Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0J8S3E6

Protein Details
Accession A0A0J8S3E6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-172LNQYLPKKKVKKLRNLLDAKNHydrophilic
566-601ESTSSVRAEKRMKLKRRRRRRRKRNRMVVQPTRGTSBasic
603-622HLRLPPQRPHPLNPSRQRARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
573-591AEKRMKLKRRRRRRRKRNR
Subcellular Location(s) plas 16, nucl 4, E.R. 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008429  CLPTM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05602  CLPTM1  
Amino Acid Sequences MSERRPQPREESSTSLALKSELQGLTIFALSHFVIQRIFPSKQAANASGGRSGIASWADRPDQSTIINATPYLIIPSLKKVPKDIKVLEEKNFTVGDWNENREIATEIFVPKAVQNNGTLWAHFYVALSGHQLDPSEKDYNPETAYHFVRPLNQYLPKKKVKKLRNLLDAKNETEPEEEAPKKVEFGSFYHPNVSLSLIPDSGTLNYQVMHPGVRQFVQLERTGARDASGQNGWYYPIIFVNTFWQLRGHMIELNSTVETLPIRISLNNLKNWKFSIYASVDENMKQTQRQAALGGPMPAGSDGSEFEMVKEILLDTNAYLLATTGIVSVLHMIFEGLAFKNDISHWRKKKDVVGTSLRTILANIFMQGVIFLYLLDNSEGTSWMILAGQGFGVALEAWKITKTVNVRIRRPSSGSRFAFLPYHVVFEDKHTLSETEKKTKEYDEIAFKWLYIIAVPLLIGYAIYSLVYETHKSWYSFLIETLVGSVYAYGFLMMVPSLYINYRLKSVAHMPGKALMYKFLNTFIDDLFAFTIKMPTLHRLATLRDDVIFSSGCTRVGNTKLTISESTSSVRAEKRMKLKRRRRRRRKRNRMVVQPTRGTSLHLRLPPQRPHPLNPSRQRARLGEESDGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.5
3 0.41
4 0.34
5 0.29
6 0.24
7 0.26
8 0.19
9 0.18
10 0.18
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.09
16 0.12
17 0.11
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.21
24 0.25
25 0.26
26 0.24
27 0.3
28 0.31
29 0.36
30 0.4
31 0.37
32 0.36
33 0.39
34 0.38
35 0.34
36 0.32
37 0.26
38 0.21
39 0.19
40 0.17
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.23
48 0.23
49 0.23
50 0.22
51 0.23
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.19
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.19
64 0.27
65 0.3
66 0.31
67 0.36
68 0.44
69 0.49
70 0.57
71 0.54
72 0.54
73 0.61
74 0.64
75 0.62
76 0.59
77 0.52
78 0.46
79 0.43
80 0.34
81 0.3
82 0.26
83 0.29
84 0.27
85 0.31
86 0.29
87 0.29
88 0.29
89 0.25
90 0.26
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.2
103 0.21
104 0.25
105 0.25
106 0.23
107 0.19
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.21
126 0.22
127 0.25
128 0.25
129 0.24
130 0.22
131 0.24
132 0.26
133 0.25
134 0.26
135 0.23
136 0.28
137 0.29
138 0.3
139 0.32
140 0.38
141 0.44
142 0.5
143 0.57
144 0.61
145 0.66
146 0.69
147 0.72
148 0.73
149 0.76
150 0.79
151 0.8
152 0.81
153 0.81
154 0.78
155 0.79
156 0.73
157 0.64
158 0.57
159 0.48
160 0.39
161 0.32
162 0.28
163 0.2
164 0.24
165 0.22
166 0.19
167 0.22
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.2
172 0.14
173 0.17
174 0.24
175 0.26
176 0.27
177 0.28
178 0.28
179 0.27
180 0.25
181 0.24
182 0.17
183 0.14
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.12
204 0.15
205 0.17
206 0.18
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.11
222 0.11
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.1
253 0.17
254 0.22
255 0.27
256 0.31
257 0.31
258 0.32
259 0.33
260 0.31
261 0.25
262 0.21
263 0.22
264 0.19
265 0.2
266 0.2
267 0.2
268 0.19
269 0.18
270 0.19
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.07
330 0.15
331 0.19
332 0.29
333 0.35
334 0.38
335 0.42
336 0.44
337 0.5
338 0.51
339 0.51
340 0.48
341 0.5
342 0.49
343 0.47
344 0.46
345 0.39
346 0.31
347 0.25
348 0.18
349 0.13
350 0.1
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.04
389 0.08
390 0.11
391 0.2
392 0.29
393 0.36
394 0.4
395 0.49
396 0.53
397 0.52
398 0.54
399 0.54
400 0.53
401 0.56
402 0.52
403 0.45
404 0.42
405 0.41
406 0.37
407 0.29
408 0.27
409 0.17
410 0.18
411 0.16
412 0.17
413 0.15
414 0.18
415 0.24
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.21
421 0.3
422 0.31
423 0.33
424 0.35
425 0.36
426 0.37
427 0.38
428 0.39
429 0.35
430 0.35
431 0.34
432 0.34
433 0.35
434 0.33
435 0.31
436 0.27
437 0.23
438 0.18
439 0.1
440 0.09
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.05
455 0.07
456 0.08
457 0.09
458 0.14
459 0.18
460 0.18
461 0.19
462 0.2
463 0.23
464 0.21
465 0.21
466 0.19
467 0.15
468 0.14
469 0.14
470 0.12
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.11
488 0.13
489 0.14
490 0.16
491 0.17
492 0.17
493 0.2
494 0.25
495 0.29
496 0.32
497 0.32
498 0.31
499 0.35
500 0.37
501 0.36
502 0.31
503 0.26
504 0.24
505 0.25
506 0.25
507 0.23
508 0.22
509 0.2
510 0.21
511 0.17
512 0.17
513 0.14
514 0.15
515 0.12
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.12
520 0.1
521 0.12
522 0.13
523 0.16
524 0.19
525 0.19
526 0.22
527 0.23
528 0.26
529 0.29
530 0.3
531 0.27
532 0.25
533 0.25
534 0.22
535 0.22
536 0.19
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.15
543 0.19
544 0.23
545 0.26
546 0.24
547 0.27
548 0.28
549 0.31
550 0.31
551 0.29
552 0.27
553 0.25
554 0.25
555 0.23
556 0.23
557 0.24
558 0.25
559 0.29
560 0.33
561 0.39
562 0.47
563 0.56
564 0.65
565 0.72
566 0.8
567 0.84
568 0.9
569 0.93
570 0.94
571 0.96
572 0.97
573 0.97
574 0.98
575 0.98
576 0.98
577 0.97
578 0.97
579 0.96
580 0.95
581 0.93
582 0.89
583 0.79
584 0.73
585 0.62
586 0.55
587 0.5
588 0.46
589 0.44
590 0.41
591 0.45
592 0.49
593 0.58
594 0.63
595 0.65
596 0.69
597 0.67
598 0.69
599 0.74
600 0.75
601 0.77
602 0.78
603 0.81
604 0.79
605 0.79
606 0.79
607 0.72
608 0.7
609 0.68
610 0.62