Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0J8RHD8

Protein Details
Accession A0A0J8RHD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-141QVDERMEKRRKLRREARERQEREEYEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-132KRRKLRREAR
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 7.5, cyto_mito 7, mito 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAALLGTAPPTAYGASARGEKGGAKQREEEDDDDERFQDPENEVGLFAYGQYDREDDEADQIYQQVDERMEKRRKLRREARERQEREEYEQNNPKIQQQFADLKRSLATVTDEDWANIPEVGDLTGKNRRARQNLRQRFYAVPDSVIASARDSAEFTTTVAEDGTQTSIRSGEGGDGTITNFADIGAARDKVLQARLDRAAQSSTGDAASGNATNIDPKGYLTSLSKSELKAGEVEIGDIKRVRVLLESVTKTNPRHAPGWIALARLEEIAGKIVAARNYIAKGCELCPKSEDVWLENIRMNDNHNAKIIAANAIKHNDRSTRLWIEAMKLESDPRAKKNVLRQAILHIPQSVAIWKEAVNLEEDPADARLLLAKATEMIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSHEVWIAAARLQEQMGTANKVNVMKRAVQALARESAMPKREEWIGEAENCEEEGAVLTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDAKSSISRGKYETARAIYAYALRVFVNRKSIWLAAADLERAHGTKESLWQLLESAVEACPQSEVLWMQLAKEKWQAGEIDNARRVLAKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.31
3 0.28
4 0.25
5 0.19
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.07
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.2
19 0.23
20 0.24
21 0.29
22 0.3
23 0.28
24 0.32
25 0.33
26 0.32
27 0.37
28 0.36
29 0.31
30 0.31
31 0.29
32 0.26
33 0.31
34 0.31
35 0.26
36 0.25
37 0.24
38 0.22
39 0.24
40 0.22
41 0.16
42 0.14
43 0.14
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.14
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.24
60 0.32
61 0.35
62 0.34
63 0.39
64 0.42
65 0.48
66 0.5
67 0.44
68 0.4
69 0.4
70 0.39
71 0.36
72 0.33
73 0.27
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.15
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.12
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.16
106 0.19
107 0.28
108 0.36
109 0.41
110 0.5
111 0.57
112 0.64
113 0.7
114 0.78
115 0.79
116 0.83
117 0.87
118 0.89
119 0.9
120 0.86
121 0.82
122 0.81
123 0.72
124 0.68
125 0.66
126 0.58
127 0.56
128 0.61
129 0.56
130 0.51
131 0.5
132 0.49
133 0.44
134 0.43
135 0.34
136 0.32
137 0.39
138 0.38
139 0.45
140 0.39
141 0.36
142 0.35
143 0.34
144 0.28
145 0.2
146 0.2
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.11
163 0.17
164 0.22
165 0.26
166 0.33
167 0.39
168 0.48
169 0.57
170 0.64
171 0.69
172 0.75
173 0.75
174 0.71
175 0.67
176 0.6
177 0.56
178 0.53
179 0.42
180 0.32
181 0.28
182 0.27
183 0.24
184 0.23
185 0.18
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.19
239 0.16
240 0.16
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.08
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.15
264 0.17
265 0.15
266 0.19
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.13
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.2
289 0.23
290 0.23
291 0.28
292 0.28
293 0.25
294 0.25
295 0.24
296 0.26
297 0.23
298 0.29
299 0.23
300 0.2
301 0.18
302 0.17
303 0.16
304 0.13
305 0.12
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.18
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.2
328 0.2
329 0.22
330 0.21
331 0.15
332 0.2
333 0.2
334 0.21
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.19
341 0.21
342 0.21
343 0.19
344 0.19
345 0.18
346 0.19
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.13
351 0.14
352 0.17
353 0.18
354 0.18
355 0.19
356 0.18
357 0.2
358 0.22
359 0.26
360 0.26
361 0.27
362 0.28
363 0.26
364 0.25
365 0.25
366 0.23
367 0.18
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.21
372 0.22
373 0.21
374 0.26
375 0.26
376 0.3
377 0.39
378 0.45
379 0.44
380 0.42
381 0.4
382 0.4
383 0.45
384 0.43
385 0.35
386 0.26
387 0.22
388 0.21
389 0.2
390 0.17
391 0.11
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.06
407 0.05
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.09
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.09
434 0.15
435 0.16
436 0.17
437 0.16
438 0.15
439 0.18
440 0.25
441 0.28
442 0.24
443 0.25
444 0.27
445 0.29
446 0.3
447 0.28
448 0.23
449 0.22
450 0.25
451 0.25
452 0.23
453 0.22
454 0.21
455 0.2
456 0.19
457 0.16
458 0.13
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.12
465 0.13
466 0.16
467 0.16
468 0.16
469 0.19
470 0.23
471 0.23
472 0.24
473 0.25
474 0.25
475 0.26
476 0.28
477 0.27
478 0.25
479 0.26
480 0.25
481 0.25
482 0.22
483 0.21
484 0.2
485 0.23
486 0.25
487 0.24
488 0.22
489 0.22
490 0.24
491 0.24
492 0.24
493 0.25
494 0.24
495 0.24
496 0.25
497 0.23
498 0.21
499 0.2
500 0.18
501 0.11
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.05
512 0.04
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.13
525 0.13
526 0.13
527 0.14
528 0.14
529 0.13
530 0.15
531 0.21
532 0.22
533 0.22
534 0.24
535 0.24
536 0.24
537 0.25
538 0.26
539 0.21
540 0.22
541 0.23
542 0.28
543 0.31
544 0.36
545 0.42
546 0.4
547 0.39
548 0.37
549 0.35
550 0.3
551 0.28
552 0.26
553 0.19
554 0.17
555 0.16
556 0.19
557 0.21
558 0.23
559 0.28
560 0.26
561 0.27
562 0.3
563 0.31
564 0.28
565 0.26
566 0.24
567 0.2
568 0.21
569 0.2
570 0.16
571 0.16
572 0.16
573 0.15
574 0.15
575 0.13
576 0.13
577 0.15
578 0.22
579 0.25
580 0.26
581 0.26
582 0.25
583 0.24
584 0.23
585 0.21
586 0.15
587 0.11
588 0.1
589 0.11
590 0.11
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.09
595 0.11
596 0.12
597 0.12
598 0.17
599 0.17
600 0.18
601 0.24
602 0.25
603 0.26
604 0.31
605 0.31
606 0.26
607 0.3
608 0.3
609 0.26
610 0.35
611 0.37
612 0.4
613 0.42
614 0.42
615 0.39
616 0.39