FuNGI

A0A0J8S1K0

Protein Details

Accession

A0A0J8S1K0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
327-347	GGTPIRKKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
427-454	GGWQDRGKQAKRKGAKGKRGKNGNEVAG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-119	RKGKGKMK
332-337	RKKKRK
432-448	RGKQAKRKGAKGKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKRGWIDKKTATTYQLFHRSQNDPLIHDPEADDRVLHQVSGPSHPPNGPRATRHLGDLEREFAQSGARKNEGEAANYGIFYDDSEYDYMQHLRELGKGGGEAHFIEASARKGKGKMKKLEDALAESGLEGDFDGLSLRDASSTYGGDDMLSTASSYVRKPTYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAFVDEEGEEDVFDALVEGGIDAEVDPDEWRDTYIEDDDEGWDSDATEKAPVQPMSSSTSHKKDDSKAYTTSQTESELPSHDAPIPDATNDDGDWLKNFAKYKKDMKSRPSPTDASENASELRTTASTLFTVGGTPIRKKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGLRLLDDRFERVEALYALDEGEEYEGSSMADDVSIMSGMSKYSQTPSMVSQSGNVPMREDFDSVMDEFLGGWQDRGKQAKRKGAKGKRGKNGNEVAGMRMLDEIRQGLGPAKVSGRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.56
3	0.55
4	0.57
5	0.51
6	0.49
7	0.51
8	0.5
9	0.5
10	0.55
11	0.48
12	0.42
13	0.45
14	0.45
15	0.39
16	0.37
17	0.33
18	0.29
19	0.29
20	0.25
21	0.2
22	0.16
23	0.21
24	0.2
25	0.19
26	0.16
27	0.18
28	0.21
29	0.26
30	0.29
31	0.26
32	0.29
33	0.32
34	0.33
35	0.36
36	0.42
37	0.41
38	0.42
39	0.47
40	0.51
41	0.49
42	0.49
43	0.48
44	0.43
45	0.43
46	0.42
47	0.37
48	0.31
49	0.31
50	0.28
51	0.21
52	0.23
53	0.22
54	0.25
55	0.27
56	0.28
57	0.28
58	0.28
59	0.36
60	0.33
61	0.31
62	0.27
63	0.26
64	0.24
65	0.24
66	0.23
67	0.16
68	0.14
69	0.12
70	0.13
71	0.09
72	0.1
73	0.11
74	0.11
75	0.12
76	0.15
77	0.16
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.15
83	0.17
84	0.15
85	0.14
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.15
90	0.13
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.11
95	0.12
96	0.14
97	0.17
98	0.18
99	0.18
100	0.23
101	0.31
102	0.39
103	0.47
104	0.53
105	0.55
106	0.62
107	0.63
108	0.64
109	0.58
110	0.53
111	0.45
112	0.36
113	0.29
114	0.21
115	0.18
116	0.12
117	0.1
118	0.06
119	0.04
120	0.04
121	0.04
122	0.04
123	0.04
124	0.05
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.06
129	0.07
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.05
140	0.05
141	0.05
142	0.06
143	0.08
144	0.08
145	0.13
146	0.14
147	0.15
148	0.18
149	0.25
150	0.34
151	0.38
152	0.42
153	0.39
154	0.41
155	0.43
156	0.4
157	0.33
158	0.24
159	0.19
160	0.15
161	0.13
162	0.09
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.08
168	0.09
169	0.08
170	0.09
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.06
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.02
200	0.02
201	0.02
202	0.02
203	0.02
204	0.02
205	0.02
206	0.03
207	0.03
208	0.04
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.12
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.13
236	0.17
237	0.18
238	0.21
239	0.21
240	0.26
241	0.27
242	0.29
243	0.31
244	0.32
245	0.39
246	0.41
247	0.4
248	0.38
249	0.38
250	0.41
251	0.38
252	0.35
253	0.26
254	0.23
255	0.2
256	0.18
257	0.17
258	0.14
259	0.16
260	0.15
261	0.15
262	0.15
263	0.14
264	0.14
265	0.15
266	0.13
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.1
277	0.1
278	0.12
279	0.16
280	0.18
281	0.24
282	0.29
283	0.37
284	0.44
285	0.53
286	0.56
287	0.61
288	0.68
289	0.7
290	0.71
291	0.68
292	0.61
293	0.54
294	0.55
295	0.48
296	0.42
297	0.35
298	0.3
299	0.25
300	0.23
301	0.2
302	0.13
303	0.13
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.11
315	0.13
316	0.18
317	0.26
318	0.36
319	0.43
320	0.47
321	0.56
322	0.63
323	0.71
324	0.76
325	0.79
326	0.79
327	0.81
328	0.82
329	0.73
330	0.65
331	0.55
332	0.45
333	0.36
334	0.25
335	0.18
336	0.14
337	0.14
338	0.12
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.13
344	0.14
345	0.15
346	0.15
347	0.15
348	0.17
349	0.21
350	0.21
351	0.2
352	0.18
353	0.18
354	0.17
355	0.17
356	0.17
357	0.13
358	0.14
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.06
365	0.07
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.07
384	0.08
385	0.09
386	0.11
387	0.16
388	0.16
389	0.18
390	0.21
391	0.26
392	0.26
393	0.25
394	0.25
395	0.23
396	0.3
397	0.32
398	0.29
399	0.25
400	0.24
401	0.27
402	0.27
403	0.25
404	0.19
405	0.16
406	0.18
407	0.17
408	0.16
409	0.13
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.1
415	0.1
416	0.12
417	0.16
418	0.22
419	0.3
420	0.36
421	0.42
422	0.51
423	0.61
424	0.67
425	0.73
426	0.79
427	0.81
428	0.85
429	0.87
430	0.88
431	0.88
432	0.9
433	0.85
434	0.83
435	0.81
436	0.74
437	0.7
438	0.61
439	0.53
440	0.46
441	0.41
442	0.31
443	0.26
444	0.22
445	0.15
446	0.16
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.13
451	0.15
452	0.17
453	0.18
454	0.19

A0A0J8S1K0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer