Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RTC5

Protein Details
Accession A0A0J8RTC5    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-401SYQSDKSKSKKKSGDKQSSGHydrophilic
457-479EPRSIMRWDKRHKKYVSRRNDEDBasic
530-574TVPARGQKFRHNKEQAPKAADKYRGDYEKRRKKEQELQKRQAETGHydrophilic
592-621RSVDDVRKARKLKEKRREKNARPSKKGKARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
507-515WKKSKRLGR
537-563KFRHNKEQAPKAADKYRGDYEKRRKKE
584-621TKKVKSEIRSVDDVRKARKLKEKRREKNARPSKKGKAR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012541  DBP10_C  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08147  DBP10CT  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSENEFDIAKSLFQDEADSDIDTRPRKRKAPTSLNLDVMADDNGDGDDGGSDDDAAFIAAHQASMNRKASNLKGRTVKKGGGFQAMGLNANLLKAITRKGFSVPTPIQRKTIPLVLDDQDVVGMARTGSGKTAAFVIPMIEKLKSHSTKVGSRGSNFRTGISNILVVTDVAARGIDIPILENVINYDFPSQAKIFGHRVGRTARAGRKGWSYSLVRDADAPYLLDLQLFLGRRLVMGRGQQESANFAEDVVVGGMARESIARSCEWVSKLLDEDIDIQNQREVAMKGEKLYIRTRNSASAESAKRAKDVVASDGWTMLHPLFNNEASQMEVEREKMLARIGGYKPQETIFEISDNGLGDDMDQDDVADMSMASDSELEVTFSYQSDKSKSKKKSGDKQSSGTFQNPEYFMSYTPAAHSFAEERGYGVHSGSNSNFVEASRDATMDLSRDEANRGFAEPRSIMRWDKRHKKYVSRRNDEDGSKGALLVKGESGAKIAASFRSGRFDAWKKSKRLGRMPRVGETENPGLGSTVPARGQKFRHNKEQAPKAADKYRGDYEKRRKKEQELQKRQAETGMLQFGSKGGTKKVKSEIRSVDDVRKARKLKEKRREKNARPSKKGKAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.16
7 0.18
8 0.24
9 0.28
10 0.35
11 0.4
12 0.47
13 0.53
14 0.61
15 0.68
16 0.74
17 0.79
18 0.79
19 0.8
20 0.78
21 0.74
22 0.65
23 0.56
24 0.45
25 0.35
26 0.27
27 0.18
28 0.12
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.04
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.12
50 0.15
51 0.23
52 0.27
53 0.24
54 0.26
55 0.31
56 0.39
57 0.46
58 0.46
59 0.46
60 0.52
61 0.57
62 0.64
63 0.64
64 0.61
65 0.56
66 0.59
67 0.56
68 0.53
69 0.48
70 0.41
71 0.4
72 0.36
73 0.32
74 0.24
75 0.21
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.13
83 0.16
84 0.17
85 0.18
86 0.21
87 0.25
88 0.25
89 0.33
90 0.34
91 0.4
92 0.47
93 0.48
94 0.48
95 0.45
96 0.48
97 0.42
98 0.42
99 0.33
100 0.27
101 0.3
102 0.28
103 0.28
104 0.25
105 0.21
106 0.15
107 0.14
108 0.12
109 0.08
110 0.06
111 0.04
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.13
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.11
128 0.11
129 0.15
130 0.24
131 0.25
132 0.27
133 0.31
134 0.34
135 0.39
136 0.46
137 0.5
138 0.44
139 0.45
140 0.5
141 0.48
142 0.51
143 0.46
144 0.41
145 0.36
146 0.34
147 0.33
148 0.26
149 0.23
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.1
154 0.1
155 0.08
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.09
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.18
181 0.2
182 0.24
183 0.29
184 0.27
185 0.3
186 0.3
187 0.32
188 0.33
189 0.37
190 0.38
191 0.39
192 0.4
193 0.39
194 0.42
195 0.41
196 0.38
197 0.36
198 0.33
199 0.28
200 0.34
201 0.32
202 0.26
203 0.25
204 0.25
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.14
224 0.17
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.2
230 0.18
231 0.15
232 0.12
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.06
238 0.05
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.13
252 0.13
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.14
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.18
275 0.18
276 0.19
277 0.23
278 0.28
279 0.27
280 0.31
281 0.31
282 0.32
283 0.33
284 0.32
285 0.29
286 0.29
287 0.28
288 0.27
289 0.3
290 0.25
291 0.24
292 0.23
293 0.21
294 0.17
295 0.16
296 0.16
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.1
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.13
327 0.14
328 0.2
329 0.21
330 0.21
331 0.21
332 0.21
333 0.21
334 0.17
335 0.18
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.09
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.09
370 0.09
371 0.11
372 0.15
373 0.21
374 0.26
375 0.35
376 0.41
377 0.48
378 0.56
379 0.64
380 0.7
381 0.75
382 0.81
383 0.77
384 0.76
385 0.71
386 0.67
387 0.6
388 0.52
389 0.43
390 0.33
391 0.31
392 0.27
393 0.24
394 0.21
395 0.19
396 0.17
397 0.18
398 0.17
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.12
406 0.13
407 0.14
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.12
417 0.12
418 0.17
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.14
423 0.17
424 0.15
425 0.17
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.11
436 0.13
437 0.13
438 0.15
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.16
443 0.19
444 0.18
445 0.19
446 0.2
447 0.22
448 0.26
449 0.31
450 0.41
451 0.47
452 0.57
453 0.63
454 0.7
455 0.73
456 0.79
457 0.83
458 0.84
459 0.84
460 0.83
461 0.8
462 0.77
463 0.77
464 0.68
465 0.6
466 0.53
467 0.45
468 0.36
469 0.31
470 0.25
471 0.2
472 0.19
473 0.16
474 0.13
475 0.11
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.09
484 0.11
485 0.14
486 0.14
487 0.19
488 0.2
489 0.21
490 0.28
491 0.34
492 0.41
493 0.5
494 0.57
495 0.56
496 0.64
497 0.67
498 0.68
499 0.72
500 0.73
501 0.73
502 0.74
503 0.75
504 0.73
505 0.74
506 0.66
507 0.58
508 0.53
509 0.46
510 0.37
511 0.33
512 0.26
513 0.21
514 0.19
515 0.19
516 0.14
517 0.14
518 0.16
519 0.2
520 0.23
521 0.28
522 0.33
523 0.41
524 0.5
525 0.54
526 0.62
527 0.66
528 0.71
529 0.76
530 0.81
531 0.78
532 0.75
533 0.73
534 0.69
535 0.68
536 0.67
537 0.6
538 0.56
539 0.56
540 0.57
541 0.58
542 0.62
543 0.66
544 0.7
545 0.74
546 0.78
547 0.77
548 0.79
549 0.83
550 0.84
551 0.84
552 0.85
553 0.87
554 0.85
555 0.81
556 0.72
557 0.64
558 0.55
559 0.46
560 0.41
561 0.37
562 0.29
563 0.25
564 0.24
565 0.22
566 0.22
567 0.22
568 0.19
569 0.21
570 0.3
571 0.32
572 0.38
573 0.48
574 0.53
575 0.54
576 0.61
577 0.62
578 0.6
579 0.65
580 0.64
581 0.63
582 0.63
583 0.65
584 0.62
585 0.62
586 0.6
587 0.61
588 0.67
589 0.7
590 0.73
591 0.78
592 0.83
593 0.84
594 0.91
595 0.94
596 0.93
597 0.94
598 0.94
599 0.94
600 0.92
601 0.91