Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0J8U8E6

Protein Details
Accession A0A0J8U8E6    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-55QGTAPEQPLKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRKYPLDTTAPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-46LKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRK
69-107KRGRGRPRKSDSLPPKPVAAPGPEQGPEATPRRGRPRKE
128-136KRGRGRPKK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MVQGTAPEQPLKRKRGRPRKEGGPAKPKPVVLDHTGQPRKRGRPRKYPLDTTAPPAAKPQNVSDDNLQKRGRGRPRKSDSLPPKPVAAPGPEQGPEATPRRGRPRKEHGAQPAEVVPDVAAQTVMQSKRGRGRPKKSEGTIMTEEATQPVKAPSALGRGRPKKLSTATSGSANGLAQQSSASSASNPLAKMVVGKGTMLLAADKESLEKLYNKMSKGENRSLYGTFGSNENDGDDGDEGRTFKKRKTSAASSKRLYMFWRGRQTGEGEIYSGRNNGHLDFSESKKIVRFNGVGGFPAMGNECKFSGVKRSDEVSVPPQPWSDFSERAAAEASAARWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.79
3 0.87
4 0.86
5 0.87
6 0.88
7 0.9
8 0.9
9 0.89
10 0.89
11 0.84
12 0.81
13 0.76
14 0.67
15 0.59
16 0.54
17 0.49
18 0.43
19 0.43
20 0.41
21 0.47
22 0.54
23 0.53
24 0.55
25 0.59
26 0.64
27 0.69
28 0.75
29 0.74
30 0.77
31 0.85
32 0.88
33 0.88
34 0.86
35 0.81
36 0.8
37 0.73
38 0.67
39 0.66
40 0.56
41 0.47
42 0.45
43 0.43
44 0.36
45 0.37
46 0.34
47 0.35
48 0.36
49 0.39
50 0.4
51 0.45
52 0.46
53 0.51
54 0.48
55 0.42
56 0.45
57 0.52
58 0.55
59 0.57
60 0.61
61 0.64
62 0.72
63 0.79
64 0.79
65 0.8
66 0.79
67 0.79
68 0.78
69 0.69
70 0.64
71 0.54
72 0.53
73 0.45
74 0.38
75 0.3
76 0.24
77 0.26
78 0.23
79 0.23
80 0.21
81 0.19
82 0.2
83 0.21
84 0.25
85 0.26
86 0.31
87 0.41
88 0.49
89 0.53
90 0.58
91 0.65
92 0.7
93 0.72
94 0.74
95 0.72
96 0.71
97 0.65
98 0.57
99 0.49
100 0.39
101 0.33
102 0.25
103 0.15
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.05
108 0.04
109 0.05
110 0.11
111 0.11
112 0.15
113 0.16
114 0.19
115 0.28
116 0.35
117 0.45
118 0.49
119 0.59
120 0.64
121 0.71
122 0.76
123 0.7
124 0.71
125 0.63
126 0.6
127 0.52
128 0.43
129 0.35
130 0.28
131 0.26
132 0.19
133 0.17
134 0.1
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.15
142 0.16
143 0.22
144 0.3
145 0.35
146 0.38
147 0.41
148 0.4
149 0.38
150 0.4
151 0.38
152 0.33
153 0.32
154 0.31
155 0.29
156 0.29
157 0.24
158 0.2
159 0.17
160 0.14
161 0.1
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.19
198 0.22
199 0.23
200 0.26
201 0.3
202 0.36
203 0.41
204 0.47
205 0.42
206 0.41
207 0.43
208 0.4
209 0.36
210 0.3
211 0.24
212 0.17
213 0.15
214 0.15
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.17
228 0.18
229 0.2
230 0.29
231 0.33
232 0.39
233 0.47
234 0.56
235 0.6
236 0.69
237 0.74
238 0.67
239 0.7
240 0.65
241 0.57
242 0.5
243 0.48
244 0.46
245 0.47
246 0.54
247 0.49
248 0.48
249 0.49
250 0.49
251 0.44
252 0.39
253 0.31
254 0.22
255 0.22
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.21
266 0.24
267 0.27
268 0.33
269 0.32
270 0.32
271 0.33
272 0.35
273 0.32
274 0.34
275 0.32
276 0.27
277 0.33
278 0.32
279 0.29
280 0.27
281 0.25
282 0.18
283 0.18
284 0.17
285 0.12
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.24
293 0.27
294 0.3
295 0.32
296 0.34
297 0.35
298 0.37
299 0.4
300 0.38
301 0.4
302 0.37
303 0.35
304 0.34
305 0.32
306 0.32
307 0.34
308 0.33
309 0.29
310 0.3
311 0.36
312 0.33
313 0.33
314 0.33
315 0.26
316 0.21
317 0.21