl 12, nucl 11.5, mito 11.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MRPLWKRLPLEGQSLSPALYISFTTGSNGYELLLTDLAHVWSECLTRKQILVNSSKYDTTIDPNQDDDQYFVLLQKIDDALSGKKGSRLSLRGQKHGNGLNLSTETDLPSPLEPLTWKMDLSQLPQAAFTKHVFLPVLREAASTESRMRSLIDKLREKDWALGKLCDKIEASGIDLSTVFPTLTGARHGRRESVFSQASKMIKGVAPFDENAWNSECMEQTPNESIKETIIKDFSATESPLDLETVENINDDWWTRIRDSDSAIMGPVASHKVATKKPPPKPAEEILTESDDDFETRQTPPRFRKRPRAPSLAGSEPESIPSLGKGKTRESTASPEPPRPTAPPKQTKRSKGLGIIGSKSSKKELPAEGSTGYDLSMQPEKPKAKSSGFGRIGGRKLKAPRVEDTNSDSSTESDVPPGAFTKKPLAQELSTDEADLALCPSKPQKSKSTGREESDKPSPPPKNKSTTAGAGRVLGQIGGKKKDKGPKPEESKSKSKQSPQENIDDTSTHEPSRIFSRYRAPKWRNGKASSVGIERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.35
3 0.25
4 0.21
5 0.14
6 0.12
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.13
15 0.13
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.16
31 0.19
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.31
36 0.33
37 0.38
38 0.42
39 0.43
40 0.45
41 0.46
42 0.44
43 0.39
44 0.37
45 0.31
46 0.3
47 0.33
48 0.33
49 0.31
50 0.33
51 0.35
52 0.35
53 0.34
54 0.29
55 0.22
56 0.18
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.14
67 0.13
68 0.17
69 0.19
70 0.18
71 0.21
72 0.23
73 0.25
74 0.3
75 0.33
76 0.37
77 0.44
78 0.49
79 0.52
80 0.55
81 0.55
82 0.54
83 0.55
84 0.51
85 0.44
86 0.39
87 0.35
88 0.32
89 0.29
90 0.23
91 0.18
92 0.16
93 0.14
94 0.14
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.1
101 0.13
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.21
107 0.22
108 0.25
109 0.28
110 0.25
111 0.24
112 0.26
113 0.26
114 0.22
115 0.23
116 0.2
117 0.19
118 0.17
119 0.19
120 0.18
121 0.17
122 0.21
123 0.21
124 0.22
125 0.18
126 0.18
127 0.16
128 0.19
129 0.21
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.19
136 0.17
137 0.22
138 0.27
139 0.32
140 0.39
141 0.41
142 0.43
143 0.45
144 0.43
145 0.43
146 0.42
147 0.4
148 0.35
149 0.37
150 0.36
151 0.38
152 0.37
153 0.33
154 0.28
155 0.21
156 0.21
157 0.17
158 0.18
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.11
172 0.15
173 0.18
174 0.24
175 0.25
176 0.28
177 0.28
178 0.32
179 0.29
180 0.33
181 0.34
182 0.29
183 0.3
184 0.3
185 0.3
186 0.25
187 0.24
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.15
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.11
205 0.13
206 0.11
207 0.12
208 0.16
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.15
213 0.15
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.14
221 0.14
222 0.12
223 0.11
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.14
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.11
260 0.14
261 0.21
262 0.29
263 0.37
264 0.44
265 0.53
266 0.55
267 0.56
268 0.58
269 0.56
270 0.51
271 0.44
272 0.41
273 0.33
274 0.31
275 0.26
276 0.2
277 0.17
278 0.13
279 0.11
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.16
285 0.18
286 0.25
287 0.34
288 0.45
289 0.55
290 0.6
291 0.71
292 0.74
293 0.82
294 0.83
295 0.82
296 0.74
297 0.7
298 0.68
299 0.61
300 0.51
301 0.43
302 0.36
303 0.28
304 0.26
305 0.21
306 0.15
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.15
312 0.16
313 0.19
314 0.21
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.29
319 0.32
320 0.38
321 0.38
322 0.41
323 0.41
324 0.41
325 0.4
326 0.38
327 0.4
328 0.4
329 0.47
330 0.52
331 0.57
332 0.66
333 0.72
334 0.75
335 0.75
336 0.72
337 0.66
338 0.6
339 0.59
340 0.55
341 0.49
342 0.44
343 0.4
344 0.37
345 0.34
346 0.3
347 0.27
348 0.23
349 0.22
350 0.25
351 0.27
352 0.3
353 0.31
354 0.32
355 0.3
356 0.28
357 0.26
358 0.21
359 0.17
360 0.12
361 0.1
362 0.11
363 0.14
364 0.14
365 0.16
366 0.24
367 0.27
368 0.27
369 0.33
370 0.35
371 0.34
372 0.4
373 0.42
374 0.46
375 0.45
376 0.48
377 0.46
378 0.47
379 0.49
380 0.47
381 0.44
382 0.39
383 0.42
384 0.45
385 0.48
386 0.46
387 0.45
388 0.48
389 0.49
390 0.46
391 0.47
392 0.45
393 0.39
394 0.36
395 0.32
396 0.26
397 0.26
398 0.25
399 0.18
400 0.14
401 0.15
402 0.14
403 0.14
404 0.15
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.22
409 0.26
410 0.28
411 0.32
412 0.34
413 0.32
414 0.34
415 0.37
416 0.35
417 0.3
418 0.28
419 0.23
420 0.18
421 0.18
422 0.15
423 0.11
424 0.08
425 0.08
426 0.1
427 0.15
428 0.23
429 0.29
430 0.34
431 0.41
432 0.48
433 0.58
434 0.66
435 0.72
436 0.71
437 0.71
438 0.74
439 0.68
440 0.66
441 0.65
442 0.61
443 0.54
444 0.56
445 0.6
446 0.61
447 0.67
448 0.68
449 0.68
450 0.66
451 0.68
452 0.64
453 0.64
454 0.61
455 0.57
456 0.5
457 0.43
458 0.4
459 0.35
460 0.29
461 0.21
462 0.16
463 0.17
464 0.22
465 0.28
466 0.31
467 0.34
468 0.41
469 0.5
470 0.57
471 0.63
472 0.64
473 0.68
474 0.73
475 0.79
476 0.82
477 0.8
478 0.82
479 0.79
480 0.82
481 0.79
482 0.79
483 0.78
484 0.77
485 0.8
486 0.75
487 0.77
488 0.7
489 0.65
490 0.58
491 0.5
492 0.44
493 0.41
494 0.38
495 0.29
496 0.27
497 0.24
498 0.25
499 0.32
500 0.33
501 0.29
502 0.31
503 0.42
504 0.5
505 0.59
506 0.68
507 0.67
508 0.7
509 0.78
510 0.84
511 0.83
512 0.77
513 0.74
514 0.7
515 0.71
516 0.66