Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RT09

Protein Details
Accession A0A0J8RT09    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32DMARLTFVRRRNNNNTPRGWHydrophilic
367-386KQQDKQAGKRGRPPQPKAADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
371-383KQAGKRGRPPQPK
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 13.333, cyto_nucl 2.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MTPPGNPIARIMDMARLTFVRRRNNNNTPRGWMQSANAITRKDTGPASQQNGAGHGRKPAVSPKSLTSKESNTPDMHAHDRLVFLMTAFIGSTATITTKNGENFSGIFSGSRTEPNETSFVLKMTRRASTDPDSIRPNGTSHQASPYLGSGPDHKMIFDAQDVADFAVAGVSTAGMGVKEQNGSSFRTDTDISGNQPGRERELQRWEPGPDAVVEMSLEGSASTGTWDQFETNARLFGATSSYDENLYTTRIDRNDPSYKQREAEAARIAREIESSETDNPHVREERGFVNPKDDIGEEEKYSGVRRDDFPPLQTGGPNKYTPPARRPPMGHPTVPGAPVDPAIISAQVAQPKTAQPKPGPRETEAKQQDKQAGKRGRPPQPKAADATKPADFPKPASTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.21
4 0.23
5 0.27
6 0.33
7 0.37
8 0.44
9 0.54
10 0.61
11 0.71
12 0.77
13 0.81
14 0.78
15 0.75
16 0.72
17 0.68
18 0.62
19 0.53
20 0.45
21 0.44
22 0.44
23 0.43
24 0.42
25 0.37
26 0.35
27 0.36
28 0.35
29 0.3
30 0.28
31 0.25
32 0.29
33 0.36
34 0.4
35 0.4
36 0.42
37 0.39
38 0.41
39 0.42
40 0.37
41 0.31
42 0.31
43 0.29
44 0.27
45 0.29
46 0.34
47 0.35
48 0.35
49 0.37
50 0.38
51 0.45
52 0.46
53 0.48
54 0.44
55 0.44
56 0.48
57 0.5
58 0.49
59 0.41
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.38
64 0.32
65 0.29
66 0.25
67 0.25
68 0.22
69 0.21
70 0.16
71 0.12
72 0.11
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.09
85 0.13
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.16
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.11
97 0.11
98 0.14
99 0.14
100 0.17
101 0.18
102 0.2
103 0.22
104 0.21
105 0.23
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.21
111 0.22
112 0.25
113 0.24
114 0.26
115 0.3
116 0.32
117 0.39
118 0.37
119 0.38
120 0.38
121 0.37
122 0.37
123 0.32
124 0.28
125 0.22
126 0.24
127 0.22
128 0.2
129 0.22
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.16
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.18
140 0.17
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.12
146 0.11
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.03
162 0.02
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.07
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.12
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.2
181 0.21
182 0.19
183 0.22
184 0.22
185 0.22
186 0.25
187 0.26
188 0.26
189 0.34
190 0.35
191 0.35
192 0.37
193 0.34
194 0.3
195 0.28
196 0.23
197 0.14
198 0.13
199 0.1
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.13
239 0.16
240 0.18
241 0.24
242 0.31
243 0.34
244 0.4
245 0.42
246 0.43
247 0.42
248 0.41
249 0.4
250 0.35
251 0.36
252 0.35
253 0.32
254 0.3
255 0.3
256 0.29
257 0.23
258 0.21
259 0.17
260 0.12
261 0.12
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.22
267 0.21
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.23
273 0.25
274 0.28
275 0.34
276 0.3
277 0.32
278 0.31
279 0.3
280 0.3
281 0.26
282 0.21
283 0.2
284 0.22
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.18
292 0.18
293 0.21
294 0.25
295 0.33
296 0.34
297 0.34
298 0.34
299 0.33
300 0.31
301 0.31
302 0.3
303 0.27
304 0.29
305 0.29
306 0.26
307 0.3
308 0.36
309 0.4
310 0.45
311 0.5
312 0.51
313 0.57
314 0.6
315 0.63
316 0.66
317 0.65
318 0.58
319 0.5
320 0.5
321 0.46
322 0.43
323 0.34
324 0.25
325 0.2
326 0.19
327 0.17
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.09
334 0.12
335 0.16
336 0.16
337 0.16
338 0.18
339 0.23
340 0.31
341 0.34
342 0.38
343 0.41
344 0.51
345 0.58
346 0.65
347 0.64
348 0.6
349 0.64
350 0.61
351 0.65
352 0.64
353 0.64
354 0.58
355 0.59
356 0.64
357 0.64
358 0.66
359 0.65
360 0.65
361 0.64
362 0.71
363 0.74
364 0.77
365 0.79
366 0.8
367 0.8
368 0.78
369 0.77
370 0.73
371 0.71
372 0.68
373 0.63
374 0.61
375 0.53
376 0.49
377 0.47
378 0.47
379 0.41
380 0.37